Panel de mutații somatice pe țesut tumoral pentru colangiocarcinom

Pe scurt

Panelul caută, în tumora căilor biliare (colangiocarcinom), modificările pentru care există terapii țintite, în primul rând fuziunile genei FGFR2 și mutațiile IDH1. Analizează în total 6 gene, pe țesutul deja recoltat la biopsie sau la operație. Rezultatul ajută medicul oncolog să vadă dacă, pe lângă chimioterapie, există o opțiune de tratament țintit.

Ce analizează

Colangiocarcinomul pornește din celulele canalelor biliare, din ficat sau din afara lui. Celulele tumorii acumulează modificări în ADN care nu există în restul corpului. Ele se numesc somatice și nu se moștenesc. Unele dintre ele pot fi blocate de medicamente țintite.

Testul citește prin secvențiere de nouă generație (NGS) porțiunile care conțin instrucțiunile pentru proteine (regiunile codante) ale genelor FGFR2, IDH1, IDH2, KRAS, PIK3CA și TP53. Caută schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme) și mici fragmente în plus sau lipsă (inserții sau deleții). În plus, verifică un set de rearanjamente (fuziuni) în genele ALK, BRAF, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, RET și ROS1. O fuziune înseamnă că o parte dintr-o genă s-a lipit de o altă genă, iar proteina rezultată rămâne activă permanent.

Pentru cine este

• colangiocarcinom avansat, inoperabil sau metastatic, când medicul oncolog planifică tratamentul;
• colangiocarcinom care a progresat după chimioterapie, când se caută o terapie țintită sau un studiu clinic;
• colangiocarcinom intrahepatic, forma în care fuziunile FGFR2 și mutațiile IDH1 apar cel mai des;
• tumoră a căilor biliare la care oncologul cere un profil molecular țintit pe aceste gene.

Conform ghidului ESMO din 2023, profilul molecular al tumorii se recomandă în cancerul avansat al căilor biliare, iar recomandările ESMO din 2024 includ colangiocarcinomul printre tumorile la care secvențierea NGS a tumorii se face de rutină.

Ce poate arăta rezultatul

• Fuziune FGFR2: poate permite un tratament țintit, de obicei după prima linie de chimioterapie.
• Mutație IDH1: poate permite un tratament țintit.
• Mutații KRAS, TP53, PIK3CA sau IDH2: descriu tumora și pot conta pentru prognostic sau pentru intrarea într-un studiu clinic, dar de obicei nu au un tratament țintit aprobat în colangiocarcinom.
• Nicio modificare găsită: nu s-a găsit o țintă în genele analizate. Alte ținte, din afara panelului, pot exista totuși.
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o variantă despre care nu se știe încă dacă are vreun efect; până se lămurește, nu se folosește pentru decizii medicale.

Ce nu poate detecta

• modificări cu tratament țintit din afara panelului, ca amplificarea HER2, instabilitatea microsateliților (MSI) sau fuziunile NTRK; ele intră într-un profil genomic mai larg al tumorii (HT-0226), care rămâne testul mai complet;
• fuziunile FGFR2 cu parteneri sau puncte de ruptură neobișnuite: căutarea la nivel ADN e țintită, iar absența unei fuziuni nu o exclude complet;
• mutațiile prezente într-o probă cu puține celule tumorale, situație frecventă la biopsiile mici ale căilor biliare;
• originea unei variante: testul pe tumoră nu poate spune singur dacă varianta a apărut doar în tumoră (somatică) sau este moștenită (germinală).

Cum se face

De obicei nu e nevoie de o recoltare nouă: se folosește blocul de parafină din biopsie sau din operație, păstrat de serviciul de anatomie patologică, împreună cu buletinul histopatologic. Se pot trimite și secțiuni nevopsite din bloc sau ADN extras din tumoră. Proba trebuie să conțină cel puțin 20% celule tumorale; la biopsiile mici, anatomopatologul spune dacă țesutul ajunge. Durata analizei ți-o confirmăm la consultație. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) pe ADN extras din țesutul tumoral, cu îmbogățirea prin hibridizare în soluție a regiunilor codante și a regiunilor intronice învecinate (±8 perechi de baze), la o acoperire medie de aproximativ 1.000x
• Variante raportate: variante punctiforme (de un singur nucleotid, SNV) și mici inserții sau deleții; variante structurale (fuziuni sau translocații) selectate, relevante pentru tratament, evaluate la nivel ADN în genele ALK, BRAF, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, RET și ROS1
• Gene (6)

  • FGFR2
  • IDH1
  • IDH2
  • KRAS
  • PIK3CA
  • TP53
• Probă: țesut tumoral fixat în formol și inclus în parafină (FFPE), cu cel puțin 20% celule tumorale (blocul de parafină este proba recomandată; se pot trimite și cel puțin 10 secțiuni nevopsite de 10 µm, de 5 × 5 mm, sau ADN tumoral peste 200 ng; dacă e posibil, și lame colorate H&E cu zona tumorală marcată)
• Durată: se comunică la consultație

Context clinic

• Tratamentele țintite vizate sunt inhibitorii FGFR (fuziuni FGFR2) și inhibitorii IDH1 (mutații IDH1).
• Ghidul ESMO din 2023 numără printre ținte și BRAF V600E, amplificarea HER2, MSI și fuziunile NTRK, pe care panelul nu le acoperă; pentru ele, profilul genomic mai larg (HT-0226).