Panel genetic pentru hipercolesterolemie și hiperlipoproteinemie

Pe scurt

Panelul caută cauza genetică a valorilor foarte mari ale grăsimilor din sânge (hipercolesterolemie și hiperlipoproteinemie), mai ales a hipercolesterolemiei familiale, o boală moștenită frecventă care cauzează valori mari ale colesterolului LDL și, netratată, poate duce la boală de inimă și infarct. Analizează 11 gene. Este pentru copiii și adulții cu colesterol sau trigliceride foarte mari, fără o altă explicație, și pentru familiile lor.

Ce analizează

Un panel genetic analizează deodată mai multe gene care pot cauza aceleași semne sau aceeași problemă de sănătate. Secvențierea de nouă generație (NGS) citește în paralel ADN-ul acestor gene, mai ales porțiunile care conțin instrucțiunile pentru proteine (exonii). Testul caută variantele cu care persoana s-a născut, fie moștenite, fie apărute pentru prima dată la ea. Fiecare variantă se clasifică după criterii internaționale, de la fără efect (benignă) la cauzatoare de boală (patogenă), și se interpretează împreună cu istoricul personal și al familiei.

Testul analizează 11 gene.

Ce raportează:

• schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme, SNV)
• mici fragmente de ADN în plus sau lipsă (inserții și deleții, indeli), de până la 30 de „litere” (perechi de baze)
• fragmente de ADN lipsă sau în plus (deleții și duplicații, CNV); cele găsite se confirmă printr-o metodă independentă

Pentru cine este

• colesterol LDL foarte mare, la copil sau la adult, care nu se explică prin dietă, medicamente sau alte boli;
• depozite de colesterol pe tendoane sau pe pleoape, ori infarct la vârstă tânără în familie;
• trigliceride foarte mari, cu sânge de aspect lăptos sau cu episoade de inflamație a pancreasului (pancreatită), mai ales din copilărie;
• colesterol HDL foarte mic, fără o cauză cunoscută;
• o tulburare moștenită a grăsimilor din sânge (dislipidemie ereditară) în familie, fără o variantă cunoscută; testul se face întâi persoanei cu valori anormale.

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv. O variantă care cauzează boala (patogenă) confirmă diagnosticul și arată tipul bolii. Pentru hipercolesterolemia familială, grupul internațional de experți din 2018 (Sturm și colab.) recomandă testarea genetică ca standard de îngrijire; conform aceluiași grup, o variantă patogenă indică un risc cardiovascular mai mare, deci poate fi nevoie de un tratament mai intens. În formele cu trigliceride foarte mari, rezultatul orientează dieta și tratamentul. Rudele pot face apoi un test țintit.
• Negativ. În genele analizate nu s-a găsit o cauză, ceea ce nu exclude o cauză ereditară. Colesterolul mare poate veni și din suma multor variante comune (polimorfismele), cu efect mic fiecare, iar tratamentul se stabilește după analizele de sânge și riscul tău.
• Variantă de semnificație incertă (VUS). O modificare despre care nu se știe încă dacă are vreun efect. Nu schimbă tratamentul; uneori o lămurește testarea rudelor cu valori anormale.

Ce nu poate detecta

• Testul nu detectează toate modificările genetice din genele analizate.
• Unele regiuni pot fi citite incomplet: secvențele repetitive, regiunile foarte asemănătoare cu alte porțiuni ale genomului (omologie mare: duplicații segmentare, pseudogene) și cele cu o proporție foarte mare sau foarte mică de „litere” G și C (conținut GC extrem).
• O modificare prezentă doar într-un procent mic de celule (mozaicism) poate să nu fie detectată.
• Statutul de purtător pentru bolile recesive nu se raportează.
• Variantele de semnificație incertă, despre care nu se știe încă dacă au vreun efect, se raportează doar când există argumente că ar putea cauza boala.
• Un rezultat negativ nu exclude variante cauzatoare de boală (patogene) în regiunile pe care testul nu le analizează sau pe care le citește insuficient.

Ca orice panel, testul nu poate arăta:

• variantele din genele care nu sunt incluse în panel și cauzele genetice încă necunoscute;
• modificările apărute în timpul vieții doar într-un țesut, de exemplu într-o tumoră (variante somatice);
• de obicei, dacă și când vor apărea semnele sau cât de severe vor fi: aceeași variantă se poate manifesta diferit în aceeași familie.

Cum se face

Proba este un frotiu bucal (de pe interiorul obrazului), recoltat de medic după instrucțiunile primite. Rezultatul este gata în aproximativ 10–20 de zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) după îmbogățirea regiunilor de interes prin hibridizare în soluție (captură țintită); vizează toți exonii codanți (transcripte MANE și/sau canonice) și 10 perechi de baze din intronii adiacenți
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV); mici inserții și deleții (indeli), de până la 30 de perechi de baze; deleții și duplicații (CNV); cele pozitive se confirmă printr-o metodă independentă
• Gene (11)

  • ABCA1
  • ABCG5
  • ABCG8
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LIPA
  • LPL
  • PCSK9
• Probă: frotiu bucal (recoltat de medic după instrucțiunile primite)
• Durată: 10–20 de zile lucrătoare

Context clinic

• Panelul are aceleași 11 gene ca HT-0506. Dintre cele cinci gene canonice ale chilomicronemiei familiale (LPL, APOC2, APOA5, GPIHBP1, LMF1) include doar LPL și APOA5, iar dintre genele deficitelor de HDL include ABCA1, dar nu APOA1 și LCAT. Panelul de 24 de gene (HT-0507) le include pe toate, plus ALMS1, ANGPTL3, CREB3L3, CYP27A1, GPD1, LIPC, MTTP și SAR1B. Alegerea se face la consultație, după profilul lipidic.