Analiza genei FMR1 prin TP-PCR specific metilării (sindromul X fragil)

Pe scurt

Testul analizează gena FMR1 prin msTP-PCR, o metodă care urmărește atât creșterea numărului de repetiții ale secvenței CGG (expansiunea), care cauzează sindromul X fragil, cât și semnalul chimic care oprește gena (metilarea). Se folosește atât la copilul cu întârziere în dezvoltare sau autism, cât și la rudele unei persoane cu sindromul X fragil.

Ce analizează

Gena FMR1 se află pe cromozomul X. La începutul ei, secvența de trei „litere” CGG se repetă de un anumit număr de ori. Conform GeneReviews, alelele normale au aproximativ 5–44 de repetiții, cele intermediare 45–54, premutațiile 55–200, iar mutațiile complete peste 200. În mutația completă, regiunea de control a genei este de obicei metilată, iar gena se oprește.

Testul analizează atât expansiunea repetiției, cât și metilarea genei. Ca metodă, TP-PCR folosește un fragment scurt de ADN care pornește copierea (primer) și care se leagă chiar în interiorul repetiției, așa că poate pune în evidență și alelele foarte mari, care la PCR-ul obișnuit nu se amplifică; varianta specifică metilării (msTP-PCR) verifică, în aceeași analiză, metilarea regiunii de control a genei.

Pentru cine este

• Copil cu întârziere în dezvoltare, dizabilitate intelectuală sau autism, fără o cauză găsită; conform ghidului AAP din 2020, testul pentru X fragil se discută și se oferă tuturor copiilor cu tulburare din spectrul autist (TSA).
• Mama și alte rude de pe linia mamei ale unei persoane cu sindromul X fragil.
• Copil la care testul FMR1 prin PCR convențional a fost neconcludent.
• Femeie la care ovarele și-au oprit funcția înainte de 40 de ani (insuficiență ovariană prematură).

Terapiile și intervenția timpurie încep cu sau fără un diagnostic genetic, iar căutarea cauzei merge în paralel.

Ce poate arăta rezultatul

Normal. Repetițiile sunt în limite normale, iar un sindrom X fragil cauzat de expansiune este foarte puțin probabil. Dacă suspiciunea de cauză genetică rămâne, în practica noastră pasul următor este, de regulă, secvențierea întregului genom (WGS).

Intermediar sau premutație. O alelă intermediară nu cauzează sindromul X fragil, dar poate deveni instabilă când e transmisă de la mamă. O premutație nu cauzează sindromul X fragil, dar se asociază cu riscul unui sindrom cu tremor și tulburări de echilibru, cu debut târziu (FXTAS), și, la femei, cu riscul ca ovarele să-și oprească funcția devreme (insuficiență ovariană prematură, FXPOI).

Mutație completă. Peste 200 de repetiții, de obicei cu metilare, susțin diagnosticul sindromului X fragil. Conform GeneReviews, la fete semnele apar mai rar și sunt, de obicei, mai ușoare decât la băieți.

Mozaicism. Un amestec de alele de mărimi diferite sau o metilare parțială se interpretează la consultație, împreună cu tabloul clinic.

Ce nu poate detecta

• Porțiunile lipsă (delețiile) și schimbările unei singure „litere” (variantele punctiforme) din FMR1: testul urmărește doar expansiunea repetiției și metilarea. Conform GeneReviews, aceste alte modificări explică sub 1% dintre cazurile de sindrom X fragil.
• Alte cauze genetice ale întârzierii sau ale autismului.
• Ca la orice metodă bazată pe PCR, alelele de altă mărime prezente în foarte puține celule (mozaicism de nivel foarte scăzut) pot scăpa.
• Dacă o persoană cu premutație va avea FXTAS sau FXPOI: testul arată riscul, nu evoluția.

Uneori rezultatul nu este concludent; atunci discutăm la consultație dacă e nevoie de alte teste.

Cum se face

Proba este de sânge, recoltată într-un centru partener; se pot folosi și ADN deja extras, un frotiu bucal sau salivă. Rezultatul vine, de obicei, în 21 de zile lucrătoare de la sosirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: msTP-PCR (analiza expansiunii repetiției și a metilării)
• Variante raportate: expansiunea repetiției din gena FMR1; metilarea genei FMR1
• Gene (1)

  • FMR1
• Probă: sânge periferic pe EDTA (cel puțin 3 ml, cel puțin 1 ml la copii), ADN (cel puțin 20 µl, la 50 ng/µl), frotiu bucal sau salivă (conform instrucțiunilor kitului)
• Durată: 21 de zile lucrătoare