Pe scurt
Adaugă secvențierea ARN-ului tumoral, ca să arate ce gene importante pentru tratament au o activitate anormal de mare sau de mică (expresie anormală). Rezultatele intră în același raport cu analiza genetică a tumorii.
Ce adaugă
ADN-ul arată ce s-a schimbat în gene. ARN-ul arată cât de activă este fiecare genă, adică cât de mult din mesajul ei produce tumora. O genă poate fi foarte activă fără o mutație vizibilă în ADN, iar unele ținte de tratament depind tocmai de această activitate.
Analiza citește ARN-ul din aceeași probă și compară activitatea genelor relevante cu cea din alte tumori de același tip și de alte tipuri, dintr-o colecție mare de tumori analizate anterior în același fel. Rezultatul poate confirma la nivel de ARN o modificare găsită în ADN, poate sugera, pentru verificare, o colorație cu anticorpi (imunohistochimie) și poate arăta posibile ținte de tratament, chiar când ADN-ul nu are mutații relevante.
O genă foarte activă nu dovedește singură că un tratament va funcționa. Interpretarea o face medicul oncolog, împreună cu restul rezultatelor.
Când se alege
- Profil genetic fără ținte clare de tratament.
- Tumoră rară, pentru care se caută orice informație utilă despre ținte.
- Medicul oncolog vrea să confirme la nivel de ARN o modificare găsită în ADN.
Pentru medici
- Metodă: secvențierea transcriptomului din ARN-ul aceleiași probe tumorale; gene relevante pentru tratament examinate pentru expresie aberantă.
- Raport: valori de expresie (FPKM) față de cohorta internă a laboratorului (aceeași entitate tumorală și alte entități), cu grafice de distribuție; strategiile terapeutice posibile apar în lista de medicamente din anexă.
- Probă: țesut FFPE, aceeași cu a testului de bază.
- Durată: se comunică la consultație.
Surse
- ESMO Precision Medicine Working Group: Mosele MF și colab., Recommendations for the use of next-generation sequencing (NGS) for patients with advanced cancer in 2024, Ann Oncol 2024;35(7):588-606, https://doi.org/10.1016/j.annonc.2024.04.005
