Pe scurt
Testul caută în gena C9ORF72 o expansiune a secvenței GGGGCC, o cauză genetică frecventă a sclerozei laterale amiotrofice (SLA) și a demenței frontotemporale, cu sau fără alte cazuri în familie. Se folosește pentru confirmarea diagnosticului la o persoană cu simptome și, ca test predictiv, la adulții fără simptome dintr-o familie în care expansiunea a fost găsită, cu consiliere genetică înainte și după test.
Ce analizează
În gena C9ORF72 există o secvență de șase litere, GGGGCC, repetată de un anumit număr de ori. Fiecare om are două copii ale genei, una de la fiecare părinte. Conform GeneReviews, 2–24 de repetiții sunt normale, 25–60 au semnificație incertă, iar de la 61 până la câteva mii de repetiții expansiunea este patogenă.
Panelurile de secvențiere și exomul nu pot detecta expansiunea, iar genomul nu o detectează fiabil, de aceea e nevoie de acest test dedicat. Testul folosește PCR cu primer în repetiție (TP-PCR), o metodă gândită să arate dacă expansiunea este prezentă. Transmiterea este autozomal dominantă: fiecare copil al unui purtător are o șansă de 50% să moștenească expansiunea.
Pentru cine este
- persoană cu scleroză laterală amiotrofică, cu sau fără rude afectate;
- persoană cu demență frontotemporală, mai ales cu simptome psihiatrice sau cu rude cu demență ori SLA;
- persoană cu un tablou asemănător bolii Huntington, la care analiza genei HTT a ieșit normală;
- adult fără simptome, cu o rudă la care expansiunea a fost confirmată, care vrea un test predictiv.
Ce poate arăta rezultatul
Expansiune patogenă: la o persoană cu simptome, rezultatul explică boala. La o persoană fără simptome, înseamnă un risc crescut, dependent de vârstă: conform GeneReviews, probabilitatea ca boala să apară (penetranța) este aproape nulă la 35 de ani, de circa 50% la 58 de ani și aproape completă la 80 de ani. Nu se poate spune dacă va apărea SLA, demență frontotemporală sau ambele, nici când.
Fără expansiune: o expansiune în C9ORF72 nu este cauza bolii; dacă suspiciunea de cauză genetică rămâne, pasul următor îl stabilim împreună, la consultație. La un test predictiv, înseamnă că nu ai moștenit expansiunea din familie.
Zona incertă (25–60 de repetiții): semnificația nu e clară; asemenea alele sunt rare și de obicei nu se transmit împreună cu boala în familii. Interpretarea se face la consultație, cu istoricul familiei.
Ce nu poate detecta
- Numărul exact de repetiții dintr-o expansiune mare: ca metodă, PCR-ul cu primer în repetiție (TP-PCR) arată prezența ei, nu dimensiunea, iar dimensiunea măsurată în sânge nu prezice oricum evoluția.
- Variante în alte gene ale SLA sau ale demenței frontotemporale, care se caută printr-un panel genetic.
- Vârsta debutului, forma bolii sau ritmul în care evoluează.
Uneori rezultatul nu este concludent, iar limitele actuale ale tehnologiei pot face ca unele modificări să nu fie identificate.
Cum se face
Proba este de sânge venos; se acceptă și ADN extras, frotiu bucal sau salivă. Rezultatul vine de obicei în 21 de zile lucrătoare de la sosirea probei în laborator.
Pentru testul predictiv, GeneReviews recomandă ca beneficiile, limitele și consecințele testării să fie discutate în consiliere genetică înainte de test. Așa lucrăm și noi: ai timp de gândire, rezultatul îl primești la consultație, iar decizia de a te testa îți aparține. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.
Pentru medici
- Metodă: PCR cu primer în repetiție (TP-PCR)
- Variante raportate: expansiunea repetiției GGGGCC din gena C9ORF72
- Gene (1)
- C9ORF72
- Probă: sânge periferic pe EDTA (cel puțin 3 ml, cel puțin 1 ml la copii), ADN (cel puțin 20 µl, la 50 ng/µl), frotiu bucal sau salivă (conform instrucțiunilor kitului)
- Durată: 21 de zile lucrătoare
Întrebări frecvente
Secvențierea citește fragmente scurte de ADN, iar o repetiție lungă de sute sau mii de unități nu poate fi măsurată astfel. De aceea expansiunea se caută printr-un test separat.
Conform recomandărilor Societății Europene de Genetică Umană (ESHG), un copil fără simptome se testează când prevenția sau tratamentul pot începe în copilărie. Pentru SLA și demența frontotemporală legate de C9ORF72 nu e cazul, așa că testul se amână, de regulă, până când copilul poate decide singur, ca adult.
Teste înrudite
Surse
- GeneReviews: C9orf72 Frontotemporal Dementia and/or Amyotrophic Lateral Sclerosis (Gossye H et al., actualizat 2020), https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK268647/
- ESHG: Genetic testing in asymptomatic minors: recommendations of the European Society of Human Genetics, Eur J Hum Genet 2009;17(6):720-721, https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2947109/
