Profil genomic tumoral pe țesut, 521 de gene (ADN și ARN)

Pe scurt

Testul face un profil genetic amplu al tumorii, doar din blocul de parafină: citește 521 de gene din ADN-ul tumoral și analizează ARN-ul a 55 de gene, pentru fuziuni. Se adresează persoanelor cu o tumoră solidă la care se caută un tratament țintit, o imunoterapie sau un studiu clinic potrivit. Se alege împreună cu medicul oncolog și cu medicul genetician.

Ce analizează

Cele mai multe cancere apar din modificări genetice acumulate în timpul vieții, care există doar în tumoră (se numesc somatice) și nu se transmit copiilor. Testul le caută prin secvențiere de nouă generație (NGS), în două părți făcute din același țesut.

Partea pe ADN citește 521 de gene și caută schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme); în 59 dintre aceste gene măsoară și numărul de copii, pentru genele cu multe copii în plus (amplificate). Calculează și doi biomarkeri folosiți la alegerea imunoterapiei: câte mutații are tumora (încărcătura mutațională tumorală, TMB) și dacă tumora își mai corectează greșelile de copiere a ADN-ului (instabilitatea microsateliților, MSI). Partea pe ARN citește mesajele a 55 de gene, unde se văd mai sigur genele unite într-una singură (fuziuni de gene) și mesajele asamblate greșit (splicing alterat).

Pentru cine este

• tumoră solidă avansată sau răspândită în alte organe (metastatică), pentru care se caută o țintă de tratament;
• cancer avansat pentru care, conform ESMO, se recomandă profilarea prin NGS: pulmonar nescuamos fără celule mici, de prostată, colorectal, ovarian, de sân sau colangiocarcinom (cancerul căilor biliare);
• tumoră rară sau cu punct de plecare necunoscut;
• evaluare pentru imunoterapie, când oncologul are nevoie de TMB sau de MSI;
• tratamentele standard au fost deja folosite și urmează discuția despre studiile clinice.

Ce poate arăta rezultatul

• Modificări cu relevanță pentru tratament: raportul le leagă de medicamente aprobate pentru tipul tău de cancer sau pentru alte cancere, de opțiuni folosite în afara indicației aprobate (off-label) ori de studii clinice active, și notează terapiile pe care profilul tumorii le contraindică. Decizia de tratament aparține medicului oncolog.
• Biomarkeri pentru imunoterapie: un TMB ridicat sau instabilitate a microsateliților.
• Fuziuni sau splicing alterat, găsite în ARN.
• O variantă care ar putea fi moștenită: testul nu compară tumora cu ADN-ul tău normal, așa că ea se confirmă printr-un test separat pentru variantele moștenite (test germinal); rezultatul contează și pentru rude. Conform ESMO, pentru câteva gene această verificare se recomandă indiferent de tipul tumorii.
• Nicio țintă de tratament în genele analizate, sau doar variante cu semnificație incertă (VUS), care singure nu schimbă tratamentul.

Ce nu poate detecta

• variațiile numărului de copii în afara celor 59 de gene în care se măsoară;
• fuziunile și splicingul alterat din alte gene decât cele 55 citite pe ARN;
• modificările din genele sau regiunile care nu sunt incluse în test;
• uneori, modificările dintr-o probă cu prea puține celule tumorale sau cu ADN deteriorat, când rezultatul poate fi incomplet;
• modificările prezente doar în alte zone ale tumorii sau apărute după biopsie, sub tratament;
• riscul moștenit de cancer: testul nu înlocuiește un test germinal, iar lipsa unei variante moștenite din raport nu o exclude.

Cum se face

Proba este blocul de parafină (FFPE) dintr-o biopsie, inclusiv prin puncție cu ac gros, sau dintr-o operație, de preferat cu o lamă colorată (hematoxilină-eozină), dacă există; se pot trimite și 10 lame necolorate, cu secțiuni de 4–5 microni. Nu e nevoie de o probă de sânge. Medicul genetician îți cere înainte buletinul histopatologic și lista tratamentelor primite. Rezultatul vine, de obicei, în 10 zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Consultația de genetică medicală dinainte de test costă 420 de lei, se plătește după consultație și se scade din prețul testului; consultația de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) pe ADN (521 de gene) și pe ARN (55 de gene) din țesutul tumoral, cu acoperire medie de peste 1000x, sensibilitate de cel puțin 99% și specificitate de 99,99%
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV), pe ADN, în cele 521 de gene; amplificări și alte variații ale numărului de copii (CNV), măsurate în 59 de gene; încărcătura mutațională tumorală (TMB); instabilitatea microsateliților (MSI); fuziuni genice și splicing alterat, pe ARN, în 55 de gene; terapii aprobate, terapii contraindicate, opțiuni off-label și studii clinice active, potrivite profilului
• Gene (521): caută în lista genelor
• Probă: țesut tumoral fixat în formol și inclus în parafină (FFPE): un bloc tumoral (preferat), cu o lamă colorată hematoxilină-eozină dacă există, sau 10 lame necolorate de 4–5 microni; se acceptă și biopsiile prin puncție cu ac gros
• Durată: 10 zile lucrătoare

Context clinic

• Testul se face doar pe tumoră, fără probă normală, deci nu separă sigur variantele somatice de cele germinale. Variantele cu posibilă origine germinală se confirmă printr-un test germinal dedicat; conform ESMO PMWG 2023 (Kuzbari), verificarea germinală se recomandă indiferent de tipul tumorii pentru BRCA1, BRCA2, PALB2, MLH1, MSH2, MSH6 și RET.
• Față de HT-0226 și HT-0232, care compară tumora cu ADN-ul normal din sânge sau salivă, testul nu are probă normală; alegerea se face la consultație.