Panel genetic pentru aritmii cardiace, 42 de gene

Pe scurt

Panelul analizează 42 de gene ale aritmiilor, adică ale bătăilor inimii neregulate, prea rapide sau prea lente, cauzate de o problemă a impulsurilor electrice care le coordonează: de exemplu fibrilația atrială, sindromul Brugada, sindromul QT lung sau sindromul QT scurt. Este pentru cei cu o aritmie moștenită, diagnosticată sau suspectată, și pentru familiile lor.

Ce analizează

Un panel genetic analizează deodată mai multe gene care pot cauza aceleași semne sau aceeași problemă de sănătate. Secvențierea de nouă generație (NGS) citește în paralel ADN-ul acestor gene, mai ales porțiunile care conțin instrucțiunile pentru proteine (exonii). Testul caută variantele cu care persoana s-a născut, fie moștenite, fie apărute pentru prima dată la ea. Fiecare variantă se clasifică după criterii internaționale, de la fără efect (benignă) la cauzatoare de boală (patogenă), și se interpretează împreună cu istoricul personal și al familiei.

Testul analizează 42 de gene.

Ce raportează:

• schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme, SNV)
• mici fragmente de ADN în plus sau lipsă (inserții și deleții, indeli), de până la 30 de „litere” (perechi de baze)
• fragmente de ADN lipsă sau în plus (deleții și duplicații, CNV); cele găsite se confirmă printr-o metodă independentă

Pentru cine este

• Aritmie moștenită diagnosticată de cardiolog după electrocardiograme, Holter sau test de efort, de exemplu QT lung, sindrom Brugada sau tahicardie ventriculară polimorfă catecolaminergică.
• Leșinuri sau convulsii neexplicate, la care medicul suspectează o cauză electrică a inimii.
• Persoană care a supraviețuit unui stop cardiac fără cauză găsită.
• În familie, o aritmie moștenită sau o moarte subită inexplicabilă la vârstă tânără, când varianta familiei nu e cunoscută; dacă e cunoscută, rudele pot face doar testul țintit pentru ea.

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv: o variantă care cauzează boala (patogenă) confirmă forma genetică a bolii, iar gena găsită poate orienta tratamentul și precauțiile zilnice. Conform consensului internațional din 2022, o variantă clar patogenă cântărește mult în diagnostic, dar spune mai puțin despre evoluția bolii.
• Negativ: în genele analizate nu s-a găsit o cauză, ceea ce nu infirmă un diagnostic clinic: nu toate formele au o cauză cunoscută. Conform aceluiași consens, o variantă se găsește la aproximativ 70–85% dintre pacienții cu QT lung cu probabilitate mare, iar în sindromul Brugada, o variantă SCN5A la aproximativ 20%. Rudele apropiate rămân în urmărirea cardiologului. Dacă suspiciunea rămâne, discutăm de obicei secvențierea întregului genom (WGS).
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o modificare despre care nu se știe încă dacă cauzează boala. Până se lămurește, nu se folosește pentru tratament sau pentru testarea rudelor; uneori o lămurește testarea altor rude afectate.

Ce nu poate detecta

• Testul nu detectează toate modificările genetice din genele analizate.
• Unele regiuni pot fi citite incomplet: secvențele repetitive, regiunile foarte asemănătoare cu alte porțiuni ale genomului (omologie mare: duplicații segmentare, pseudogene) și cele cu o proporție foarte mare sau foarte mică de „litere” G și C (conținut GC extrem).
• O modificare prezentă doar într-un procent mic de celule (mozaicism) poate să nu fie detectată.
• Statutul de purtător pentru bolile recesive nu se raportează.
• Variantele de semnificație incertă, despre care nu se știe încă dacă au vreun efect, se raportează doar când există argumente că ar putea cauza boala.
• Un rezultat negativ nu exclude variante cauzatoare de boală (patogene) în regiunile pe care testul nu le analizează sau pe care le citește insuficient.

Ca orice panel, testul nu poate arăta:

• variantele din genele care nu sunt incluse în panel și cauzele genetice încă necunoscute;
• modificările apărute în timpul vieții doar într-un țesut, de exemplu într-o tumoră (variante somatice);
• de obicei, dacă și când vor apărea semnele sau cât de severe vor fi: aceeași variantă se poate manifesta diferit în aceeași familie.

Cum se face

Proba este un frotiu bucal (de pe interiorul obrazului), recoltat de medic după instrucțiunile primite. Rezultatul este gata în aproximativ 10–20 de zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) după îmbogățirea regiunilor de interes prin hibridizare în soluție (captură țintită); vizează toți exonii codanți (transcripte MANE și/sau canonice) și 10 perechi de baze din intronii adiacenți
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV); mici inserții și deleții (indeli), de până la 30 de perechi de baze; deleții și duplicații (CNV); cele pozitive se confirmă printr-o metodă independentă
• Gene (42)

  • ABCC9
  • AKAP9
  • ANK2
  • CACNA1C
  • CACNA2D1
  • CACNB2
  • CALM1
  • CALM2
  • CALM3
  • CASQ2
  • CAV3
  • GJA5
  • GNAI2
  • GPD1L
  • HCN4
  • KCNA5
  • KCNAB2
  • KCND3
  • KCNE1
  • KCNE2
  • KCNE3
  • KCNH2
  • KCNJ2
  • KCNJ5
  • KCNJ8
  • KCNQ1
  • LMNA
  • MYL4
  • NPPA
  • RYR2
  • SCN10A
  • SCN1B
  • SCN2B
  • SCN3B
  • SCN4B
  • SCN5A
  • SNTA1
  • TBX5
  • TECRL
  • TNNI3
  • TRDN
  • TRPM4
• Probă: frotiu bucal (recoltat de medic după instrucțiunile primite)
• Durată: 10–20 de zile lucrătoare

Context clinic

• Conform consensului din 2022, în QT lung cu probabilitate mare (scor Schwartz ≥ 3,5) testarea este recomandată cu tărie pentru KCNQ1, KCNH2, SCN5A, CALM1, CALM2 și CALM3, iar în tahicardia ventriculară polimorfă catecolaminergică este recomandată pentru RYR2, CASQ2, CALM1–3, TRDN și TECRL. Toate aceste gene sunt în panel.
• Genele fără dovezi suficiente ca unică cauză a bolii nu ar trebui să primească o interpretare a variantelor. Pentru sindromul Brugada, conform ClinGen, doar SCN5A are o legătură dovedită cu boala, iar consensul din 2022 recomandă ca variantele rare din genele cu legătură contestată sau respinsă să nu fie raportate de rutină pentru acest diagnostic; panelul include și astfel de gene.
• Panelul nu include genele desmozomale PKP2, DSP, DSG2, DSC2 și JUP; conform aceluiași consens, aproape 50% dintre pacienții cu cardiomiopatie aritmogenă de ventricul drept au una sau mai multe variante patogene în genele desmozomale, cel mai des în PKP2. Pentru această boală există panelul dedicat (HT-0500).