Secvențierea genelor BRCA1 și BRCA2 pe țesut tumoral (cancer de sân și ovar)

Pe scurt

Testul citește genele BRCA1 și BRCA2 în ADN-ul din tumoră, de obicei din blocul de parafină păstrat după biopsie sau operație. Caută variantele care pot schimba tratamentul, mai ales în cancerul ovarian. Testul nu spune dacă o variantă găsită este moștenită: pentru asta e nevoie de un test din sânge sau din salivă.

Ce analizează

Genele BRCA1 și BRCA2 ajută celulele să repare rupturile din ADN. O variantă care afectează funcția genei (patogenă) poate fi moștenită, caz în care se află în toate celulele corpului și poate fi transmisă copiilor. Poate apărea însă și doar în celulele tumorii (variantă somatică), caz în care nu se moștenește. În ambele situații, tumora repară mai greu ADN-ul, iar pentru unele cancere există un tratament țintit pentru tumorile cu variante BRCA.

Prin secvențiere de nouă generație (NGS) se citesc porțiunile celor două gene care conțin instrucțiunile pentru proteine (regiunile codante), numai în ADN-ul tumorii. Testul caută schimbările unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme) și micile fragmente în plus sau lipsă (inserții sau deleții), prezente în cel puțin 5% din ADN-ul analizat (frecvență alelică); variantele cunoscute se raportează de la 2%.

Pentru cine este

• cancer ovarian epitelial, inclusiv cancer al trompelor uterine sau peritoneal, când testul pentru variantele moștenite BRCA1 și BRCA2 (testul germinal) nu a găsit o variantă;
• alt cancer, când medicul oncolog ia în calcul un tratament țintit pentru variantele BRCA din tumoră.

Conform ghidului ASCO din 2020, testul germinal pentru BRCA1 și BRCA2 se recomandă tuturor pacientelor cu cancer ovarian epitelial, la diagnostic, iar celor fără o variantă moștenită li se recomandă și testarea BRCA pe tumoră. În cancerul de sân, ghidul ASCO–SSO din 2024 se referă la testul germinal, făcut din sânge sau salivă.

Ce poate arăta rezultatul

• Variantă patogenă în BRCA1 sau BRCA2: poate conta pentru tratament, iar decizia o ia medicul oncolog. Testul nu spune dacă varianta este moștenită; conform recomandărilor ESMO, o astfel de variantă se verifică printr-un test germinal, pentru că, dacă e moștenită, contează și pentru rude.
• Nicio variantă patogenă: în tumoră nu s-a găsit, în limitele testului, o variantă BRCA de tipul celor căutate.
• Variantă de semnificație incertă (VUS): efectul ei nu este încă lămurit. Nu se folosește pentru decizii de tratament și poate fi reclasificată în timp.

Ce nu poate detecta

• dacă o variantă găsită este moștenită sau a apărut doar în tumoră;
• delețiile și duplicațiile mari din BRCA1 și BRCA2: ele se caută în ADN-ul din sânge, în testul pereche tumoră și sânge;
• variantele din alte gene de reparare a ADN-ului, de exemplu PALB2, RAD51C sau RAD51D, pe care le cuprinde panelul tumoral pentru cancer de sân și ovar;
• scorul care arată dacă unul dintre mecanismele de reparare a ADN-ului e slăbit (deficitul de recombinare omoloagă, HRD), un test separat;
• variantele dintr-o probă cu puține celule tumorale sau cu ADN deteriorat, când rezultatul poate fi incomplet.

Cum se face

Testul folosește blocul de parafină din biopsie sau din operație, cu cel puțin 20% celule tumorale, păstrat de serviciul de anatomie patologică, împreună cu buletinul histopatologic. Nu este nevoie de o probă de sânge. Durata ți-o comunicăm la consultație. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) cu îmbogățire prin hibridizare în soluție a regiunilor codante și a regiunilor intronice adiacente, pe ADN-ul extras din țesutul tumoral
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV) și mici inserții sau deleții cu frecvență alelică de cel puțin 5% în tumoră, în regiunile codante și în regiunile intronice adiacente (±8 perechi de baze); variantele hotspot cunoscute, de la 2%
• Gene (2)

  • BRCA1
  • BRCA2
• Probă: țesut tumoral cu cel puțin 20% celule tumorale: bloc FFPE (proba recomandată), cel puțin 10 secțiuni FFPE necolorate de 10 µm sau ADN tumoral peste 200 ng
• Durată: se comunică la consultație

Context clinic

• Tratamentul țintit la care se referă ghidurile este clasa inhibitorilor PARP (de exemplu olaparib). Conform ASCO 2020, pacientelor cu cancer ovarian epitelial și o variantă BRCA1/2 patogenă, germinală sau somatică, li se oferă tratamentele aprobate (FDA) în prima linie și la recidivă. Indicația exactă, pe tip de cancer și linie de tratament, o stabilește medicul oncolog.
• În cancerul de sân, ASCO–SSO 2024 recomandă testarea germinală BRCA1/2 la toate pacientele nou diagnosticate până la 65 de ani, la cele peste 65 de ani selectiv și la toate pacientele cu boală recidivată candidate la un inhibitor PARP. Testul doar pe tumoră nu înlocuiește această testare.
• Conform ESMO Precision Medicine Working Group (Kuzbari 2023), o variantă patogenă BRCA1 sau BRCA2 găsită pe tumoră se verifică germinal indiferent de tipul tumorii; în analiza grupului, peste 80% dintre variantele BRCA1, BRCA2 și PALB2 găsite pe tumoră (după filtrare) erau germinale.
• Testul pereche tumoră și sânge, cu MLPA germinal, este HT-0199; testul germinal BRCA1/2 din frotiu bucal este HT-0293.