Panel genetic pentru malformații cardiace congenitale

Pe scurt

Panelul caută o cauză genetică pentru o malformație a inimii prezentă de la naștere, analizând 80 de gene dintr-un frotiu bucal. Medicul genetician îl alege de regulă după analiza cromozomilor prin microarray (microarray-ul cromozomial), când tipul malformației sau istoricul familiei arată spre anumite gene. Un rezultat pozitiv poate explica malformația, arată ce alte organe merită urmărite și precizează riscul de repetare în familie.

Ce analizează

Inima se formează în primele săptămâni de sarcină, după un program pe care îl conduc multe gene. O parte dintre malformațiile cardiace au cauze cromozomiale, precum trisomia 21 sau deleția 22q11.2, care se văd la microarray. Altele vin dintr-o variantă într-o singură genă, apărută pentru prima dată la copil sau moștenită de la un părinte, iar la multe dintre ele cauza rămâne necunoscută.

Panelul citește prin secvențiere de nouă generație (NGS) 80 de gene. Sunt incluse genele care conduc formarea inimii (de exemplu GATA4, NKX2-5, TBX5, TBX20, NOTCH1), gene ale defectelor de sept, ale tetralogiei Fallot și ale heterotaxiei (organe poziționate anormal în torace și abdomen), precum și gene ale unor sindroame: sindromul Alagille, sindromul CHARGE, sindromul Kabuki, sindromul Holt-Oram. Testul caută schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme), mici fragmente de ADN în plus sau lipsă, de până la 30 de „litere” (inserții și deleții de până la 30 de perechi de baze), și fragmente mai mari lipsă sau în plus din gene (deleții și duplicații, CNV).

Pentru cine este

• sugar sau copil cu o malformație cardiacă complexă, la care microarray-ul cromozomial a fost normal;
• doi sau mai mulți membri ai familiei cu malformații cardiace;
• un tip de malformație care sugerează o genă anume, de exemplu o comunicare anormală între atrii (defect septal atrial) cu tulburări de conducere sau o îngustare a aortei chiar deasupra valvei (stenoză aortică supravalvulară);
• o malformație cardiacă împreună cu semne ale unui sindrom ale cărui gene sunt în panel, de exemplu modificări ale mâinilor sau ale ficatului;
• organe așezate anormal în torace și abdomen (heterotaxie), când situația se repetă în familie.

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv. O variantă care cauzează boala (patogenă) explică malformația și poate schimba urmărirea. Conform consensului internațional din 2022, la unele gene, de exemplu NKX2-5 sau TBX5, este nevoie de supravegherea ritmului inimii, iar un sindrom confirmat arată ce alte organe merită verificate. Testarea țintită a părinților arată dacă varianta a apărut pentru prima dată la copil (de novo) sau e moștenită, ceea ce schimbă riscul pentru o sarcină viitoare.
• Negativ. În genele analizate nu s-a găsit o variantă care să explice malformația. Rezultatul e frecvent, mai ales la malformațiile izolate, și nu exclude o cauză genetică. Dacă microarray-ul nu s-a făcut, el poate fi pasul următor; altfel, dacă suspiciunea de cauză genetică rămâne, pasul următor pe care îl discutăm de obicei la consultație este secvențierea întregului genom (WGS), de preferat în trio (copil și părinți).
• Variantă de semnificație incertă (VUS). O modificare despre care nu se știe încă dacă are vreun efect; se raportează doar când există argumente că ar putea cauza boala. Până se lămurește, nu se folosește pentru decizii; testarea părinților o poate lămuri uneori.

Ce nu poate detecta

• anomaliile cromozomiale (trisomia 21, 18 sau 13) și microdelețiile care cuprind mai multe gene, precum deleția 22q11.2 sau sindromul Williams, nu sunt ținta panelului, ci a microarray-ului cromozomial;
• sindromul Noonan și majoritatea RASopatiilor (din genele lor, panelul are doar HRAS); la suspiciunea de sindrom Noonan, medicul poate alege panelul pentru RASopatii (HT-0013);
• statutul de purtător pentru bolile recesive, care nu se raportează;
• variantele din regiuni greu de citit și cele prezente doar într-o mică parte din celule (mozaicism);
• cauzele negenetice, precum diabetul mamei, unele medicamente sau infecții din sarcină.

Cum se face

Proba este un frotiu bucal (de pe interiorul obrazului), recoltat de medic după instrucțiunile din kit. Rezultatul vine, de regulă, în 10–20 de zile lucrătoare de la primirea probei. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) după îmbogățirea regiunilor de interes prin hibridizare în soluție (captură țintită); vizează toți exonii codanți (transcripte MANE și/sau canonice) și 10 perechi de baze din intronii adiacenți
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV); mici inserții și deleții (indeli), de până la 30 de perechi de baze; deleții și duplicații (CNV); cele pozitive se confirmă printr-o metodă independentă
• Gene (80): caută în lista genelor
• Probă: frotiu bucal (recoltat de medic după instrucțiunile primite)
• Durată: 10–20 de zile lucrătoare

Context clinic

• Genele RASopatiilor absente din panel: PTPN11, SOS1, RAF1, RIT1.