Panel de mutații somatice pe țesut tumoral pentru cancer colorectal

Pe scurt

Panelul analizează, în ADN-ul extras din tumora colorectală, 19 gene în care apar frecvent mutații dobândite, între care KRAS, NRAS și BRAF. Rezultatul ajută medicul oncolog să aleagă tratamentul, mai ales terapiile țintite. Se face pe țesutul deja recoltat la biopsie sau la operație.

Ce analizează

Celulele unei tumori acumulează modificări în ADN care nu există în restul corpului. Ele se numesc mutații somatice și nu se moștenesc. Unele țin tumora în creștere, altele arată la ce tratamente răspunde sau nu răspunde.

Testul citește prin secvențiere de nouă generație (NGS) porțiunile celor 19 gene care conțin instrucțiunile pentru proteine (regiunile codante). Caută schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme) și mici fragmente în plus sau lipsă (inserții sau deleții). Pe lângă KRAS, NRAS și BRAF, panelul include gene ale căii PI3K (PIK3CA, PTEN, AKT1), ERBB2 (HER2), EGFR, genele sistemului de reparare a erorilor ADN (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2) și genele POLE și POLD1. În plus, verifică un set de rearanjamente (fuziuni) cu relevanță pentru tratament în genele ALK, BRAF, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, RET și ROS1.

Pentru cine este

• cancer colorectal metastatic, înainte de alegerea primului tratament sistemic;
• cancer colorectal la care medicul oncolog ia în calcul un tratament țintit și are nevoie de statusul RAS și BRAF;
• boală care a progresat sub tratament, când se caută o opțiune țintită sau un studiu clinic;
• tumoră cu deficit al sistemului MMR, când e util să se vadă mutațiile din genele MMR ale tumorii.

Conform ghidului ESMO din 2023, statusul RAS și BRAF V600E se determină la diagnosticul cancerului colorectal metastatic. Recomandările ESMO din 2024 includ cancerul colorectal avansat printre tumorile la care secvențierea NGS a tumorii se face de rutină.

Ce poate arăta rezultatul

• Mutație KRAS sau NRAS: un anumit tratament țintit nu se recomandă, pentru că tumorile cu aceste mutații nu răspund la el. Pentru varianta KRAS G12C există tratamente țintite, folosite după prima linie.
• Mutație BRAF V600E: schimbă prognosticul și poate permite, după prima linie, un tratament țintit.
• Mutații în genele MMR sau POLE: pot explica o tumoră cu foarte multe mutații și pot ridica întrebarea sindromului Lynch. O variantă care ar putea fi moștenită se verifică printr-un test genetic din sânge.
• Nicio mutație în KRAS, NRAS și BRAF: este o informație utilă în sine, pentru că permite, la decizia oncologului, acest tratament țintit.
• Variantă de semnificație incertă (VUS): o variantă despre care nu se știe încă dacă are vreun efect; până se lămurește, nu se folosește pentru decizii medicale.

Ce nu poate detecta

• statusul MMR/MSI, care se determină separat, la diagnosticul bolii metastatice;
• amplificarea genei HER2 și alte modificări ale numărului de copii;
• fuziunile din afara setului analizat, de exemplu cele ale genelor NTRK; nici absența unei fuziuni din set nu o exclude complet;
• mutațiile prezente într-o mică parte a tumorii sau într-o probă cu prea puține celule tumorale;
• originea unei variante: testul pe tumoră nu poate spune singur dacă varianta a apărut doar în tumoră (somatică) sau este moștenită (germinală).

Cum se face

De obicei nu e nevoie de o recoltare nouă: se folosește blocul de parafină cu țesutul din biopsie sau din operație, păstrat de serviciul de anatomie patologică, împreună cu rezultatul analizei la microscop a țesutului (buletinul histopatologic). Se pot trimite și secțiuni nevopsite din bloc sau ADN extras din tumoră. Proba trebuie să conțină cel puțin 20% celule tumorale. Durata analizei ți-o confirmăm la consultație. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) pe ADN extras din țesutul tumoral, cu îmbogățirea prin hibridizare în soluție a regiunilor codante și a regiunilor intronice învecinate (±8 perechi de baze), la o acoperire medie de aproximativ 1.000x
• Variante raportate: variante punctiforme (de un singur nucleotid, SNV) și mici inserții sau deleții; variante structurale (fuziuni sau translocații) selectate, relevante pentru tratament, evaluate la nivel ADN în genele ALK, BRAF, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, RET și ROS1
• Gene (19)

  • AKT1
  • BRAF
  • CTNNB1
  • EGFR
  • ERBB2
  • FBXW7
  • KRAS
  • MLH1
  • MSH2
  • MSH6
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PMS2
  • POLD1
  • POLE
  • PTEN
  • RET
  • SMAD4
  • TP53
• Probă: țesut tumoral fixat în formol și inclus în parafină (FFPE), cu cel puțin 20% celule tumorale (blocul de parafină este proba recomandată; se pot trimite și cel puțin 10 secțiuni nevopsite de 10 µm, de 5 × 5 mm, sau ADN tumoral peste 200 ng; dacă e posibil, și lame colorate H&E cu zona tumorală marcată)
• Durată: se comunică la consultație

Context clinic

• Tratamentul condiționat de statusul RAS sunt anticorpii anti-EGFR: mutațiile KRAS și NRAS îi exclud. Pentru KRAS G12C și BRAF V600E există inhibitori țintiți, folosiți după prima linie.
• Conform ESMO 2023, statusul MMR/MSI se determină la diagnosticul bolii metastatice, prin imunohistochimia proteinelor MMR sau printr-un test MSI; panelul nu îl include, iar testul molecular îl completează.