Panel genetic extins pentru boli cardiovasculare ereditare

Pe scurt

Panelul analizează 292 de gene ale bolilor moștenite ale inimii și vaselor, din șapte grupe: bolile mușchiului inimii (cardiomiopatii), tulburările de ritm (aritmii), bolile aortei, hipercolesterolemia familială, malformațiile inimii de la naștere, presiunea mare în arterele plămânilor (hipertensiune pulmonară) și RASopatiile, precum sindromul Noonan. Este pentru persoanele cu o boală cardiovasculară cu probabilă cauză genetică, care nu se încadrează într-un singur grup, și pentru familiile cu boli diferite ale inimii.

Ce analizează

Bolile moștenite ale inimii se suprapun des: o cardiomiopatie poate debuta cu aritmii, iar o malformație a inimii poate face parte dintr-un sindrom. De aceea panelul le verifică deodată genele.

Prin secvențiere de nouă generație (NGS), testul citește porțiunile genelor care conțin instrucțiunile pentru proteine (exonii). Raportează schimbările unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme), mici inserții și deleții, de cel mult 30 de „litere”, și fragmente mai mari lipsă sau în plus (deleții și duplicații, CNV), confirmate printr-o a doua metodă.

Pentru cine este

• o boală a inimii sau a vaselor cu probabilă cauză genetică, care nu se încadrează într-un singur grup, de exemplu o boală a aortei împreună cu o malformație a inimii;
• o oprire a inimii (stop cardiac) după care persoana a fost resuscitată, fără o cauză găsită după investigațiile cardiologice;
• copil cu o malformație a inimii însoțită de o cardiomiopatie sau de o aritmie;
• hipertensiune arterială pulmonară fără o cauză găsită, mai ales cu rude afectate;
• o familie cu boli diferite ale inimii, colesterol foarte mare din tinerețe sau morți subite la vârstă tânără: testul se face întâi persoanei afectate sau ADN-ului păstrat de la ea; altfel, discutăm la consultație dacă îți este util.

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv. O variantă care cauzează boala (patogenă sau probabil patogenă) arată despre ce boală e vorba, uneori una la care medicul nu se gândise. Orientează controalele, tratamentul și testarea țintită a rudelor; unele dintre aceste boli au tratament specific, de exemplu hipercolesterolemia familială. La unele gene arată un risc crescut, nu certitudinea bolii.
• Negativ. În cele 292 de gene nu s-a găsit o cauză, ceea ce nu exclude o cauză genetică. Rudele apropiate rămân în urmărire clinică, potrivit bolii din familie. Dacă suspiciunea rămâne, pasul următor pe care îl discutăm de obicei la consultație este secvențierea întregului genom (WGS).
• Variantă de semnificație incertă (VUS). O modificare despre care nu se știe încă dacă are vreun efect; apare în raport doar când ar putea cauza boala. Conform consensului internațional din 2022, nu se folosește pentru testarea rudelor; uneori o lămurește testarea rudelor afectate.

Ce nu poate detecta

• variantele din genele neincluse, de exemplu din ADN-ul mitocondrial;
• anomaliile cromozomiale și microdelețiile care cuprind mai multe gene, precum deleția 22q11.2, care se caută prin microarray cromozomial;
• statutul de purtător pentru bolile recesive, care nu se raportează;
• variantele din regiuni greu de citit și cele prezente doar în unele celule (mozaicism);
• de obicei, când vor apărea semnele și cât de severe vor fi;
• cauzele negenetice ale bolilor de inimă.

Cum se face

Proba este un frotiu bucal (de pe interiorul obrazului). Se poate recolta acasă, cu kitul trimis și preluat prin curier, după instrucțiunile primite, sau la un centru de recoltare. Rezultatul vine, de regulă, în 15–20 de zile lucrătoare de la primirea probei. Consultația de genetică medicală dinainte de test costă 420 de lei, se plătește după consultație și se scade din prețul testului; consultația de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) după îmbogățirea regiunilor de interes prin hibridizare în soluție (captură țintită); vizează toți exonii codanți (transcripte MANE și/sau canonice) și 10 perechi de baze din intronii adiacenți
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV); mici inserții și deleții (indeli), de până la 30 de perechi de baze; deleții și duplicații (CNV); cele pozitive se confirmă printr-o metodă independentă
• Gene (292): caută în lista genelor
• Probă: frotiu bucal (recoltat după instrucțiunile primite)
• Durată: 15–20 de zile lucrătoare

Context clinic

• Panelul reunește genele a șapte paneluri țintite: cardiomiopatii (98 de gene, HT-0504), aritmii (42, HT-0499), aortopatii (48, HT-0492), hipercolesterolemie familială (11, HT-0506), malformații cardiace congenitale (80, HT-0511), hipertensiune pulmonară (11, HT-0509) și RASopatii (30, HT-0011); unele gene apar în mai multe grupe.
• Față de HT-0514 (253 de gene), cele două paneluri au în comun 134 de gene. HT-0514 adaugă genele ADN-ului mitocondrial și multe gene nucleare ale bolilor mitocondriale și metabolice (de exemplu ale complexului I sau ale mucopolizaharidozelor); acest panel adaugă genele dislipidemiilor, ale malformațiilor cardiace și ale heterotaxiei, ale hipertensiunii pulmonare și mai multe gene ale canalelor ionice. Dintre cele 100 de gene ale HT-0515, doar FXN și PRKG1 nu sunt aici.
• PRKG1, o genă a anevrismelor aortice familiale, nu este inclusă; o au HT-0490 și HT-0515.
• Pentru sindromul Brugada, conform ClinGen, doar SCN5A are o legătură dovedită cu boala, iar consensul din 2022 recomandă ca variantele rare din genele cu legătură contestată sau respinsă să nu fie raportate de rutină pentru acest diagnostic; panelul include și astfel de gene.
• Bolile care imită o cardiomiopatie, incluse în panel, au tratamente proprii: de exemplu boala Fabry (GLA), boala Pompe (GAA) și amiloidoza cu transtiretină (TTR).
• La o malformație cardiacă cu anomalii extracardiace, consensul din 2022 indică microarray-ul cromozomial (sau CNV-seq) și recomandă secvențierea exomului sau a genomului în trio; în practica noastră alegem de regulă genomul (WGS). Panelurile țintite de malformații cardiace pot fi folosite la sugarii cu malformații complexe.
• În genele cu transmitere recesivă, de exemplu cele ale diskineziei ciliare primare din grupa heterotaxiei (DNAH5, DNAI1, DNAH11), o singură variantă heterozigotă (statut de purtător) nu se raportează.