Screening genetic de purtător extins, panel de bază, un partener

Pe scurt

Screeningul genetic de purtător arată dacă o persoană sănătoasă poartă o modificare într-o genă (variantă) pe care o poate transmite copiilor. Panelul de bază analizează 22 de gene asociate cu boli recesive sau legate de cromozomul X, de severitate moderată sau mare. Această variantă testează un singur partener; se poate face înainte de sarcină sau în timpul ei.

Ce analizează

Fiecare genă există în două copii, câte una de la fiecare părinte. Un purtător are o copie modificată și una funcțională, de aceea este, de regulă, sănătos. Când ambii parteneri sunt purtători pentru aceeași genă, la fiecare sarcină există un risc de 25% ca un copil să fie afectat. În bolile legate de cromozomul X, o femeie purtătoare poate transmite boala fiilor ei.

Afecțiunile din panel: fibroza chistică, atrofia musculară spinală, sindromul X fragil, distrofia musculară Duchenne și Becker, alfa- și beta-talasemia, siclemia, fenilcetonuria, deficitul MCAD, galactozemia, surditatea legată de genele GJB2 și GJB6, boala Gaucher, boala Tay-Sachs, boala Niemann-Pick tip A/B, boala Canavan, disautonomia familială, sindromul Bloom, anemia Fanconi tip C, mucolipidoza tip IV și sindromul Smith-Lemli-Opitz.

Testul citește, prin secvențiere de nouă generație (NGS), toate porțiunile genelor care conțin instrucțiunile pentru proteine (regiunile codante). Caută schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme), mici fragmente în plus sau lipsă (inserții și deleții mici) și fragmente mai mari de ADN lipsă sau în plus (deleții și duplicații). Atrofia musculară spinală se analizează separat, printr-o metodă care numără copiile genei (MLPA), iar sindromul X fragil printr-o analiză care măsoară repetițiile din gena FMR1 (analiza fragmentelor de ADN prin PCR).

Pentru cine este

• cuplu care plănuiește o sarcină și vrea un prim screening, restrâns, pentru fibroza chistică, atrofia musculară spinală și celelalte boli din panel
• gravidă care vrea să afle întâi dacă este purtătoare
• cuplu care urmează un tratament de fertilizare in vitro
• cuplu înrudit sau cu o boală recesivă în familie; aici medicul genetician poate propune panelul complet sau o testare mai extinsă

Ce poate arăta rezultatul

• Negativ: nu s-a găsit nicio variantă care să cauzeze boala (patogenă) în cele 22 de gene. Riscul de a fi purtător scade, dar nu devine zero; medicul genetician îți explică, la consultație, riscul care rămâne (riscul rezidual).
• Purtător: ești purtător pentru o afecțiune; de regulă, purtătorii sunt sănătoși. Urmează, de obicei, testarea partenerului. Dacă amândoi sunteți purtători, discutăm opțiunile la consultație; conform ACMG, ele includ fertilizarea in vitro cu testarea genetică a embrionilor, folosirea gameților sau a embrionilor de la donator, adopția sau decizia de a nu avea copii. Într-o sarcină, pașii următori, inclusiv un eventual diagnostic prenatal, se discută cu medicul obstetrician.
• Purtătoare pentru o boală legată de cromozomul X sau cu o creștere moderată a secvenței repetate din gena FMR1 (premutație): medicul genetician îți explică riscul pentru copii și, unde e cazul, pentru tine: de exemplu, unele purtătoare pentru distrofia musculară Duchenne pot avea afectare a inimii, iar premutația FMR1 crește riscul ca ovarele să-și oprească funcția devreme (insuficiență ovariană prematură).
• Variante de semnificație incertă (VUS): variantele despre care nu se știe încă dacă au vreun efect nu se raportează în acest screening.

Ce nu poate detecta

• bolile cauzate de alte gene decât cele 22, bolile care pot apărea chiar și cu o singură copie modificată a genei (bolile dominante), variantele apărute pentru prima dată la copil (de novo) și modificările cromozomilor copilului (anomaliile cromozomiale)
• toate variantele din genele analizate: unele regiuni (secvențe care se repetă, regiuni foarte asemănătoare cu alte gene sau cu o compoziție neobișnuită a „literelor” ADN-ului, numită conținut GC extrem) sunt citite incomplet, iar o modificare prezentă doar într-o parte dintre celule (mozaicism) poate scăpa
• bolile care încep la vârsta adultă, cum sunt cancerele ereditare

Cum se face

Proba este un frotiu bucal: două probe din interiorul obrazului, recoltate de medic după instrucțiunile din kit. Analiza durează, în laborator, de obicei 10–15 zile lucrătoare de la primirea probei, la care se adaugă transportul. Prețul include consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) cu îmbogățire țintită prin captură, pe toate regiunile codante ale genelor și pe secvențele necodante adiacente; atrofia musculară spinală se analizează prin MLPA, iar sindromul X fragil prin analiză de fragmente (PCR)
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV); mici inserții și deleții (indeli); deleții și duplicații (CNV)
• Gene (22)

  • ACADM
  • ASPA
  • BLM
  • CFTR
  • DHCR7
  • DMD
  • ELP1
  • FANCC
  • FMR1
  • GALT
  • GBA
  • GJB2
  • GJB6
  • HBA1
  • HBA2
  • HBB
  • HEXA
  • MCOLN1
  • PAH
  • SMN1
  • SMN2
  • SMPD1
• Probă: frotiu bucal (două probe din interiorul obrazului, recoltate de medic)
• Durată: 10–15 zile lucrătoare

Context clinic

• Conform ACMG 2021, tuturor gravidelor și persoanelor care plănuiesc o sarcină li se oferă screeningul de nivel 3: 97 de gene autozomal recesive și 16 gene legate de X, în total 113. Panelul de bază, cu 22 de gene, este mai restrâns decât acest nivel; panelul complet are 231 de gene.