Panel genetic pentru boli osoase și displazii scheletice

Pe scurt

Panelul analizează 703 gene asociate cu bolile genetice ale scheletului: bolile de dezvoltare a oaselor cu statură mică (displazii scheletice), oasele fragile (osteogeneza imperfectă și celelalte boli cu fragilitate osoasă), oasele prea dense, rahitismele ereditare, malformațiile membrelor și închiderea prea timpurie a oaselor craniului (craniosinostozele). Este potrivit când semnele unui copil sau ale unui adult sugerează o boală osoasă genetică, dar nu indică clar un singur grup. Când semnele depășesc scheletul, în practica noastră se alege de obicei genomul (WGS); testul potrivit îl stabilește medicul genetician, la consultație.

Ce analizează

Conform clasificării internaționale din 2023, bolile genetice ale scheletului numără 771 de entități, asociate cu 552 de gene. Multe dintre ele seamănă între ele la examinare și pe radiografii, mai ales la copilul mic, așa că alegerea unui singur grup de gene poate rata cauza.

Testul citește prin secvențiere de nouă generație (NGS) cele 703 gene și raportează schimbările unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme), mici fragmente de ADN în plus sau lipsă (inserții sau deleții) și fragmente mai mari lipsă sau în plus din gene (deleții sau duplicații, CNV). Genele acoperă, de exemplu:

• acondroplazia și hipocondroplazia (FGFR3) și alte displazii cu statură mică (COL2A1, COMP, SLC26A2, ACAN);
• osteogeneza imperfectă și fragilitatea osoasă (COL1A1, COL1A2, IFITM5, SERPINF1, WNT1, PLS3);
• osteopetroza și bolile cu densitate osoasă crescută (CLCN7, TCIRG1, SOST, LRP5);
• rahitismele ereditare și hipofosfatazia (PHEX, FGF23, CYP27B1, VDR, ALPL);
• displaziile cu coaste scurte (DYNC2H1, EVC), displazia cleidocraniană (RUNX2), exostozele multiple (EXT1, EXT2) și craniosinostozele (FGFR2, TWIST1);
• boli care afectează și scheletul, ca mucopolizaharidozele, RASopatiile sau anemia Fanconi.

Pentru cine este

• copil cu statură mică disproporționată sau cu membre scurte, fără un diagnostic clar;
• copil sau adult cu fracturi repetate la traumatisme minore;
• radiografii cu oase neobișnuit de subțiri, de dense sau de deformate, care nu se încadrează într-un tip anume;
• malformații ale mâinilor, ale picioarelor sau ale craniului împreună cu alte semne osoase;
• familie cu mai multe persoane cu probleme osoase asemănătoare, fără diagnostic.

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv: s-a găsit o variantă care explică semnele, iar rezultatul confirmă tipul de boală osoasă. Tipul orientează tratamentul (de exemplu în osteogeneza imperfectă sau în rahitismele ereditare), controalele și estimarea riscului pentru frați și copii.
• O singură variantă într-o genă recesivă: de obicei înseamnă statutul de purtător. La câteva gene incluse pentru anemia Fanconi (BRCA1, BRCA2, PALB2), o singură variantă crește însă riscul de cancer; conform GeneReviews, purtătorii au un risc crescut de cancer de sân și de alte cancere.
• Negativ: în genele analizate nu s-a găsit o cauză, ceea ce nu exclude o boală genetică a scheletului. Dacă suspiciunea de cauză genetică rămâne, pasul următor pe care îl discutăm de obicei la consultație este secvențierea întregului genom (WGS).
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o modificare despre care nu se știe încă dacă are vreun efect. Un panel larg găsește mai des astfel de variante; ele nu se folosesc pentru decizii, iar radiografiile și testarea părinților le pot lămuri.

Ce nu poate detecta

• secvențele scurte repetate de prea multe ori (expansiunile de repetiții);
• unele variante asociate cu boala, pe care limitele actuale ale tehnologiei de testare și ale cunoștințelor medicale nu le pot identifica;
• cauzele negenetice ale fragilității osoase sau ale deformărilor.

Cum se face

Proba este de sânge din venă, recoltat într-un tub cu anticoagulant (EDTA) la un punct de recoltare; laboratorul acceptă și frotiu bucal, salivă sau ADN extras. Dacă le ai, te ajută să aduci la consultație radiografiile, ideal un set complet de radiografii ale scheletului (bilanț scheletic), curbele de creștere și analizele de calciu, fosfor și fosfatază alcalină. Unde există o suspiciune anume, medicul poate recomanda înaintea panelului și o analiză biochimică. Rezultatul vine, de obicei, în 32 de zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Prețul include consultația de genetică medicală dinainte de test, interpretarea rezultatului și consultația de după.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS), panel de gene, cu analiza CNV
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV); mici inserții și deleții (indeli); variații ale numărului de copii (CNV)
• Gene (703): caută în lista genelor
• Probă: sânge periferic pe EDTA (cel puțin 3 ml, cel puțin 1 ml la copii), ADN (cel puțin 20 µl, la 50 ng/µl), frotiu bucal sau salivă (conform instrucțiunilor kitului)
• Durată: 32 de zile lucrătoare

Context clinic

• Analizele care preced panelul la o suspiciune anume: de exemplu, dozarea enzimatică la suspiciunea de mucopolizaharidoză.
• Diagnosticul diferențial negenetic: carența de vitamina D.