Panel genetic pentru cancer ereditar de sân, 13 gene

Pe scurt

Testul caută, în 13 gene, variantele moștenite care cresc riscul de cancer de sân. Citește genele prin secvențiere de nouă generație (NGS) și caută și porțiunile lipsă sau în plus (CNV), precum și varianta c.156_157insAlu din gena BRCA2. Se adresează persoanelor și familiilor la care se suspectează o predispoziție moștenită pentru cancerul de sân; testul se alege la consultația de genetică medicală.

Ce analizează

Un panel genetic analizează deodată mai multe gene care pot cauza aceleași semne sau aceeași problemă de sănătate. Secvențierea de nouă generație (NGS) citește în paralel ADN-ul acestor gene, mai ales porțiunile care conțin instrucțiunile pentru proteine (exonii). Testul caută variantele cu care persoana s-a născut, fie moștenite, fie apărute pentru prima dată la ea. Fiecare variantă se clasifică după criterii internaționale, de la fără efect (benignă) la cauzatoare de boală (patogenă), și se interpretează împreună cu istoricul personal și al familiei.

Testul analizează 13 gene.

Ce raportează:

• variante în secvența genelor panelului (NGS)
• fragmente de ADN lipsă sau în plus (variații ale numărului de copii, CNV)
• varianta c.156_157insAlu din gena BRCA2

Pentru cine este

Pe lângă BRCA1 și BRCA2, panelul de 13 gene cuprinde alte gene care cresc riscul de cancer de sân, ca PALB2, CHEK2 și ATM, și genele unor sindroame rare în care cancerul de sân apare alături de alte tumori: sindromul Li-Fraumeni (TP53), sindromul Cowden (PTEN), cancerul gastric difuz ereditar (CDH1) și sindromul Peutz-Jeghers (STK11). Nu cuprinde genele sindromului Lynch și nici BRIP1, legate de cancerul ovarian, endometrial sau colorectal, așa că se potrivește mai ales familiilor în care predomină cancerul de sân.

• Femeie cu cancer de sân diagnosticat la o vârstă tânără, cu cancer în ambii sâni sau cu un cancer de sân fără receptori hormonali și fără HER2 (triplu negativ).
• Bărbat cu cancer de sân.
• Familie în care mai multe rude apropiate, de pe aceeași parte, au avut cancer de sân.
• Familie în care cancerul de sân apare alături de cancer de stomac de tip difuz sau de sarcoame (tumori ale oaselor sau ale țesuturilor moi).

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv: s-a găsit, într-una dintre genele analizate, o variantă care cauzează sau probabil cauzează boala (patogenă sau probabil patogenă). În funcție de genă, rezultatul poate confirma diagnosticul sau poate arăta un risc crescut, nu o certitudine. Poate ajuta și la alegerea controalelor și a tratamentului.
• Negativ: în genele analizate nu s-a găsit o variantă care să explice situația. Rezultatul nu exclude o cauză genetică în alte gene sau de un tip pe care testul nu îl vede și nici o cauză negenetică. Dacă suspiciunea de cancer ereditar rămâne, în practica noastră discutăm la consultație secvențierea întregului genom (WGS).
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o modificare despre care nu se știe încă dacă are vreun efect. Până se lămurește, nu se folosește pentru decizii medicale. Uneori o lămurește testarea părinților sau a altor rude, iar cu timpul poate fi reclasificată.

Ce nu poate detecta

• Testul poate să nu dea un rezultat concludent despre variantele din genele analizate (genotip).
• Pentru unele variante găsite, nu se știe încă dacă au vreun efect (semnificație incertă).
• Unele variante legate de o boală pot rămâne neidentificate, din cauza limitelor actuale ale tehnologiilor de testare genetică și ale cunoștințelor medicale.
• Un rezultat fără variantă relevantă nu exclude o boală genetică sau o predispoziție la ea.

Ca orice panel, testul nu poate arăta:

• variantele din genele care nu sunt incluse în panel și cauzele genetice încă necunoscute;
• modificările apărute în timpul vieții doar într-un țesut, de exemplu într-o tumoră (variante somatice);
• de obicei, dacă și când vor apărea semnele sau cât de severe vor fi: aceeași variantă se poate manifesta diferit în aceeași familie.

Cum se face

Proba este de sânge din venă (sânge periferic), cel puțin 3 ml (cel puțin 1 ml la copii), recoltat într-un tub cu anticoagulant (EDTA); se acceptă și ADN extras (cel puțin 20 µl, la 50 ng/µl), un frotiu bucal (de pe interiorul obrazului) sau salivă, recoltate după instrucțiunile kitului. Rezultatul este gata în aproximativ 32 de zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS), cu analiza CNV
• Variante raportate: variante în secvența genelor panelului (NGS); variații ale numărului de copii (CNV); varianta c.156_157insAlu din gena BRCA2
• Gene (13)

  • ATM
  • BARD1
  • BRCA1
  • BRCA2
  • CDH1
  • CHEK2
  • NF1
  • PALB2
  • PTEN
  • RAD51C
  • RAD51D
  • STK11
  • TP53
• Probă: sânge periferic recoltat pe EDTA, cel puțin 3 ml (cel puțin 1 ml la copii); se acceptă și ADN extras (cel puțin 20 µl, la 50 ng/µl), frotiu bucal sau salivă (după instrucțiunile kitului)
• Durată: 32 de zile lucrătoare

Context clinic

• Conform ACMG/NSGC (2015), 15–20% dintre bărbații cu cancer de sân au o variantă BRCA1/2, iar cancerul de sân triplu negativ este puternic asociat cu variantele BRCA1.
• Conform GeneReviews, CDH1 este legată de cancerul de sân lobular, iar varianta CHEK2 c.1100delC crește riscul de cancer de sân de aproximativ două-trei ori la femei și de zece ori la bărbați.
• Spre deosebire de panelurile de 19 și 26 de gene, nu include BRIP1 și genele MMR (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, EPCAM); spre deosebire de panelul de 26 de gene, include NF1.