Panel genetic pan-cancer pentru predispoziție ereditară, 62 de gene

Pe scurt

Panelul pan-cancer analizează 62 de gene asociate cu predispoziția ereditară pentru mai multe tipuri de cancer: sân, ovar, colon, endometru, stomac, pancreas, prostată, rinichi, piele și glande endocrine. Se adresează persoanelor cu cancer sau cu un istoric familial care sugerează o cauză moștenită, mai ales când în familie apar tipuri diferite de cancer. Testul se alege la consultația de genetică medicală.

Ce analizează

Testul caută variantele moștenite (germinale), prezente în toate celulele corpului de la naștere. Citește porțiunile genelor care conțin instrucțiunile pentru proteine (regiunile codante), prin secvențiere de nouă generație (NGS). Caută schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme), mici fragmente în plus sau lipsă (inserții și deleții) și porțiuni mai mari lipsă sau în plus (deleții și duplicații).

Genele acoperă principalele sindroame de cancer ereditar: cancerul ereditar de sân și ovar (BRCA1, BRCA2, PALB2), sindromul Lynch, polipozele, sindroamele Li-Fraumeni, Cowden și Peutz-Jeghers, cancerul gastric difuz ereditar, melanomul familial, neoplaziile endocrine multiple, boala von Hippel-Lindau și paragangliomul ereditar. Panelul include și gene pentru două boli recesive rare: anemia Fanconi, o boală a măduvei osoase, și xeroderma pigmentosum, o sensibilitate extremă a pielii la soare.

Pentru cine este

• cancer diagnosticat la o vârstă mai mică decât de obicei sau mai multe cancere primare;
• mai multe rude cu cancer pe aceeași parte a familiei, mai ales cu tipuri diferite;
• cancer rar: cancer de sân la bărbat, carcinom medular tiroidian, paragangliom sau feocromocitom;
• persoană sănătoasă cu istoric familial sugestiv, când rudele bolnave nu mai pot fi testate și nu există ADN păstrat de la ele.

Conform National Cancer Institute, testarea începe, când este posibil, cu o rudă care a avut cancer. Dacă în familie se cunoaște deja o variantă, de obicei se testează țintit doar acea variantă.

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv: o variantă care cauzează sau probabil cauzează boala (patogenă sau probabil patogenă) și crește riscul pentru anumite cancere: risc, nu certitudine. Rezultatul poate deschide un plan de supraveghere și prevenție adaptat genei, poate influența tratamentul, pentru că unele forme au un tratament țintit, și permite testarea țintită a rudelor de gradul I, care au fiecare o șansă de 50% să fi moștenit varianta.
• O singură variantă într-o genă recesivă (de exemplu FANCA sau XPC): de obicei statutul de purtător, care contează pentru planificarea familiei. Potrivit GeneReviews, purtătorii unei singure variante MUTYH au un risc doar ușor crescut de cancer colorectal.
• Negativ: dacă în familie e cunoscută o variantă și tu nu o ai, riscul tău e apropiat de cel al populației generale; altfel, istoricul familial poate păstra riscul crescut. Dacă suspiciunea de cancer ereditar rămâne, în practica noastră discutăm la consultație secvențierea întregului genom (WGS).
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o modificare despre care nu se știe încă dacă crește riscul. Nu schimbă îngrijirea, iar cele mai multe se dovedesc, în timp, fără efect (benigne).

Ce nu poate detecta

• modificările apărute doar în tumoră, care se analizează pe țesut tumoral sau prin biopsie lichidă;
• sindroamele rare ale căror gene nu sunt în panel;
• unele regiuni greu de citit, ca porțiunile repetitive sau pseudogenele;
• variantele mici din EPCAM și GREM1 (la ele se caută doar deleții și duplicații) și delețiile sau duplicațiile din HOXB13;
• modificările prezente doar într-o mică parte dintre celule (mozaicism de nivel scăzut);
• riscul adunat din multe variante comune (polimorfismele) și din factorii de mediu; testul nu spune dacă și când va apărea un cancer.

Cum se face

Proba este un frotiu bucal (de pe interiorul obrazului), recoltat de medic după instrucțiunile din kit. Rezultatul vine, de obicei, în 10–15 zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Prețul include consultația de genetică medicală dinainte de test, interpretarea rezultatului și consultația de după, în care discutăm controalele recomandate și testarea rudelor.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) cu îmbogățire țintită prin captură, pe toate regiunile codante ale genelor și pe secvențele necodante adiacente
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV); mici inserții și deleții (indeli), de până la 50 de perechi de baze; deleții și duplicații (CNV); cele pozitive se confirmă printr-o metodă independentă
• Gene (62): caută în lista genelor
• Probă: frotiu bucal (recoltat de medic după instrucțiunile primite)
• Durată: 10–15 zile lucrătoare

Context clinic

• Tratament: de exemplu, inhibitorii PARP la purtătorii unor variante BRCA1 sau BRCA2, în indicațiile aprobate; decizia aparține oncologului.