Analiza mutațiilor somatice KIT pe țesut tumoral (tumoră stromală gastrointestinală)

Pe scurt

Testul caută, prin secvențiere de nouă generație (NGS), mutațiile din gena KIT în țesutul unei tumori stromale gastrointestinale (GIST). Rezultatul confirmă tipul tumorii și ajută la alegerea tratamentului țintit, inclusiv a dozei. Se alege împreună cu medicul oncolog și cu medicul genetician.

Ce analizează

GIST este o tumoră rară a tubului digestiv, care pornește din celulele ce coordonează mișcările intestinului. În multe GIST, o mutație în gena KIT ține permanent activ un receptor de creștere de pe suprafața celulei. Tratamentele țintite din această clasă blochează receptorul.

Testul citește prin secvențiere de nouă generație (NGS) exonii 8, 9, 10, 11, 13, 17 și 18 ai genei KIT, din ADN extras din țesutul tumoral. Mutațiile prezente la diagnostic sunt, de obicei, în exonii 11 și 9. În exonii 13, 17 și 18 apar mai rar la diagnostic, dar pot apărea sub tratament și explică atunci rezistența.

Pentru cine este

• GIST nou diagnosticat, înaintea deciziei despre tratamentul țintit după operație;
• GIST metastatic sau inoperabil, înaintea primului tratament;
• diagnostic de GIST neclar la analizele de rutină ale țesutului, când o mutație KIT îl poate confirma;
• GIST care progresează sub tratamentul țintit, pe o biopsie nouă, când oncologul caută mutații de rezistență;
• leucemie mieloidă acută, leucemie cu mastocite sau melanom, când medicul are nevoie de statusul KIT pentru diagnostic, încadrare sau tratament.

Conform ghidului ESMO-EURACAN-GENTURIS din 2022, analiza mutațiilor face parte din diagnosticul tuturor GIST, cu posibila excepție a celor sub 2 cm din afara rectului, care foarte probabil nu vor avea nevoie de tratament medicamentos.

Ce poate arăta rezultatul

• Mutație în exonul 11. Tumora este, de regulă, sensibilă la tratamentul țintit standard, în doza obișnuită.
• Mutație în exonul 9. Conform aceluiași ghid, în boala avansată tratamentul de primă linie se face cu o doză mai mare.
• Mutații noi în exonii 13, 17 sau 18, apărute sub tratament. Pot explica rezistența la tratament; oncologul discută alt medicament.
• Nicio mutație KIT. Urmează analiza genei PDGFRA și, dacă și ea este normală, căutarea unui deficit SDH. GIST-urile cu deficit SDH răspund de obicei slab la tratamentul țintit standard, iar unele au o cauză moștenită.
• Variantă de semnificație incertă (VUS). Nu se știe încă dacă modificarea contează, deci nu se folosește singură pentru decizii.

Ce nu poate detecta

• mutațiile genei PDGFRA, a doua genă implicată în GIST, analizate de panelul GIST pe țesut (HT-0206); mutația PDGFRA D842V, de exemplu, are alt tratament de primă linie;
• deficitul SDH, mutațiile BRAF, formele asociate neurofibromatozei de tip 1 și fuziunile NTRK, rare în GIST;
• mutațiile prezente într-o fracțiune mică de celule, când proba are puține celule tumorale;
• dacă o mutație este moștenită; formele familiale de GIST cu mutații KIT sunt foarte rare.

Cum se face

De obicei nu e nevoie de o recoltare nouă: se folosește blocul de parafină din biopsie sau din operație, păstrat de serviciul de anatomie patologică, ori 4–6 secțiuni din el, împreună cu buletinul histopatologic. Se acceptă și țesut tumoral proaspăt, sânge, măduvă osoasă sau ADN deja extras; medicul genetician îți spune ce probă se potrivește în cazul tău. Rezultatul vine, de obicei, în 21 de zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) a exonilor 8, 9, 10, 11, 13, 17 și 18
• Variante raportate: mutații în exonii 8, 9, 10, 11, 13, 17 și 18 ai genei KIT
• Gene (1)

  • KIT
• Probă: țesut tumoral fixat în formol și inclus în parafină (bloc FFPE sau 4–6 secțiuni) sau țesut proaspăt (cel puțin 1 cm²); se acceptă și sânge periferic pe EDTA (cel puțin 3 ml, cel puțin 1 ml la copii), măduvă osoasă pe EDTA (cel puțin 1 ml) sau ADN extras (cel puțin 20 µl, la 50 ng/µl)
• Durată: 21 de zile lucrătoare

Context clinic

• Tratamentul țintit standard este imatinibul. Conform ESMO-EURACAN-GENTURIS 2022, în boala avansată cu mutație în exonul 9 prima linie este imatinib 800 mg pe zi, iar PDGFRA D842V nu răspunde la imatinib și are ca primă linie avapritinibul.
• După un rezultat KIT negativ urmează analiza PDGFRA și imunohistochimia SDHB; panelul HT-0206 acoperă KIT, PDGFRA, BRAF și genele SDH.