Panel genetic pentru boli metabolice ereditare

Pe scurt

Panelul analizează 223 de gene asociate cu principalele grupe de boli metabolice ereditare. Se adresează copiilor și adulților cu simptome care sugerează o astfel de boală, dar nu indică clar una anume, și persoanelor cu o boală metabolică în familie. Testul se alege la consultația de genetică medicală, pe baza simptomelor și a analizelor.

Ce analizează

În bolile metabolice ereditare, o genă modificată blochează o etapă din felul în care organismul descompune sau produce o substanță. Substanța de dinainte de blocaj se adună și devine toxică, iar cea de după lipsește. Simptomele se suprapun mult între boli, așa că un panel larg le poate căuta pe toate deodată. Conform clasificării internaționale publicate în 2021, sunt descrise aproximativ 1.450 de boli metabolice ereditare; panelul acoperă grupele cele mai frecvente, nu pe toate.

Testul citește prin secvențiere de nouă generație (NGS) porțiunile genelor care conțin instrucțiunile pentru proteine (regiunile codante) și caută schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme), mici fragmente de ADN în plus sau lipsă (inserții sau deleții) și fragmente mai mari lipsă sau în plus (deleții ori duplicații). Genele sunt grupate în 13 categorii:

• tulburările ciclului ureei și encefalopatia glicinică;
• acidemia metilmalonică, boala urinilor cu miros de arțar și aciduria 3-metilglutaconică;
• defectele de oxidare a acizilor grași;
• glicogenozele și hipoglicemia prin exces de insulină;
• bolile lizozomale, de exemplu bolile Gaucher, Fabry, Pompe și mucopolizaharidozele;
• bolile peroxizomale, defectele congenitale de glicozilare, deficitul cerebral de creatină și hiperfenilalaninemiile.

Pentru cine este

• copil cu întârziere sau regres în dezvoltare, convulsii sau tonus muscular scăzut (hipotonie), cu analize metabolice anormale;
• sugar sau copil cu vărsături repetate, somnolență, hipoglicemii sau episoade declanșate de boală ori de post;
• ficat sau splină mărite, slăbiciune musculară ori intoleranță la efort fără o cauză găsită;
• adolescent sau adult cu simptome neurologice sau psihiatrice care evoluează și nu răspund la tratamentele obișnuite;
• rudă a unei persoane cu o boală metabolică, când persoana afectată nu poate fi testată.

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv: o variantă care cauzează boala (patogenă), sau două, în bolile recesive, confirmă diagnosticul. Pentru multe dintre aceste boli există tratamente specifice, care schimbă evoluția: diete speciale, suplimente sau terapie de înlocuire enzimatică.
• Statutul de purtător: se raportează (îl cerem la comandă); o singură variantă într-o boală recesivă de obicei nu explică simptomele.
• Negativ: nu s-a găsit o cauză în aceste gene, ceea ce nu exclude o boală metabolică din afara panelului. Dacă suspiciunea de cauză genetică rămâne, în practica noastră pasul următor este, de regulă, secvențierea întregului genom (WGS).
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o modificare despre care nu se știe încă dacă cauzează boala; se raportează doar când există argumente că ar putea să o cauzeze. Analizele biochimice și testarea părinților ajută la lămurirea ei; reevaluarea variantei se poate cere mai târziu.

Ce nu poate detecta

• boli metabolice ale căror gene nu sunt în panel, de exemplu galactozemia, homocistinuria clasică (gena CBS), acidemia propionică, tirozinemia de tip 1, boala Wilson, porfiriile și majoritatea bolilor mitocondriale;
• variantele din ADN-ul mitocondrial;
• variantele din regiuni repetitive sau din gene cu copii foarte asemănătoare (pseudogene), unde citirea e incompletă;
• variantele aflate adânc în porțiunile dintre exoni (variante intronice profunde) și modificările prezente doar într-o mică parte dintre celule (mozaicism de nivel scăzut);
• activitatea enzimelor, care se măsoară prin analize biochimice.

Cum se face

Proba este un frotiu bucal (de pe interiorul obrazului), recoltat de medic după instrucțiunile din kit. Rezultatul vine, de obicei, în 10–20 de zile lucrătoare de la acceptarea probei în laborator. Te ajută să aduci la consultație analizele metabolice și rezultatele investigațiilor de până acum. Prețul include consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) după îmbogățirea regiunilor de interes prin hibridizare în soluție (captură țintită); vizează toți exonii codanți (transcripte MANE și/sau canonice) și 10 perechi de baze din intronii adiacenți
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV); mici inserții și deleții (indeli), de până la 30 de perechi de baze; deleții și duplicații (CNV); cele pozitive se confirmă printr-o metodă independentă
• Gene (223): caută în lista genelor
• Probă: frotiu bucal (o probă, recoltată de medic după instrucțiunile primite)
• Durată: 10–20 de zile lucrătoare