Panel genetic pentru ciliopatii

Pe scurt

Panelul analizează 195 de gene ale bolilor în care cilii, mici prelungiri ale celulelor, nu funcționează normal (ciliopatii). Aceste boli genetice pot afecta, în combinații diferite, rinichii, retina, creierul, ficatul, scheletul, căile respiratorii și poziția organelor. Panelul se potrivește când semnele unui copil sau ale unui adult sugerează o ciliopatie, dar nu indică un singur sindrom; medicul genetician stabilește, la consultație, dacă este testul potrivit.

Ce analizează

Aproape toate celulele au un cil, o mică antenă prin care primesc semnale, iar unele au mulți cili mobili, care mișcă lichidele, de exemplu mucusul din bronhii. Sute de proteine construiesc și întrețin acești cili. Când una lipsește, pot fi afectate mai multe organe deodată, iar aceeași genă poate cauza boli diferite la persoane diferite. De aceea, sindroamele se suprapun mult și sunt greu de separat doar clinic.

Testul citește prin secvențiere de nouă generație (NGS) cele 195 de gene ale panelului și caută în ele și fragmente de ADN lipsă sau în plus (deleții sau duplicații; analiza CNV este inclusă). Genele acoperă:

• bolile genetice ale rinichilor din grupul nefronoftizei și sindroamele înrudite (Senior-Løken, Joubert, Meckel), cu boală renală, boli ale retinei (distrofie retiniană) sau malformații ale creierului;
• sindromul Bardet-Biedl și sindromul Alström;
• diskinezia ciliară primară, cu infecții respiratorii cronice și organe așezate în oglindă (situs inversus);
• ciliopatiile scheletale, cu coaste scurte, membre scurte și degete în plus, cum este sindromul Ellis-van Creveld;
• bolile cu chisturi multiple la rinichi (polichistice renale) și sindroamele oro-facio-digitale;
• câteva boli care pot cauza dilatări asemănătoare ale bronhiilor (bronșiectazii).

Pentru cine este

• copil cu boală renală cronică sau chisturi renale și o boală a retinei (distrofie retiniană), degete în plus (polidactilie) sau întârziere în dezvoltare;
• copil cu semnul „dintelui molar” la RMN cerebral, tonus muscular scăzut (hipotonie) și mișcări anormale ale ochilor;
• copil cu degete în plus și obezitate, malformații renale sau probleme de vedere;
• copil cu torace îngust, coaste scurte sau membre scurte și polidactilie;
• copil sau adult cu infecții respiratorii cronice și situs inversus, la care nu e clar ce sindrom ar fi.

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv: una sau două variante care cauzează boala (patogene), după modul de moștenire, confirmă diagnosticul. Sindromul găsit stabilește controalele necesare: rinichi, ochi, ficat, plămâni sau dezvoltare. Rudele pot face apoi un test țintit.
• O singură variantă într-o genă recesivă: de obicei înseamnă statutul de purtător și nu explică singură simptomele.
• Negativ: în genele analizate nu s-a găsit o cauză, ceea ce nu exclude o ciliopatie. Conform GeneReviews, de exemplu, variantele responsabile se găsesc doar la 50–60% dintre persoanele cu nefronoftiză. Dacă suspiciunea rămâne, pasul următor pe care îl discutăm de obicei la consultație este secvențierea întregului genom (WGS).
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o modificare despre care nu se știe încă dacă are vreun efect. Nu se folosește pentru decizii; testarea părinților o poate lămuri.

Ce nu poate detecta

• variantele din genele care nu sunt în panel;
• unele variante legate de boală, care pot rămâne neidentificate din cauza limitelor actuale ale tehnologiei de testare și ale cunoștințelor medicale.

Cum se face

Proba este de sânge din venă, recoltat într-un tub cu anticoagulant (EDTA) la un punct de recoltare; se acceptă și frotiu bucal (de pe interiorul obrazului), salivă sau ADN extras. Pentru a lămuri o variantă, se poate recomanda și testarea părinților. Rezultatul vine, de obicei, în 32 de zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Prețul include consultația de genetică medicală dinainte de test, interpretarea rezultatului și consultația de după.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS), panel de gene, cu analiza CNV
• Variante raportate: variante în cele 195 de gene ale panelului, citite prin NGS; variații ale numărului de copii (CNV)
• Gene (195): caută în lista genelor
• Probă: sânge periferic pe EDTA (cel puțin 3 ml, cel puțin 1 ml la copii), ADN (cel puțin 20 µl, la 50 ng/µl), frotiu bucal sau salivă (conform instrucțiunilor kitului)
• Durată: 32 de zile lucrătoare

Context clinic

• Diagnostic diferențial inclus în panel, pentru bronșiectazii: CFTR (fibroza chistică) și gene ale unor imunodeficiențe, de exemplu PIK3CD.
• Față de testele țintite pentru DCP, Bardet-Biedl, Senior-Løken și oro-facio-digital (exomul interpretat pentru fiecare afecțiune, 20 de zile lucrătoare), panelul acoperă mai multe sindroame într-un singur test, în 32 de zile lucrătoare; alegerea se face la consultație, după tabloul clinic.