Analiza mutațiilor somatice TP53 pe țesut tumoral

Pe scurt

Testul caută, în țesutul tumoral, mutațiile din gena TP53, una dintre genele care protejează celula de transformarea în celulă canceroasă. Rezultatul ajută medicul oncolog sau anatomopatolog să încadreze tumora și să estimeze evoluția ei, iar uneori deschide accesul la un studiu clinic. Se alege împreună cu medicul oncolog și cu medicul genetician.

Ce analizează

Gena TP53 conține instrucțiunile pentru proteina p53, care oprește diviziunea unei celule cu ADN deteriorat până când acesta este reparat sau, dacă nu se poate, îi declanșează autodistrugerea. Pentru acest rol, p53 a fost numită „gardianul genomului”. Când gena este mutată, celulele cu ADN deteriorat continuă să se dividă. Conform MedlinePlus, mutațiile somatice TP53 sunt cele mai frecvente modificări genetice din cancer și apar în aproximativ jumătate dintre tumori.

Testul citește prin secvențiere de nouă generație (NGS) gena TP53, din ADN extras din țesutul tumoral, și caută mutațiile somatice, adică pe cele apărute în celulele tumorii.

Pentru cine este

• tumoră solidă la care medicul oncolog sau anatomopatolog are nevoie de statusul TP53 pentru încadrarea moleculară a tumorii;
• tumoră la care statusul TP53 ajută la estimarea evoluției și la planificarea tratamentului;
• analiză de rutină a proteinei p53 în țesut cu rezultat neclar, când e nevoie de confirmarea la nivelul ADN-ului;
• evaluare pentru un studiu clinic care cere statusul TP53.

Ce poate arăta rezultatul

• Mutație TP53. Arată că tumora și-a pierdut unul dintre mecanismele de protecție. Semnificația depinde de tipul de cancer: în unele, o mutație TP53 se asociază cu o evoluție mai nefavorabilă și influențează încadrarea tumorii. Pentru majoritatea variantelor TP53 nu există încă un tratament țintit aprobat; pentru unele există studii clinice.
• Nicio mutație TP53 în regiunea analizată. Proteina p53 poate fi totuși afectată pe alte căi, pe care testul nu le vede.
• Variantă de semnificație incertă (VUS). Nu se știe încă dacă modificarea afectează proteina, deci nu se folosește pentru decizii.

Mutațiile TP53 găsite în tumoră sunt aproape întotdeauna dobândite. Dacă vârsta la diagnostic sau istoricul familial ridică întrebarea sindromului Li-Fraumeni, discutăm la consultație un test din sânge.

Ce nu poate detecta

• dacă o variantă este moștenită: forma moștenită (sindromul Li-Fraumeni) se confirmă printr-un test genetic din sânge;
• alte mecanisme care opresc proteina p53, fără o mutație în genă;
• alte gene și alte ținte de tratament; pentru ele există panelurile pe tipuri de tumoră;
• mutațiile prezente într-o parte mică a celulelor, când proba are puține celule tumorale.

Cum se face

De obicei nu e nevoie de o recoltare nouă: se folosește blocul de parafină din biopsie sau din operație, păstrat de serviciul de anatomie patologică, ori 4–6 secțiuni din el, împreună cu buletinul histopatologic. Se acceptă și sânge sau măduvă osoasă; medicul genetician îți spune ce se trimite. Rezultatul vine, de obicei, în 21 de zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS)
• Variante raportate: mutații somatice în gena TP53
• Gene (1)

  • TP53
• Probă: țesut tumoral fixat în formol și inclus în parafină (bloc FFPE sau 4–6 secțiuni); se acceptă și sânge periferic pe EDTA (cel puțin 3 ml, cel puțin 1 ml la copii) sau măduvă osoasă pe EDTA (cel puțin 1 ml)
• Durată: 21 de zile lucrătoare

Context clinic

• Imunohistochimia p53 precede de obicei testul. Exemplu: în clasificarea moleculară a cancerului endometrial, un aspect p53 neclar la imunohistochimie se poate lămuri prin secvențierea TP53.
• Conform analizei grupului ESMO pentru medicină de precizie (Kuzbari 2023), sub 2% dintre variantele TP53 găsite în tumoră, după filtrele studiului, s-au dovedit germinale.