Panel de mutații somatice pe țesut tumoral pentru cancer gastric

Pe scurt

Panelul analizează, în ADN-ul extras din tumora gastrică sau a joncțiunii dintre esofag și stomac, 18 gene cu mutații dobândite frecvente, între care ERBB2 (HER2), PIK3CA, KRAS, BRAF, BRCA1, BRCA2 și genele sistemului de reparare a erorilor ADN. Completează testele obișnuite pe proteine, la cererea medicului oncolog.

Ce analizează

Celulele unei tumori acumulează modificări în ADN care nu există în restul corpului. Ele se numesc mutații somatice și nu se moștenesc. Unele pot fi ținte pentru tratament sau pot deschide accesul la un studiu clinic.

Testul citește prin secvențiere de nouă generație (NGS) porțiunile celor 18 gene care conțin instrucțiunile pentru proteine (regiunile codante). Caută schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme) și mici fragmente în plus sau lipsă (inserții sau deleții). Genele acoperă calea RAS/RAF (KRAS, NRAS, BRAF), calea PI3K (PIK3CA, PTEN, AKT1), ERBB2, CTNNB1, SMAD4, TP53, genele de reparare a ADN-ului (BRCA1, BRCA2, ATM, CHEK2) și genele MMR (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2). Verifică și un set de rearanjamente (fuziuni) cu relevanță pentru tratament în genele ALK, BRAF, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, RET și ROS1.

În cancerul gastric avansat, biomarkerii folosiți de rutină pentru alegerea tratamentului sunt HER2, PD-L1 și statusul MMR/MSI, conform ghidului ESMO din 2022. Ei se determină separat, prin analize de rutină ale țesutului, iar acest panel îi completează, fără să-i înlocuiască.

Pentru cine este

• cancer gastric sau al joncțiunii eso-gastrice avansat, când HER2, PD-L1 și statusul MMR sunt deja cunoscute și oncologul vrea un profil de mutații mai larg;
• boală care a progresat după tratamentele standard, când se caută o opțiune țintită sau un studiu clinic;
• tumoră cu deficit al sistemului MMR, când e util să se vadă mutațiile din genele MMR ale tumorii.

Recomandările ESMO din 2024 nu includ cancerul gastric printre tumorile la care secvențierea NGS se face de rutină, așa că testul se alege individual, la consultație, împreună cu medicul oncolog.

Ce poate arăta rezultatul

• Mutații în genele MMR: pot explica o tumoră cu deficit MMR și pot ridica întrebarea sindromului Lynch. O variantă care ar putea fi moștenită se verifică printr-un test genetic din sânge.
• Variante în BRCA1, BRCA2, ATM sau CHEK2: pot fi dobândite sau moștenite. Cele moștenite contează și pentru rude, așa că discutăm la consultație un test din sânge.
• Mutații PIK3CA, KRAS, BRAF sau ERBB2: descriu tumora și pot deschide accesul la studii clinice sau, rar, la un tratament aprobat pentru tumori solide în general.
• Nicio variantă relevantă: tratamentul se alege după biomarkerii pe proteine și după stadiul bolii.
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o variantă despre care nu se știe încă dacă are vreun efect; până se lămurește, nu se folosește pentru decizii medicale.

Ce nu poate detecta

• supraexprimarea sau amplificarea HER2, expresia PD-L1 și statusul MSI, care se determină separat;
• gena CDH1, implicată în cancerul gastric difuz ereditar; dacă în familie sunt mai multe cazuri, la consultație discutăm un test genetic din sânge;
• fuziunile din afara setului analizat, de exemplu cele ale genelor NTRK;
• mutațiile prezente într-o mică parte a tumorii sau într-o probă cu prea puține celule tumorale;
• originea unei variante: testul pe tumoră nu poate spune singur dacă varianta a apărut doar în tumoră (somatică) sau este moștenită (germinală).

Cum se face

De obicei nu e nevoie de o recoltare nouă: se folosește blocul de parafină din biopsia endoscopică sau din operație, păstrat de serviciul de anatomie patologică, împreună cu buletinul histopatologic. Se pot trimite și secțiuni nevopsite din bloc sau ADN extras din tumoră. Proba trebuie să conțină cel puțin 20% celule tumorale. Durata analizei ți-o confirmăm la consultație. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) pe ADN extras din țesutul tumoral, cu îmbogățirea prin hibridizare în soluție a regiunilor codante și a regiunilor intronice învecinate (±8 perechi de baze), la o acoperire medie de aproximativ 1.000x
• Variante raportate: variante punctiforme (de un singur nucleotid, SNV) și mici inserții sau deleții; variante structurale (fuziuni sau translocații) selectate, relevante pentru tratament, evaluate la nivel ADN în genele ALK, BRAF, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, RET și ROS1
• Gene (18)

  • AKT1
  • ATM
  • BRAF
  • BRCA1
  • BRCA2
  • CHEK2
  • CTNNB1
  • ERBB2
  • KRAS
  • MLH1
  • MSH2
  • MSH6
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PMS2
  • PTEN
  • SMAD4
  • TP53
• Probă: țesut tumoral fixat în formol și inclus în parafină (FFPE), cu cel puțin 20% celule tumorale (blocul de parafină este proba recomandată; se pot trimite și cel puțin 10 secțiuni nevopsite de 10 µm, de 5 × 5 mm, sau ADN tumoral peste 200 ng; dacă e posibil, și lame colorate H&E cu zona tumorală marcată)
• Durată: se comunică la consultație

Context clinic

• HER2, PD-L1 și statusul MMR/MSI se determină înaintea panelului, prin imunohistochimie; pentru HER2, la nevoie, și prin FISH, care decide eligibilitatea pentru tratamentul anti-HER2. Panelul îi completează, fără să-i înlocuiască.