Panel genetic pan-cancer pentru predispoziție ereditară, 188 de gene

Pe scurt

Testul caută, în 188 de gene din nucleul celulei (gene nucleare), variantele moștenite care cresc riscul pentru mai multe tipuri de cancer (panel pan-cancer). Genele au dovezi științifice puternice de asociere cu boala, iar analiza cuprinde și porțiunile lipsă sau în plus (CNV) și varianta c.156_157insAlu din gena BRCA2. Se adresează persoanelor și familiilor la care se suspectează o predispoziție ereditară la cancer; testul se alege la consultația de genetică medicală.

Ce analizează

Un panel genetic analizează deodată mai multe gene care pot cauza aceleași semne sau aceeași problemă de sănătate. Secvențierea de nouă generație (NGS) citește în paralel ADN-ul acestor gene, mai ales porțiunile care conțin instrucțiunile pentru proteine (exonii). Testul caută variantele cu care persoana s-a născut, fie moștenite, fie apărute pentru prima dată la ea. Fiecare variantă se clasifică după criterii internaționale, de la fără efect (benignă) la cauzatoare de boală (patogenă), și se interpretează împreună cu istoricul personal și al familiei.

Testul analizează 188 de gene.

Ce raportează:

• schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme, SNV)
• mici fragmente de ADN în plus sau lipsă (inserții și deleții, indeli)
• fragmente de ADN lipsă sau în plus (variații ale numărului de copii, CNV)
• varianta c.156_157insAlu din gena BRCA2

Pentru cine este

• Persoană sau familie la care se suspectează o predispoziție moștenită pentru cancer și pentru care medicul genetician alege un panel extins (pan-cancer).

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv: s-a găsit, într-una dintre genele analizate, o variantă care cauzează sau probabil cauzează boala (patogenă sau probabil patogenă). În funcție de genă, rezultatul poate confirma diagnosticul sau poate arăta un risc crescut, nu o certitudine. Poate ajuta și la alegerea controalelor și a tratamentului.
• Negativ: în genele analizate nu s-a găsit o variantă care să explice situația. Rezultatul nu exclude o cauză genetică în alte gene sau de un tip pe care testul nu îl vede și nici o cauză negenetică. Dacă suspiciunea de cancer ereditar rămâne, în practica noastră discutăm la consultație secvențierea întregului genom (WGS).
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o modificare despre care nu se știe încă dacă are vreun efect. Până se lămurește, nu se folosește pentru decizii medicale. Uneori o lămurește testarea părinților sau a altor rude, iar cu timpul poate fi reclasificată.

Ce nu poate detecta

• Testul poate să nu dea un rezultat concludent despre variantele din genele analizate (genotip).
• Pentru unele variante găsite, nu se știe încă dacă au vreun efect (semnificație incertă).
• Unele variante legate de o boală pot rămâne neidentificate, din cauza limitelor actuale ale tehnologiilor de testare genetică și ale cunoștințelor medicale.
• Un rezultat fără variantă relevantă nu exclude o boală genetică sau o predispoziție la ea.

Ca orice panel, testul nu poate arăta:

• variantele din genele care nu sunt incluse în panel și cauzele genetice încă necunoscute;
• modificările apărute în timpul vieții doar într-un țesut, de exemplu într-o tumoră (variante somatice);
• de obicei, dacă și când vor apărea semnele sau cât de severe vor fi: aceeași variantă se poate manifesta diferit în aceeași familie.

Cum se face

Proba este de sânge din venă (sânge periferic), cel puțin 3 ml (cel puțin 1 ml la copii), recoltat într-un tub cu anticoagulant (EDTA); se acceptă și ADN extras (cel puțin 20 µl, la 50 ng/µl), un frotiu bucal (de pe interiorul obrazului) sau salivă, recoltate după instrucțiunile kitului. Rezultatul este gata în aproximativ 32 de zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) și PCR, pe un panel de gene nucleare alese după ghidurile NCCN și bazele de date PanelApp, cu analiza CNV
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV); mici inserții și deleții (indeli); variații ale numărului de copii (CNV); varianta c.156_157insAlu din gena BRCA2
• Gene (188): caută în lista genelor
• Probă: sânge periferic recoltat pe EDTA, cel puțin 3 ml (cel puțin 1 ml la copii); se acceptă și ADN extras (cel puțin 20 µl, la 50 ng/µl), frotiu bucal sau salivă (după instrucțiunile kitului)
• Durată: 32 de zile lucrătoare