Panel de mutații somatice pe țesut tumoral pentru cancer de sân și ovar

Pe scurt

Panelul analizează, în ADN-ul extras din tumora de sân sau de ovar, 15 gene importante pentru alegerea tratamentului, între care BRCA1, BRCA2, PIK3CA, AKT1, PTEN și ESR1. Rezultatul ajută medicul oncolog să vadă dacă există o opțiune de terapie țintită. Se face pe țesutul deja recoltat la biopsie sau la operație.

Ce analizează

Celulele unei tumori acumulează modificări în ADN care nu există în restul corpului. Ele se numesc mutații somatice și nu se moștenesc. Unele țin tumora în creștere, iar câteva pot fi blocate de medicamente țintite.

Testul citește prin secvențiere de nouă generație (NGS) porțiunile celor 15 gene care conțin instrucțiunile pentru proteine (regiunile codante). Caută schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme) și mici fragmente în plus sau lipsă (inserții sau deleții), prezente în cel puțin 5% din ADN-ul analizat (frecvență alelică); variantele cunoscute se raportează de la 2%. Genele formează câteva grupe: repararea ADN-ului (BRCA1, BRCA2, PALB2, ATM, BARD1, BRIP1, CHEK2, RAD51C, RAD51D), calea PI3K/AKT (PIK3CA, AKT1, PTEN), receptorul de estrogen (ESR1), ERBB2 (HER2) și TP53. În plus, testul verifică un set de rearanjamente (fuziuni) cu relevanță pentru tratament în genele ALK, BRAF, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, RET și ROS1.

Pentru cine este

• cancer de sân avansat sau metastatic, cu receptori hormonali pozitivi și HER2 negativ, când medicul oncolog caută mutații PIK3CA, AKT1 sau PTEN;
• cancer de sân metastatic tratat hormonal, când se pune întrebarea mutațiilor ESR1;
• cancer ovarian epitelial de grad înalt, când e nevoie de statusul BRCA al tumorii;
• cancer de sân sau ovarian care a progresat sub tratament, când se caută o opțiune țintită sau un studiu clinic.

Recomandările ESMO din 2024 includ cancerul ovarian avansat și cancerul de sân avansat printre tumorile la care secvențierea NGS a tumorii se face de rutină.

Ce poate arăta rezultatul

• Variantă patogenă BRCA1, BRCA2 sau în altă genă de reparare: în cancerul ovarian poate deschide un tratament țintit de întreținere. În cancerul de sân, rolul ei pentru tratament se discută de la caz la caz. Varianta poate fi și moștenită, așa că o confirmăm printr-un test din sânge.
• Mutație PIK3CA, AKT1 sau PTEN: în cancerul de sân cu receptori hormonali pozitivi și HER2 negativ, poate permite un tratament țintit pe calea PI3K/AKT, asociat terapiei hormonale. Conform ghidului ESMO pentru cancerul de sân metastatic, testarea PIK3CA se recomandă în acest grup.
• Mutație ESR1: arată o rezistență a tumorii la unele tratamente hormonale și poate orienta alegerea altui tratament hormonal.
• Nicio variantă relevantă: tratamentul se alege după celelalte caracteristici ale tumorii.
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o variantă despre care nu se știe încă dacă are vreun efect; până se lămurește, nu se folosește pentru decizii medicale.

Ce nu poate detecta

• statusul HER2 și al receptorilor hormonali, care se stabilesc prin analize separate ale țesutului;
• scorul care arată dacă unul dintre mecanismele de reparare a ADN-ului e slăbit (deficitul de recombinare omoloagă, HRD), folosit în cancerul ovarian;
• amplificările și delețiile mari de gene, inclusiv delețiile mari din BRCA1 și BRCA2, care nu fac parte din analiza descrisă;
• mutațiile ESR1 apărute după recoltarea probei, dacă se folosește un țesut vechi;
• originea unei variante: testul pe tumoră nu poate spune singur dacă varianta a apărut doar în tumoră (somatică) sau este moștenită (germinală).

Cum se face

De obicei nu e nevoie de o recoltare nouă: se folosește blocul de parafină din biopsie sau din operație, păstrat de serviciul de anatomie patologică, împreună cu buletinul histopatologic. Se pot trimite și secțiuni nevopsite din bloc sau ADN extras din tumoră. Proba trebuie să conțină cel puțin 20% celule tumorale. Durata ți-o comunicăm la consultație. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) cu îmbogățire prin hibridizare în soluție a regiunilor codante și a regiunilor intronice adiacente, pe ADN tumoral, cu acoperire medie de 1.000x
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV) și mici inserții sau deleții cu frecvență alelică de cel puțin 5%, în regiunile codante și în regiunile intronice adiacente (±8 perechi de baze); variantele hotspot cunoscute, de la 2%; variante structurale (fuziuni) selectate, cu relevanță terapeutică, în genele ALK, BRAF, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, RET și ROS1; statusul de instabilitate a microsateliților (MSI), doar dacă se cere separat
• Gene (15)

  • AKT1
  • ATM
  • BARD1
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • CHEK2
  • ERBB2
  • ESR1
  • PALB2
  • PIK3CA
  • PTEN
  • RAD51C
  • RAD51D
  • TP53
• Probă: țesut tumoral cu cel puțin 20% celule tumorale (bloc FFPE, recomandat, sau cel puțin 10 secțiuni FFPE necolorate de 10 µm, ori ADN tumoral peste 200 ng); pentru analiza MSI este nevoie și de țesut normal (1–2 ml sânge pe EDTA, recomandat)
• Durată: se comunică la consultație

Context clinic

• Tratamentul țintit pentru variantele BRCA sunt inhibitorii PARP. În cancerul de sân, beneficiul lor e dovedit mai ales pentru variantele BRCA germinale, de aceea o variantă găsită în tumoră se confirmă în sânge.
• Mutațiile ESR1 apar de obicei sub tratament hormonal, ca mecanism de rezistență, și pot lipsi dintr-o probă recoltată înaintea acestuia. Pentru ele contează o probă recentă, recoltată la progresie; analiza ADN-ului tumoral circulant (biopsia lichidă) este o alternativă la țesut, aleasă la consultație.
• Statusul HER2 și al receptorilor hormonali se stabilește înaintea testului, prin imunohistochimie și, la nevoie, FISH.