Panel genetic pentru retinita pigmentară, 123 de gene

Pe scurt

Panelul caută cauza genetică a retinitei pigmentare, o boală moștenită în care celulele retinei care primesc lumina (fotoreceptorii: bastonașele și conurile) se degradează treptat, de obicei la ambii ochi; bastonașele sunt afectate mai devreme și mai sever decât conurile. Analizează 123 de gene. Este pentru persoanele cu vedere slabă pe întuneric și îngustarea câmpului vizual sau cu un diagnostic de retinită pigmentară; medicul genetician stabilește, la consultație, dacă este testul potrivit.

Ce analizează

Un panel genetic analizează deodată mai multe gene care pot cauza aceleași semne sau aceeași problemă de sănătate. Secvențierea de nouă generație (NGS) citește în paralel ADN-ul acestor gene, mai ales porțiunile care conțin instrucțiunile pentru proteine (exonii). Testul caută variantele cu care persoana s-a născut, fie moștenite, fie apărute pentru prima dată la ea. Fiecare variantă se clasifică după criterii internaționale, de la fără efect (benignă) la cauzatoare de boală (patogenă), și se interpretează împreună cu istoricul personal și al familiei.

Testul analizează 123 de gene, prin secvențiere de nouă generație (NGS) și prin analiza fragmentelor de ADN lipsă sau în plus (CNV).

Pentru cine este

• Vedere slabă pe întuneric apărută în copilărie sau în adolescență, urmată de pierderea treptată a câmpului vizual periferic (vedere „în tunel”).
• Diagnostic de retinită pigmentară pus de medicul oftalmolog, la care se caută cauza genetică.
• Retinită pigmentară ca parte a unui sindrom, de exemplu sindromul Usher, cu pierderea auzului, sau sindromul Bardet-Biedl; panelul cuprinde doar o parte dintre genele acestor sindroame, așa că uneori se potrivește mai bine un panel dedicat.
• Familie cu retinită pigmentară, când varianta nu este cunoscută; dacă e cunoscută, rudele pot face doar testul țintit pentru ea.

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv: s-a găsit o variantă care cauzează boala (patogenă); rezultatul poate confirma forma genetică a bolii și arată cum se moștenește în familie. Pentru o formă rară, cu variante în ambele copii ale genei RPE65, există o terapie genică aprobată în Uniunea Europeană, pentru pacienții care mai au suficiente celule ale retinei funcționale.
• Negativ: în genele analizate nu s-a găsit o variantă care să explice boala. Rezultatul nu exclude o cauză genetică în alte gene sau de un tip pe care testul nu îl vede. În practica noastră, dacă suspiciunea rămâne, pasul următor pe care îl discutăm de obicei la consultație este secvențierea întregului genom (WGS).
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o modificare despre care nu se știe încă dacă are vreun efect. Până se lămurește, nu se folosește pentru decizii medicale. Uneori o lămurește testarea părinților sau a altor rude, iar cu timpul poate fi reclasificată.

Ce nu poate detecta

Ca orice panel, testul nu poate arăta:

• variantele din genele care nu sunt incluse în panel și cauzele genetice încă necunoscute;
• modificările apărute în timpul vieții doar într-un țesut, de exemplu într-o tumoră (variante somatice);
• de obicei, dacă și când vor apărea semnele sau cât de severe vor fi: aceeași variantă se poate manifesta diferit în aceeași familie.

Cum se face

Proba este de sânge, 1 ml, recoltat într-un tub cu anticoagulant (EDTA). Rezultatul este gata în aproximativ 15–30 de zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) și analiză CNV; printre metodele testului, laboratorul mai trece S-SEQ și MLPA
• Gene (123): caută în lista genelor
• Probă: sânge recoltat pe EDTA (1 ml)
• Durată: 15–30 de zile lucrătoare

Context clinic

• Terapia genică: voretigene neparvovec, autorizat de EMA în 2018 pentru distrofia retiniană ereditară cu variante bialelice confirmate în RPE65, la pacienții cu suficiente celule retiniene viabile. RPE65 este în panel.
• Gena C8orf37 apare în lista panelului sub simbolul ei vechi; simbolul actual este CFAP418 (HGNC:27232).
• Sindroame: dintre genele sindromului Usher, panelul cuprinde MYO7A, USH1C, USH1G și WHRN, dar nu și PCDH15, CDH23 și ADGRV1; dintre genele sindromului Bardet-Biedl, cuprinde BBS1, BBS2, ARL6 și TTC8, dar nu și BBS10.
• Conform MedlinePlus, RHO, USH2A și RPGR sunt printre cele mai frecvente cauze (RHO în forma dominantă, USH2A în cea recesivă, RPGR în cea legată de X); toate trei sunt în panel.