Panel de mutații somatice pe țesut tumoral pentru cancer pulmonar

Pe scurt

Panelul caută, în tumora pulmonară, modificările genetice pentru care există terapii țintite: mutații în EGFR, KRAS, BRAF, ERBB2 (HER2) și MET și rearanjamentele genelor ALK, ROS1 și RET. Analizează 19 gene pe țesutul deja recoltat la biopsie sau la operație. Rezultatul ajută medicul oncolog să aleagă între tratamentul țintit, imunoterapie și chimioterapie.

Ce analizează

Multe cancere pulmonare fără celule mici, mai ales adenocarcinoamele, cresc din cauza unei singure modificări dobândite într-o genă „motor”. Modificarea există doar în tumoră și nu se moștenește. Când ea este cunoscută, tumora poate fi tratată cu un medicament care blochează exact acea modificare.

Testul citește prin secvențiere de nouă generație (NGS) porțiunile celor 19 gene care conțin instrucțiunile pentru proteine (regiunile codante). Caută schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme) și mici fragmente în plus sau lipsă (inserții sau deleții). În plus, caută translocațiile ALK, ROS1 și RET, adică situațiile în care o parte a genei s-a lipit de o altă genă, precum și fuziunile selectate din BRAF, FGFR1, FGFR2, FGFR3 și MET.

Pentru cine este

• adenocarcinom pulmonar sau alt cancer pulmonar fără celule mici non-scuamos, avansat sau metastatic, înainte de primul tratament;
• carcinom scuamos la o persoană care nu a fumat sau a fumat puțin;
• cancer pulmonar operat, când medicul oncolog are nevoie de statusul EGFR sau ALK pentru tratamentul de după operație;
• boală care progresează sub un tratament țintit, când se caută mecanismul de rezistență pe o biopsie nouă.

Recomandările ESMO din 2024 includ cancerul pulmonar fără celule mici non-scuamos avansat printre tumorile la care secvențierea NGS a tumorii se face de rutină.

Ce poate arăta rezultatul

• Mutație EGFR, fuziune ALK, ROS1 sau RET: pentru fiecare există tratamente țintite, folosite de obicei încă din prima linie.
• KRAS G12C, BRAF V600E, saltul exonului 14 MET sau mutații ERBB2: există tratamente țintite, unele în prima linie, altele după aceasta.
• Alte mutații (de exemplu TP53, PIK3CA, PTEN): descriu tumora și pot deschide accesul la un studiu clinic, dar de obicei nu au un tratament țintit aprobat.
• Nicio modificare țintibilă: tratamentul se alege de regulă după cât de mult produce tumora proteina PD-L1 (expresia PD-L1) și după tipul tumorii.
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o variantă despre care nu se știe încă dacă are vreun efect; până se lămurește, nu se folosește pentru decizii medicale.

Ce nu poate detecta

• fuziunile genelor NTRK, care sunt și ele ținte pentru tratament;
• amplificările de gene, de exemplu MET sau ERBB2;
• unele fuziuni sau variante de salt al exonului 14 MET, mai ușor de văzut la o analiză pe ARN; absența unei fuziuni nu o exclude complet;
• expresia PD-L1, care se determină separat, prin analize de rutină ale țesutului;
• mutațiile dintr-o probă cu prea puține celule tumorale, situație frecventă la biopsiile bronșice mici.

Cum se face

De obicei nu e nevoie de o recoltare nouă: se folosește blocul de parafină cu țesutul din biopsie sau din operație, păstrat de serviciul de anatomie patologică, împreună cu rezultatul analizei la microscop a țesutului (buletinul histopatologic). Se pot trimite și secțiuni nevopsite din bloc sau ADN extras din tumoră. Proba trebuie să conțină cel puțin 20% celule tumorale. Durata analizei ți-o confirmăm la consultație. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) pe ADN extras din țesutul tumoral, cu îmbogățirea prin hibridizare în soluție a regiunilor codante și a regiunilor intronice învecinate (±8 perechi de baze), la o acoperire medie de aproximativ 1.000x
• Variante raportate: variante punctiforme (de un singur nucleotid, SNV) și mici inserții sau deleții; variante structurale (fuziuni sau translocații) selectate, relevante pentru tratament, evaluate la nivel ADN în genele ALK, BRAF, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, RET și ROS1; translocațiile genelor ALK, RET și ROS1, incluse în setul pentru cancer pulmonar
• Gene (19)

  • AKT1
  • ALK
  • BRAF
  • EGFR
  • ERBB2
  • FBXW7
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • KRAS
  • MAP2K1
  • MET
  • NOTCH1
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PTEN
  • RET
  • ROS1
  • TP53
• Probă: țesut tumoral fixat în formol și inclus în parafină (FFPE), cu cel puțin 20% celule tumorale (blocul de parafină este proba recomandată; se pot trimite și cel puțin 10 secțiuni nevopsite de 10 µm, de 5 × 5 mm, sau ADN tumoral peste 200 ng; dacă e posibil, și lame colorate H&E cu zona tumorală marcată)
• Durată: se comunică la consultație

Context clinic

• Expresia PD-L1 se determină prin imunohistochimie, separat de panel.
• Tratamentele țintite din prima linie pentru EGFR, ALK, ROS1 și RET sunt inhibitorii de tirozin-kinază dedicați fiecărei ținte; în stadiile operate, statusul EGFR și ALK decide tratamentul adjuvant.