Panel genetic pentru cancer colorectal ereditar cu risc înalt, 10 gene

Pe scurt

Panelul analizează cele 10 gene cu risc înalt de cancer colorectal ereditar: genele sindromului Lynch, gena polipozei adenomatoase familiale (APC), gena MUTYH și genele a două boli cu polipi de alt tip (polipoze hamartomatoase). Se adresează persoanelor cu cancer colorectal la vârstă tânără, cu mulți polipi sau cu o familie în care cancerul colorectal se repetă. Testul se alege la consultația de genetică medicală.

Ce analizează

Unele dintre genele panelului repară greșelile apărute la copierea ADN-ului, altele controlează creșterea celulelor din mucoasa intestinului. Când una dintre cele două copii ale unei gene nu funcționează de la naștere, polipii și cancerul pot apărea mai devreme.

Testul citește porțiunile genelor care conțin instrucțiunile pentru proteine (regiunile codante), prin secvențiere de nouă generație (NGS). Caută schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme), mici fragmente de ADN în plus sau lipsă (inserții sau deleții) și fragmente mai mari lipsă sau în plus (deleții sau duplicații). Panelul cuprinde:

• sindromul Lynch: MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 și EPCAM (o deleție în EPCAM poate opri gena vecină MSH2);
• polipoza adenomatoasă familială: APC;
• polipoza asociată MUTYH, o boală recesivă: MUTYH;
• polipoza juvenilă: SMAD4 și BMPR1A;
• sindromul Peutz-Jeghers: STK11.

Pentru cine este

• cancer colorectal sau endometrial diagnosticat la vârstă tânără;
• tumoră colorectală la care analiza tumorii a sugerat sindromul Lynch;
• zeci de polipi adenomatoși, adunați la colonoscopii repetate;
• polipi juvenili sau de tip Peutz-Jeghers, uneori cu pete pigmentate pe buze;
• mai multe rude cu cancer colorectal sau endometrial, pe aceeași parte a familiei.

Rudele fără simptome pot face testul țintit pentru varianta din familie, după ce persoana afectată a fost testată; dacă ea a decedat fără test, se analizează întâi ADN-ul păstrat de la ea, când există.

Ce poate arăta rezultatul

• Pozitiv, sindrom Lynch: o variantă care cauzează boala (patogenă) într-o genă de reparare a ADN-ului. Conform GeneReviews, colonoscopiile regulate permit îndepărtarea polipilor înainte să devină cancer; riscul ginecologic se discută separat.
• Pozitiv, polipoză: o variantă în APC, STK11, SMAD4 sau BMPR1A ori două variante în MUTYH, câte una de la fiecare părinte. Planul de supraveghere și, uneori, chirurgia se stabilesc cu gastroenterologul.
• O singură variantă MUTYH: ești purtător; riscul de cancer colorectal este doar ușor crescut, dar rezultatul contează pentru frați și partener.
• Negativ: dacă în familie e cunoscută o variantă și tu nu o ai, riscul tău e apropiat de cel al populației generale; altfel, colonoscopiile se fac după istoricul familial. Dacă suspiciunea de cancer ereditar rămâne, în practica noastră discutăm la consultație secvențierea întregului genom (WGS).
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o modificare despre care nu se știe încă dacă are vreun efect. Până se lămurește, nu se folosește pentru decizii, iar cu timpul poate fi reclasificată.

Ce nu poate detecta

• genele cu risc mai rar întâlnit, care sunt în panelul de 17 gene: POLE și POLD1, GREM1, PTEN, CDH1, TP53 și CHEK2;
• variantele mici din EPCAM, unde se caută doar fragmentele lipsă sau în plus (deleții și duplicații);
• un semn chimic prezent de la naștere care oprește gena MLH1 (metilarea constituțională a promotorului MLH1), care cere o analiză separată;
• modificările apărute doar în tumoră, care pot explica o reparare deficitară a ADN-ului în tumoră (deficit MMR) fără o cauză moștenită;
• unele regiuni greu de citit ale genomului;
• modificările prezente doar într-o mică parte dintre celule (mozaicism de nivel scăzut);
• riscul adunat din multe variante comune (polimorfismele); testul nu spune dacă și când va apărea un cancer.

Cum se face

Proba este un frotiu bucal (de pe interiorul obrazului), recoltat de medic după instrucțiunile din kit. Rezultatul vine, de obicei, în 10–15 zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Prețul include consultația de genetică medicală dinainte de test, interpretarea rezultatului și consultația de după, în care discutăm controalele recomandate și testarea rudelor.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) cu îmbogățire țintită prin captură, pe toate regiunile codante ale genelor și pe secvențele necodante adiacente
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV); mici inserții și deleții (indeli), de până la 50 de perechi de baze; deleții și duplicații (CNV); cele pozitive se confirmă printr-o metodă independentă
• Gene (10)

  • APC
  • BMPR1A
  • EPCAM
  • MLH1
  • MSH2
  • MSH6
  • MUTYH
  • PMS2
  • SMAD4
  • STK11
• Probă: frotiu bucal (recoltat de medic după instrucțiunile primite)
• Durată: 10–15 zile lucrătoare

Context clinic

• Pe tumoră, imunohistochimia proteinelor MMR sau instabilitatea microsateliților orientează spre testare; metilarea promotorului MLH1 sau variantele somatice pot explica deficitul MMR fără o cauză moștenită.