Analiza delețiilor și duplicațiilor genelor MUTYH și GREM1 (polipoză adenomatoasă familială tip 2)

Pe scurt

Testul caută, prin MLPA, porțiuni mari care lipsesc sau sunt dublate (deleții și duplicații) în genele MUTYH și GREM1. Nu citește gena literă cu literă, ci completează secvențierea: e util când la o persoană cu polipi secvențierea a găsit o singură variantă MUTYH sau când se suspectează polipoza mixtă ereditară. Testul se alege la consultația de genetică medicală.

Ce analizează

Gena MUTYH repară un anumit tip de deteriorare a ADN-ului, produsă de oxidare. În polipoza asociată MUTYH (numită și polipoză adenomatoasă familială tip 2), ambele copii ale genei sunt modificate, câte una moștenită de la fiecare părinte. Părinții, care au o singură copie modificată, sunt de obicei purtători sănătoși.

Gena GREM1 controlează creșterea celulelor din mucoasa intestinului. În polipoza mixtă ereditară, o porțiune de ADN din fața genei este dublată, iar gena devine prea activă în colon. Aici o singură copie modificată ajunge pentru boală. Descrierea testului numește ambele gene, dar nu precizează dacă analiza acoperă și această porțiune din fața genei GREM1; o confirmăm înainte de comandă.

Testul folosește MLPA, o metodă care măsoară câte copii are fiecare porțiune a genei: o porțiune care lipsește dă un semnal la jumătate, iar una dublată dă un semnal mai mare.

Pentru cine este

• polipi adenomatoși numeroși, la care secvențierea genei MUTYH a găsit o singură variantă, iar a doua se caută în continuare;
• polipoză adenomatoasă la care secvențierea genelor de polipoză nu a găsit cauza, când analiza nu a inclus delețiile și duplicațiile;
• polipi de tipuri diferite în colon (adenomatoși, hiperplastici, serați), la tine și la rude de pe aceeași parte a familiei;
• rudă a unei persoane la care s-a găsit o deleție MUTYH sau duplicația GREM1.

Ce poate arăta rezultatul

• Deleție sau duplicație în MUTYH, alături de o altă variantă MUTYH: confirmă polipoza asociată MUTYH, dacă cele două modificări sunt pe copii diferite ale genei; testarea părinților poate lămuri acest lucru. Conform GeneReviews, frații au fiecare o șansă de 25% să aibă boala, iar colonoscopiile încep la 25–30 de ani.
• O singură modificare MUTYH: înseamnă statutul de purtător. Potrivit GeneReviews, riscul de cancer colorectal este doar ușor crescut, iar colonoscopiile se fac după istoricul familial.
• Duplicația GREM1: confirmă polipoza mixtă ereditară, o boală dominantă: fiecare copil are o șansă de 50% să moștenească duplicația.
• Negativ: nu s-a găsit o deleție sau o duplicație. Nu exclude variantele mici, care se văd doar la secvențiere, și nici alte gene. Dacă suspiciunea de polipoză ereditară rămâne, în practica noastră discutăm la consultație secvențierea întregului genom (WGS).

Ce nu poate detecta

• schimbările unei singure „litere” (variante punctiforme) și mici fragmente în plus sau lipsă (inserții sau deleții) din MUTYH, care cer secvențierea genei;
• genele altor polipoze (APC, POLE, POLD1, NTHL1 și altele);
• fragmentele de ADN care și-au schimbat locul fără să lipsească sau să fie în plus (rearanjamentele echilibrate), pentru că nu schimbă numărul de copii;
• pe ce copie a genei se află fiecare modificare; pentru asta se testează părinții.

Cum se face

Proba este de sânge din venă, recoltat pe EDTA într-un centru partener; laboratorul acceptă și salivă, frotiu bucal sau ADN deja extras. Rezultatul vine, de obicei, în 21 de zile lucrătoare de la sosirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: MLPA
• Variante raportate: deleții și duplicații în genele MUTYH și GREM1
• Probă: sânge periferic recoltat pe EDTA, cel puțin 3 ml (cel puțin 1 ml la copii); se acceptă și ADN extras (cel puțin 20 µl, la 50 ng/µl), frotiu bucal sau salivă (după instrucțiunile kitului)
• Durată: 21 de zile lucrătoare