Analiza a 50 de mutații frecvente în gena CFTR (fibroză chistică)

Pe scurt

Testul caută 50 dintre cele mai frecvente variante din gena CFTR care cauzează fibroza chistică (mucoviscidoza) și arată dacă o persoană poartă una dintre ele, fără să citească întreaga genă. Se folosește în situații limitate, de exemplu pentru partenerul unui purtător sau într-o populație în care câteva variante moștenite de la strămoși comuni (variante fondatoare) sunt frecvente. Pentru diagnostic, la o persoană cu semne de boală, alegem la consultație secvențierea genei CFTR sau secvențierea întregului genom (WGS).

Ce analizează

Gena CFTR conține instrucțiunile pentru un canal care transportă clorul prin membrana celulelor și menține echilibrul dintre sare și apă în plămâni, pancreas, intestin și glandele sudoripare. Fibroza chistică se moștenește autozomal recesiv: apare când ambele copii ale genei au variante care cauzează boala. Părinții unui copil afectat sunt, de obicei, purtători sănătoși.

Testul nu citește gena literă cu literă. Verifică, prin PCR și analiză de fragmente, dacă una dintre cele 50 de variante este prezentă. Variantele care nu sunt pe listă nu se văd.

Pentru cine este

• Partener al unui purtător cunoscut de variantă CFTR, care vrea o primă evaluare a riscului pentru copii.
• Persoană dintr-o populație în care câteva variante fondatoare explică majoritatea cazurilor de fibroză chistică, care vrea să afle dacă este purtătoare.

Ce poate arăta rezultatul

O variantă. Înseamnă statut de purtător. Dacă și partenerul este purtător, la fiecare sarcină copilul are o probabilitate de 25% să aibă fibroză chistică, iar la consultație discutăm opțiunile pentru o sarcină.

Două variante. Sunt rare la o persoană fără semne de boală. Rezultatul se discută la consultație, iar diagnosticul se stabilește prin testul sudorii.

Negativ. Niciuna dintre cele 50 de variante nu este prezentă. Probabilitatea de a fi purtător scade, dar nu dispare, pentru că variantele rare nu se văd.

Ce nu poate detecta

• Variantele CFTR care nu sunt pe lista celor 50, inclusiv variantele rare sau specifice unor familii.
• Majoritatea porțiunilor mari lipsă sau în plus din genă (deleții și duplicații).
• Diagnosticul în sine: conform ghidului de consens al Cystic Fibrosis Foundation, diagnosticul se stabilește prin evaluarea funcției CFTR cu testul sudorii.

Cum se face

Proba este de sânge, recoltată într-un centru partener; se pot folosi și ADN deja extras, un frotiu bucal sau salivă. Rezultatul vine, de obicei, în 21 de zile lucrătoare de la sosirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: PCR cu analiză de fragmente
• Variante raportate: 50 de mutații frecvente din gena CFTR
• Gene (1)

  • CFTR
• Probă: sânge periferic pe EDTA (cel puțin 3 ml, cel puțin 1 ml la copii), ADN (cel puțin 20 µl, la 50 ng/µl), frotiu bucal sau salivă (conform instrucțiunilor kitului)
• Durată: 21 de zile lucrătoare

Context clinic

• GeneReviews recomandă secvențierea CFTR ca prim test genetic de diagnostic și rezervă analiza țintită pentru populațiile cu variante fondatoare.
• Testul se oferă doar în situații limitate: screeningul de purtător al partenerului unui purtător cunoscut și populațiile cu variante fondatoare. Diagnosticul, inclusiv absența congenitală a canalelor deferente, merge la secvențierea CFTR cu analiza CNV sau la WGS.