Pe scurt
Panelul analizează 923 de gene asociate cu epilepsia, inclusiv cu formele care apar împreună cu întârziere în dezvoltare sau cu alte probleme neurologice. Se discută la copiii și adulții cu epilepsie la care investigațiile obișnuite, cum sunt RMN-ul cerebral și analizele, nu au găsit o cauză.
Ce analizează
Testul citește genele de pe listă, din nucleul celulei și câteva din mitocondrii, prin secvențiere de nouă generație (NGS). Raportează schimbările unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme), micile fragmente în plus sau lipsă (inserții și deleții) și porțiunile lipsă sau în plus din aceste gene (variații ale numărului de copii, CNV, adică deleții și duplicații). Genele sunt de mai multe tipuri: gene pentru canalele ionice ale neuronilor (de exemplu SCN1A sau KCNQ2), pentru comunicarea dintre neuroni (STXBP1), pentru metabolismul creierului (SLC2A1, ALDH7A1) sau pentru dezvoltarea lui (TSC1, TSC2, DEPDC5).
Lista acoperă atât epilepsiile severe ale copilului mic care pot afecta dezvoltarea (encefalopatii epileptice), cât și multe epilepsii familiale sau care fac parte dintr-un sindrom (sindromice).
Pentru cine este
- Copil cu epilepsie apărută în primele luni sau ani de viață, fără o cauză găsită.
- Copil cu crize greu de controlat cu medicamente și cu întârziere sau regres în dezvoltare.
- Persoană cu epilepsie și dizabilitate intelectuală, autism sau alte probleme de sănătate.
- Familie în care mai multe persoane au epilepsie.
- Persoană de orice vârstă cu epilepsie neexplicată: conform ghidului NSGC din 2023, testarea genetică se recomandă cu tărie tuturor persoanelor cu epilepsie fără o cauză dobândită.
Ce poate arăta rezultatul
Pozitiv. S-a găsit o variantă care cauzează boala (patogenă) și poate explica epilepsia. Uneori, rezultatul schimbă tratamentul: pentru unele forme există un tratament țintit, iar în altele unele medicamente sunt evitate. Rezultatul ajută și la estimarea riscului pentru alți membri ai familiei.
Negativ. În genele analizate nu s-a găsit o cauză. Asta nu exclude o cauză genetică: în epilepsie, pasul următor pe care îl discutăm de obicei la consultație este secvențierea întregului genom (WGS).
Incert. S-a găsit o variantă despre care nu se știe încă dacă are vreun efect (variantă de semnificație incertă, VUS). Până se lămurește, nu se folosește în deciziile de tratament. Testarea părinților sau a altor rude, cu sau fără epilepsie, poate ajuta la reclasificarea ei.
Tratamentul crizelor începe fără să aștepte rezultatul genetic, iar căutarea cauzei merge în paralel.
Ce nu poate detecta
- Variantele din gene care nu sunt pe listă, inclusiv din genele asociate cu epilepsia după alcătuirea panelului.
- Porțiunile mari lipsă sau în plus de pe cromozomi (deleții și duplicații mari), care cuprind și regiuni din afara genelor panelului și pe care le caută microarray-ul sau genomul, secvențele scurte repetate de prea multe ori (expansiunile de repetiții) și semnele chimice care pornesc sau opresc genele (modificările de metilare).
- Variantele prezente doar în țesutul creierului (mozaicism somatic), care nu apar în sânge.
- Contribuția variantelor comune cu efect mic: conform ILAE, multe epilepsii frecvente au mai multe cauze care se adună, genetice și negenetice (cauză multifactorială).
Unele variante legate de boală pot rămâne neidentificate, din cauza limitelor actuale ale tehnologiei și ale cunoștințelor medicale, iar uneori rezultatul nu este concludent.
Cum se face
Proba este de sânge, recoltată la un punct de recoltare partener; se acceptă și ADN extras, frotiu bucal sau salivă. Rezultatul vine, de obicei, în 32 de zile lucrătoare de la sosirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.
Pentru medici
- Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS), panel de gene, cu analiza CNV
- Variante raportate: variante punctiforme (SNV); mici inserții și deleții (indels); variații ale numărului de copii (CNV)
- Gene (923): caută în lista genelor
- Probă: sânge periferic pe EDTA (cel puțin 3 ml, cel puțin 1 ml la copii), ADN (cel puțin 20 µl, la 50 ng/µl), frotiu bucal sau salivă (conform instrucțiunilor kitului)
- Durată: 32 de zile lucrătoare
Context clinic
- Tratament după cauza genetică, conform comisiei de genetică a ILAE (Krey 2022): în epilepsia cu pierderea funcției SCN1A se evită blocantele canalelor de sodiu; în deficitul GLUT1 (SLC2A1) se folosește dieta ketogenă; în epilepsia legată de ALDH7A1 se administrează piridoxină (vitamina B6).
Lista genelor incluse
923 de gene
Întrebări frecvente
Panelul citește 923 de gene alese dinainte. Genomul citește toate genele, poate fi reanalizat când se descoperă gene noi și poate căuta, din aceleași date, și deleții și duplicații mari. Testul potrivit îl alegem la consultație, împreună cu informațiile de la medicul neurolog.
Nu este nevoie: testul analizează ADN-ul din sânge, iar medicamentele antiepileptice nu schimbă rezultatul. Orice modificare de tratament se discută doar cu medicul neurolog.
Da, poate fi: multe variante care cauzează epilepsie apar pentru prima dată la copil (de novo), iar altele nu cauzează simptome la toți purtătorii. Istoricul familiei ajută la alegerea testului, dar lipsa lui nu exclude o cauză genetică.
Teste înrudite
Surse
- NSGC, Smith L et al.: Genetic testing and counseling for the unexplained epilepsies: an evidence-based practice guideline of the National Society of Genetic Counselors, J Genet Couns 2023;32(2):266-280, https://doi.org/10.1002/jgc4.1646
- ILAE Genetics Commission, Krey I et al.: Current practice in diagnostic genetic testing of the epilepsies, Epileptic Disord 2022;24(5):765-786, https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10752379/
- ACMG/AMP, Richards S et al.: Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants, Genet Med 2015;17(5):405-424, https://doi.org/10.1038/gim.2015.30
