Panel genetic pentru hipertensiune pulmonară, 11 gene

Pe scurt

Panelul caută cauza genetică a hipertensiunii pulmonare, adică a tensiunii arteriale crescute din arterele plămânilor și din partea dreaptă a inimii. Analizează 11 gene, între care BMPR2. Este pentru persoanele cu hipertensiune arterială pulmonară (HAP) fără o cauză găsită, cu rude afectate sau cu una dintre formele rare ale bolii, și pentru familiile lor.

Ce analizează

Un panel genetic analizează deodată mai multe gene care pot cauza aceleași semne sau aceeași problemă de sănătate. Secvențierea de nouă generație (NGS) citește în paralel ADN-ul acestor gene, mai ales porțiunile care conțin instrucțiunile pentru proteine (exonii). Testul caută variantele cu care persoana s-a născut, fie moștenite, fie apărute pentru prima dată la ea. Fiecare variantă se clasifică după criterii internaționale, de la fără efect (benignă) la cauzatoare de boală (patogenă), și se interpretează împreună cu istoricul personal și al familiei.

Testul analizează 11 gene.

Ce raportează:

• schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme, SNV)
• mici fragmente de ADN în plus sau lipsă (inserții și deleții, indeli), de până la 30 de „litere” (perechi de baze)
• fragmente de ADN lipsă sau în plus (deleții și duplicații, CNV); cele găsite se confirmă printr-o metodă independentă

Pentru cine este

Conform ghidului ESC/ERS din 2022, se recomandă ca persoanele cu formele de mai jos să fie informate că boala poate avea o cauză genetică; testarea genetică este precedată de consiliere genetică.

• Persoană diagnosticată cu HAP fără o cauză găsită (HAP idiopatică).
• Persoană cu HAP care are și alte rude cu boala (HAP familială).
• Persoană la care HAP a apărut după tratament cu medicamente care reduc pofta de mâncare (anorexigene).
• Persoană cu boală veno-ocluzivă pulmonară sau hemangiomatoză capilară pulmonară, forme rare în care sunt afectate venele mici sau capilarele plămânilor.

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv: o variantă care cauzează boala (patogenă) confirmă forma moștenită a bolii și arată ce rude pot face un test țintit. Gena găsită poate susține și un anumit diagnostic: variantele în ambele copii ale genei EIF2AK4 sunt asociate cu boala veno-ocluzivă pulmonară.
• Negativ: în genele analizate nu s-a găsit o variantă care să explice boala. Rezultatul nu schimbă diagnosticul de HAP și nu exclude o cauză genetică în alte gene. Dacă suspiciunea de cauză genetică rămâne, pasul următor pe care îl discutăm de obicei la consultație este secvențierea întregului genom (WGS).
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o modificare despre care nu se știe încă dacă are vreun efect. Până se lămurește, nu se folosește pentru decizii medicale și nici pentru testarea rudelor; uneori o lămurește testarea altor membri afectați ai familiei.

Ce nu poate detecta

• Testul nu detectează toate modificările genetice din genele analizate.
• Unele regiuni pot fi citite incomplet: secvențele repetitive, regiunile foarte asemănătoare cu alte porțiuni ale genomului (omologie mare: duplicații segmentare, pseudogene) și cele cu o proporție foarte mare sau foarte mică de „litere” G și C (conținut GC extrem).
• O modificare prezentă doar într-un procent mic de celule (mozaicism) poate să nu fie detectată.
• Statutul de purtător pentru bolile recesive nu se raportează.
• Variantele de semnificație incertă, despre care nu se știe încă dacă au vreun efect, se raportează doar când există argumente că ar putea cauza boala.
• Un rezultat negativ nu exclude variante cauzatoare de boală (patogene) în regiunile pe care testul nu le analizează sau pe care le citește insuficient.

Ca orice panel, testul nu poate arăta:

• variantele din genele care nu sunt incluse în panel și cauzele genetice încă necunoscute;
• modificările apărute în timpul vieții doar într-un țesut, de exemplu într-o tumoră (variante somatice);
• de obicei, dacă și când vor apărea semnele sau cât de severe vor fi: aceeași variantă se poate manifesta diferit în aceeași familie.

Cum se face

Proba este un frotiu bucal (de pe interiorul obrazului), recoltat de medic după instrucțiunile primite. Rezultatul este gata în aproximativ 10–20 de zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) după îmbogățirea regiunilor de interes prin hibridizare în soluție (captură țintită); vizează toți exonii codanți (transcripte MANE și/sau canonice) și 10 perechi de baze din intronii adiacenți
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV); mici inserții și deleții (indeli), de până la 30 de perechi de baze; deleții și duplicații (CNV); cele pozitive se confirmă printr-o metodă independentă
• Gene (11)

  • ACVRL1
  • BMPR1B
  • BMPR2
  • CAV1
  • EIF2AK4
  • ENG
  • KCNA5
  • KCNK3
  • SMAD4
  • SMAD9
  • TBX4
• Probă: frotiu bucal (recoltat de medic după instrucțiunile primite)
• Durată: 10–20 de zile lucrătoare

Context clinic

• Conform ghidului ESC/ERS din 2022, într-unul dintre cele mai mari studii de până acum, TBX4, ACVRL1 (ALK1) și ENG au fost printre primele șase descoperiri genetice la adulții diagnosticați anterior cu HAP idiopatică; toate trei sunt în panel.
• EIF2AK4 (transmitere autozomal recesivă) este asociată cu boala veno-ocluzivă pulmonară și hemangiomatoza capilară pulmonară; ghidul notează ca semne distinctive hipocratismul digital, DLCO redusă și, la CT, îngroșarea septurilor interlobulare, adenopatiile mediastinale și opacitățile centrilobulare în sticlă mată.
• Pentru rudele asimptomatice purtătoare de variante BMPR2, ghidul notează că nu există încă o strategie de screening acceptată; li se oferă adesea ecocardiografie anuală, iar datele recente susțin o abordare multimodală.