Analiza expansiunii AAGGG în gena RFC1 (sindromul CANVAS)

Pe scurt

Testul caută în gena RFC1 expansiunea repetiției AAGGG, cauza sindromului CANVAS (ataxie cerebeloasă, neuropatie și areflexie vestibulară) și a unor forme mai ușoare din același spectru. Se adresează adulților cu dezechilibru lent progresiv, cu neuropatie senzitivă și, adesea, cu o tuse seacă cronică, veche de ani de zile.

Ce analizează

Într-o porțiune a genei RFC1 care nu codifică proteina (un intron) se află o secvență scurtă, de cinci „litere”, repetată de câteva ori. La cei mai mulți oameni, motivul este AAAAG, iar numărul de repetiții e mic. În bolile legate de RFC1, motivul se schimbă, cel mai des în AAGGG, și se repetă de sute sau mii de ori. Conform GeneReviews, peste 99% dintre persoanele cu boala au astfel de expansiuni pe ambele copii ale genei.

Testul caută expansiunea AAGGG prin TP-PCR, un PCR cu un primer legat în interiorul repetiției. Panelurile și exomul obișnuit nu văd această expansiune, de aceea există un test dedicat.

Boala se transmite autozomal recesiv: apare când ambele copii ale genei poartă expansiunea.

Pentru cine este

• adult, de obicei în jurul vârstei de 50–60 de ani, cu dezechilibru lent progresiv, care se accentuează pe întuneric;
• neuropatie senzitivă (amorțeli, furnicături, dureri sau crampe) fără cauză găsită, cu sau fără probleme de echilibru;
• tuse seacă cronică, uneori începută cu zeci de ani înainte, fără o cauză pulmonară sau digestivă care să o explice, asociată cu probleme de echilibru sau de sensibilitate;
• imagini care „sar” la mișcările capului (oscilopsie), din cauza afectării ambelor urechi interne, împreună cu ataxie sau neuropatie;
• frate sau soră a unei persoane cu expansiunea confirmată.

Ce poate arăta rezultatul

• Expansiune patogenă pe ambele copii: confirmă diagnosticul la o persoană cu simptome. Boala progresează lent și, conform GeneReviews, nu pare să scurteze viața. Nu există un tratament specific, dar recuperarea medicală, tratamentul tusei și al tulburărilor autonome ajută.
• O singură expansiune: persoana este, cel mai probabil, purtătoare. Purtătorii sunt frecvenți: conform GeneReviews, aproximativ 8% dintre europenii sănătoși. Când tabloul clinic este tipic, cealaltă copie poate avea, rar, o variantă punctiformă, care se caută prin secvențierea genei.
• Fără expansiune patogenă: boala legată de RFC1 devine puțin probabilă; pentru alte cauze, pasul următor îl stabilim împreună, la consultație.
• Rezultat incert: unele motive diferite de AAGGG, de exemplu un AAAGG foarte lung sau motive descrise doar în câteva familii, au o semnificație încă incertă, când testul le identifică.

Ce nu poate detecta

• schimbările unei singure „litere” (variantele punctiforme) sau porțiunile lipsă (delețiile) din RFC1, prezente la sub 1% dintre persoanele cu boala;
• motivele patogene rare, diferite de AAGGG, dacă testul nu le caută separat;
• mărimea exactă a expansiunii, pentru că testul se bazează pe PCR; pentru diagnostic, de obicei nu e necesară;
• alte cauze genetice de ataxie sau de neuropatie, care au teste proprii.

Cum se face

Proba este de sânge venos, recoltată într-un centru partener; se acceptă și ADN extras, frotiu bucal sau salivă. Rezultatul vine, de obicei, în 21 de zile lucrătoare de la sosirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: TP-PCR
• Variante raportate: expansiunea AAGGG din gena RFC1
• Gene (1)

  • RFC1
• Probă: sânge periferic recoltat pe EDTA, cel puțin 3 ml (cel puțin 1 ml la copii); se acceptă și ADN extras (cel puțin 20 µl, la 50 ng/µl), frotiu bucal sau salivă (după instrucțiunile kitului)
• Durată: 21 de zile lucrătoare

Context clinic

• Conform GeneReviews, spectrul bolii legate de RFC1 include neuropatia senzitivă cu debut tardiv, chiar fără ataxie; de aceea, situația rămâne printre indicații.
• Motive patogene rare: ACAGG, întâlnit mai ales în Asia de Est și în zona Pacificului. Mărimea expansiunii se măsoară prin Southern blot sau prin secvențiere cu citire lungă.
• Diagnostic diferențial genetic: ataxiile spinocerebeloase, ataxia Friedreich și expansiunea din FGF14 (SCA27B).