Panel genetic pentru neutropenia ereditară, 35 de gene

Pe scurt

Panelul caută în 35 de gene cauza unei scăderi moștenite a neutrofilelor (neutropenie ereditară) și analizează inclusiv fragmentele de ADN lipsă sau în plus (deleții și duplicații). Neutrofilele sunt globulele albe care opresc primele bacteriile; când sunt prea puține, infecțiile sunt frecvente și pot fi grave. Testul se adresează sugarilor și copiilor cu neutrofile foarte scăzute în mod repetat, celor la care scăderea revine periodic (forme ciclice) și celor la care neutropenia apare împreună cu semne în alte organe.

Ce analizează

Neutrofilele se formează în măduva osoasă și trăiesc doar câteva zile, așa că măduva le produce continuu. O genă care nu funcționează poate opri maturarea lor, le poate scurta viața sau le poate împiedica să iasă din măduvă în sânge.

Testul citește exomul (porțiunile genelor care conțin instrucțiunile pentru proteine) și analizează țintit 35 de gene, în care caută variante și fragmente de ADN lipsă sau în plus (deleții și duplicații, CNV). Genele acoperă:

• neutropenia congenitală severă și ciclică (ELANE, HAX1, G6PC3, GFI1, JAGN1, VPS45, CSF3R, CLPB);
• sindromul Shwachman-Diamond (SBDS, EFL1, SRP54);
• sindromul WHIM (CXCR4) și deficitul GATA2;
• formele cu albinism parțial, ca sindroamele Chediak-Higashi și Griscelli (LYST, RAB27A, AP3B1);
• formele sindromice: sindromul Barth (TAZ), sindromul Cohen (VPS13B), glicogenoza de tip Ib (SLC37A4), poikilodermia cu neutropenie (USB1) și neutropenia legată de cromozomul X (WAS).

Pentru cine este

• sugar cu neutrofile foarte scăzute la analize repetate și infecții bacteriene severe în primele luni;
• febră, afte în gură și gingii inflamate (gingivită), care revin cam la trei săptămâni;
• neutropenie cu diaree cu grăsimi, creștere deficitară sau probleme osoase;
• neutropenie cu păr sau piele mai deschise la culoare decât în familie;
• băiat cu neutropenie și slăbiciune a mușchiului inimii, sau copil cu neutropenie și zahăr scăzut în sânge (hipoglicemii);
• neutropenie cronică fără o cauză găsită (infecții, medicamente, anticorpi).

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv: s-a găsit o variantă care explică neutropenia, iar rezultatul confirmă tipul ei. Conform MedlinePlus, gena ELANE explică aproximativ jumătate dintre cazurile de neutropenie congenitală severă și HAX1 aproximativ 10%. Forma ELANE se moștenește dominant, HAX1 și multe altele recesiv, iar unele forme sunt legate de cromozomul X. Tipul genetic arată ce controale sunt necesare: unele forme cresc riscul unei boli a măduvei care produce celule anormale (sindrom mielodisplazic) sau de leucemie, altele afectează inima, pancreasul ori dezvoltarea.
• Negativ: nu exclude o neutropenie genetică; conform aceleiași surse, la aproximativ o treime dintre pacienți cauza nu se cunoaște încă. Dacă suspiciunea de cauză genetică rămâne, pasul următor pe care îl discutăm de obicei la consultație este secvențierea întregului genom (WGS).
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o modificare despre care nu se știe încă dacă are vreun efect. Nu se folosește singură pentru decizii; hemogramele repetate și testarea părinților pot ajuta la lămurirea ei.

Ce nu poate detecta

• neutropeniile dobândite;
• modificările apărute în timp doar în măduvă (mutații dobândite), de exemplu în CSF3R, urmărite pentru a vedea din timp trecerea spre leucemie; ele cer teste dedicate;
• unele variante asociate cu boala, pe care limitele actuale ale tehnologiei de testare și ale cunoștințelor medicale nu le pot identifica;
• variantele din genele care nu sunt printre cele 35 analizate.

Cum se face

Proba este de sânge din venă, recoltat într-un tub cu anticoagulant (EDTA sau heparină) la un punct de recoltare; laboratorul acceptă și frotiu bucal, salivă sau ADN extras. Te ajută să aduci la consultație hemogramele repetate, cu numărul absolut de neutrofile, și rezultatul examenului măduvei osoase, dacă există. Rezultatul vine, de obicei, în 43 de zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) pe bază de exom (WES), cu analiza celor 35 de gene ale panelului
• Variante raportate: variante în cele 35 de gene ale panelului; deleții și duplicații (CNV)
• Gene (35)

  • ACTB
  • AP3B1
  • CLPB
  • CSF2RA
  • CSF3R
  • CTSC
  • CXCR4
  • EFL1
  • ELANE
  • G6PC3
  • GATA1
  • GATA2
  • GFI1
  • GINS1
  • HAX1
  • IFNGR2
  • JAGN1
  • LAMTOR2
  • LYST
  • MKL1
  • PGM3
  • RAB27A
  • RAC2
  • SBDS
  • SLC37A4
  • SMARCD2
  • SRP54
  • SRP72
  • TAZ
  • USB1
  • VPS13B
  • VPS45
  • WAS
  • WDR1
  • WIPF1
• Probă: sânge recoltat pe EDTA sau heparină (se acceptă și frotiu bucal, salivă sau ADN extras)
• Durată: 43 de zile lucrătoare

Context clinic

• IFNGR2 (susceptibilitatea mendeliană la micobacterii) și CSF2RA (proteinoza alveolară pulmonară) sunt în listă, deși nu țin de neutropenie în sens strict.
• Catalogul are și panelul pentru neutropenia congenitală (HT-0379): 23 de gene, 15–20 de zile lucrătoare. Față de el, acest panel adaugă genele formelor cu albinism parțial (LYST, RAB27A, AP3B1), GATA2 și GATA1, dar nu include CEBPE, CXCR2 și DNAJC21. Alegerea se face la consultație.
• Neutropeniile dobândite, în afara testului: autoimune, după infecții virale sau după medicamente.