Panel genetic pentru cancer colorectal ereditar, 17 gene

Pe scurt

Panelul analizează 17 gene asociate cu cancerul colorectal ereditar și cu sindroamele de polipoză: sindromul Lynch, polipoza adenomatoasă familială, polipoza asociată MUTYH și polipozele cu polipi de tip hamartom (hamartomatoase). Se adresează persoanelor cu cancer colorectal sau endometrial la vârstă tânără, cu mulți polipi la colonoscopie ori cu mai multe rude cu astfel de cancere. Testul se alege la consultația de genetică medicală.

Ce analizează

Fiecare genă există în două copii, una de la mamă și una de la tată. Multe dintre genele din panel repară greșelile apărute la copierea ADN-ului; când o copie nu funcționează, celulele intestinului acumulează mai ușor modificări, iar polipii și cancerul apar mai devreme.

Testul citește porțiunile celor 17 gene care conțin instrucțiunile pentru proteine (regiunile codante), prin secvențiere de nouă generație (NGS). Caută schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme), mici fragmente în plus sau lipsă (inserții și deleții) și porțiuni mai mari lipsă sau în plus (deleții și duplicații). Panelul cuprinde:

• genele sindromului Lynch: MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 și EPCAM;
• genele polipozelor adenomatoase: APC, MUTYH, POLE, POLD1;
• genele polipozelor hamartomatoase: STK11 (Peutz-Jeghers), SMAD4 și BMPR1A (polipoza juvenilă), PTEN (Cowden);
• GREM1, CDH1, TP53 și CHEK2.

Pentru cine este

• cancer colorectal sau endometrial diagnosticat la vârstă tânără;
• tumoră colorectală sau endometrială la care analiza tumorii a sugerat sindromul Lynch;
• mulți polipi adenomatoși, adunați la colonoscopii repetate, sau polipi hamartomatoși;
• mai multe rude cu cancer colorectal, endometrial sau alte cancere din spectrul Lynch, pe aceeași parte a familiei.

Rudele fără simptome pot face testul țintit pentru varianta din familie, după ce persoana afectată a fost testată; dacă ea a decedat fără test, se analizează întâi ADN-ul păstrat de la ea, când există.

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv, sindrom Lynch: o variantă care cauzează boala (patogenă) într-o genă de reparare a ADN-ului. Conform GeneReviews, supravegherea prin colonoscopie, cu frecvența stabilită după genă și istoricul familial, permite îndepărtarea polipilor înainte să devină cancer; riscul ginecologic se discută separat.
• Pozitiv, polipoză: de exemplu o variantă APC sau două variante MUTYH (o boală recesivă, în care ai moștenit câte o variantă de la fiecare părinte). Planul de supraveghere și, uneori, chirurgia se stabilesc cu gastroenterologul.
• O singură variantă MUTYH: ești purtător. Potrivit GeneReviews, riscul de cancer colorectal este doar ușor crescut, dar rezultatul contează pentru frați și pentru partener.
• Negativ: dacă în familie e cunoscută o variantă și tu nu o ai, riscul tău e apropiat de cel al populației generale; altfel, colonoscopiile se fac după istoricul familial. Dacă suspiciunea de cancer ereditar rămâne, în practica noastră discutăm la consultație secvențierea întregului genom (WGS).
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o modificare despre care nu se știe încă dacă crește riscul. Până se lămurește, nu se folosește pentru decizii, iar cu timpul poate fi reclasificată.

Ce nu poate detecta

• modificările apărute doar în tumoră, care pot explica deficitul MMR fără o cauză moștenită;
• genele unor polipoze rare care nu sunt în panel (de exemplu NTHL1 sau MSH3);
• unele regiuni greu de citit, ca porțiunile repetitive sau pseudogenele;
• variantele mici din EPCAM și GREM1 (la ele se caută doar deleții și duplicații);
• modificările prezente doar într-o mică parte dintre celule (mozaicism de nivel scăzut);
• riscul adunat din multe variante comune (polimorfismele); testul nu spune dacă și când va apărea un cancer.

Cum se face

Proba este un frotiu bucal (de pe interiorul obrazului), recoltat de medic după instrucțiunile din kit. Rezultatul vine, de obicei, în 10–15 zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Prețul include consultația de genetică medicală dinainte de test, interpretarea rezultatului și consultația de după, în care discutăm controalele recomandate și testarea rudelor.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) cu îmbogățire țintită prin captură, pe toate regiunile codante ale genelor și pe secvențele necodante adiacente
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV); mici inserții și deleții (indeli), de până la 50 de perechi de baze; deleții și duplicații (CNV); cele pozitive se confirmă printr-o metodă independentă
• Gene (17)

  • APC
  • BMPR1A
  • CDH1
  • CHEK2
  • EPCAM
  • GREM1
  • MLH1
  • MSH2
  • MSH6
  • MUTYH
  • PMS2
  • POLD1
  • POLE
  • PTEN
  • SMAD4
  • STK11
  • TP53
• Probă: frotiu bucal (recoltat de medic după instrucțiunile primite)
• Durată: 10–15 zile lucrătoare

Context clinic

• Pe tumoră, imunohistochimia proteinelor MMR sau instabilitatea microsateliților orientează spre testare; metilarea promotorului MLH1 sau variantele somatice pot explica deficitul MMR fără o cauză moștenită.