Panel genetic pentru cancer gastric ereditar, 14 gene

Pe scurt

Panelul analizează 14 gene asociate cu predispoziția moștenită pentru cancerul gastric: gena cancerului gastric difuz ereditar (CDH1), genele sindromului Lynch și genele unor sindroame cu polipi sau tumori ale stomacului. Se adresează persoanelor cu cancer gastric la vârstă tânără și familiilor în care cancerul de stomac se repetă. Testul se alege la consultația de genetică medicală.

Ce analizează

Cele mai multe cancere de stomac nu sunt moștenite. În unele familii însă, o variantă moștenită într-o singură copie a unei gene crește mult riscul, uneori și pentru cancerul de sân lobular, cancerul colorectal sau alte tumori.

Testul citește porțiunile genelor care conțin instrucțiunile pentru proteine (regiunile codante), prin secvențiere de nouă generație (NGS). Caută schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme), mici fragmente în plus sau lipsă (inserții și deleții) și porțiuni mai mari lipsă sau în plus (deleții și duplicații). Genele țin de câteva sindroame:

• CDH1: cancerul gastric difuz ereditar, asociat și cu cancerul de sân lobular;
• MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 și EPCAM: sindromul Lynch;
• APC: polipoza adenomatoasă familială și forma ei gastrică;
• SMAD4 și BMPR1A: polipoza juvenilă; STK11: sindromul Peutz-Jeghers;
• TP53: sindromul Li-Fraumeni;
• SDHB, SDHC și SDHD: paragangliomul ereditar și unele tumori stromale ale stomacului (GIST).

Pentru cine este

• cancer gastric difuz (cu celule în inel cu pecete) diagnosticat înainte de 50 de ani;
• două sau mai multe cazuri de cancer gastric în familie, dintre care cel puțin unul difuz;
• cancer gastric difuz și cancer de sân lobular la aceeași persoană sau în aceeași familie;
• cancer gastric alături de cancer colorectal sau endometrial în familie;
• polipi multipli în stomac sau în intestin, ori o tumoră stromală gastrică la vârstă tânără.

Primele trei situații corespund criteriilor de testare din ghidul IGCLC 2020 pentru cancerul gastric difuz ereditar. Rudele fără simptome pot face testul țintit pentru varianta din familie, după ce persoana afectată a fost testată; dacă ea a decedat fără test, se analizează întâi ADN-ul păstrat de la ea, când există.

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv în CDH1: conform ghidului IGCLC 2020, gastrectomia totală profilactică rămâne opțiunea recomandată, iar supravegherea endoscopică în centre cu experiență poate fi oferită celor care vor să amâne operația. La femei se recomandă și supravegherea sânilor. Decizia se ia individual, cu o echipă multidisciplinară.
• Pozitiv în alte gene: varianta orientează supravegherea spre stomac, colon sau alte organe, după sindrom.
• Negativ: dacă în familie e cunoscută o variantă și tu nu o ai, riscul tău e apropiat de cel al populației generale; altfel, endoscopiile se fac după istoricul familial. Dacă suspiciunea de cancer ereditar rămâne, în practica noastră discutăm la consultație secvențierea întregului genom (WGS).
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o modificare despre care nu se știe încă dacă are vreun efect. Până se lămurește, nu se folosește pentru decizii, iar cu timpul poate fi reclasificată.

Ce nu poate detecta

• CTNNA1, o genă găsită într-o mică parte dintre familiile cu cancer gastric difuz ereditar: pentru familiile care îndeplinesc criteriile IGCLC, panelul HT-0300 o include;
• genele BRCA1, BRCA2, PALB2 și ATM, care nu sunt în panel;
• variantele mici din EPCAM, unde se caută doar fragmentele lipsă sau în plus (deleții și duplicații);
• unele regiuni greu de citit ale genomului;
• modificările prezente doar într-o mică parte dintre celule (mozaicism de nivel scăzut);
• cauzele negenetice ale cancerului gastric, ca infecția cu Helicobacter pylori;
• modificările apărute doar în tumoră;
• riscul adunat din multe variante comune (polimorfismele); testul nu spune dacă și când va apărea un cancer.

Cum se face

Proba este un frotiu bucal (de pe interiorul obrazului), recoltat de medic după instrucțiunile din kit. Rezultatul vine, de obicei, în 10–15 zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Prețul include consultația de genetică medicală dinainte de test, interpretarea rezultatului și consultația de după, în care discutăm supravegherea și testarea rudelor.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) cu îmbogățire țintită prin captură, pe toate regiunile codante ale genelor și pe secvențele necodante adiacente
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV); mici inserții și deleții (indeli), de până la 50 de perechi de baze; deleții și duplicații (CNV); cele pozitive se confirmă printr-o metodă independentă
• Gene (14)

  • APC
  • BMPR1A
  • CDH1
  • EPCAM
  • MLH1
  • MSH2
  • MSH6
  • PMS2
  • SDHB
  • SDHC
  • SDHD
  • SMAD4
  • STK11
  • TP53
• Probă: frotiu bucal (recoltat de medic după instrucțiunile primite)
• Durată: 10–15 zile lucrătoare

Context clinic

• Criteriile de testare IGCLC 2020 (Blair 2020), după confirmarea diagnosticelor; rudele din criteriile familiale sunt de gradul I sau II între ele. Familiale: (1) cel puțin două cancere gastrice în familie, indiferent de vârstă, cel puțin unul difuz; (2) cel puțin un cancer gastric difuz la orice vârstă și cel puțin un cancer de sân lobular sub 70 de ani, la persoane diferite; (3) cel puțin două cancere de sân lobulare sub 50 de ani. Individuale: (4) cancer gastric difuz sub 50 de ani; (5) cancer gastric difuz la orice vârstă la persoanele de etnie maori; (6) cancer gastric difuz la orice vârstă, cu despicătură labială sau palatină personală ori la o rudă de gradul I; (7) cancer gastric difuz și cancer de sân lobular, ambele sub 70 de ani; (8) cancer de sân lobular bilateral sub 70 de ani; (9) celule în inel cu pecete in situ sau cu extindere pagetoidă în stomac, sub 50 de ani.
• Conform IGCLC 2020, la cei care îndeplinesc criteriile se analizează întâi CDH1, apoi CTNNA1; acest panel nu conține CTNNA1.