Analiza metilării MGMT și a mutațiilor IDH1/IDH2 pe țesut tumoral (gliom)

Pe scurt

Testul analizează două caracteristici ale unui gliom, pe țesutul tumoral deja recoltat: dacă celulele tumorii au o mutație în genele IDH1 sau IDH2 și dacă gena MGMT este oprită printr-un semn chimic pus pe zona care o pornește (metilarea promotorului MGMT). Statusul IDH ajută la încadrarea tumorii după clasificarea Organizației Mondiale a Sănătății (OMS), iar statusul MGMT ajută medicul oncolog în decizia despre chimioterapie. Se adresează adulților cu gliom, iar testul se alege împreună cu echipa care tratează boala.

Ce analizează

Genele IDH1 și IDH2 produc enzime ale metabolismului celular. În multe gliome ale adultului, celulele tumorale au o mutație într-un punct fix al uneia dintre ele: codonul 132 al IDH1 sau codonul 172 al IDH2. Testul caută mutațiile frecvente ale celor două gene, în ADN-ul extras din tumoră.

Gena MGMT produce o proteină care repară leziunile făcute în ADN de unele chimioterapii. Promotorul este zona care „pornește” gena. Când promotorul MGMT este metilat, gena tace, iar celulele tumorale repară mai greu leziunile produse de chimioterapie. Testul măsoară dacă promotorul MGMT din tumoră este metilat.

Testul se face prin MS-MLPA (MLPA specific metilării). Ambele modificări aparțin tumorii, nu ADN-ului cu care te-ai născut.

Pentru cine este

• adult cu glioblastom nou diagnosticat, mai ales vârstnic sau fragil, când se discută chimioterapia;
• gliom de grad 2 sau 3 la care diagnosticul integrat are nevoie de statusul IDH;
• diagnostic de gliom stabilit fără analiza moleculară a markerilor IDH și MGMT.

Ce poate arăta rezultatul

• Mutație IDH1 sau IDH2. Conform clasificării OMS din 2021, tumora este un gliom IDH-mutant: astrocitom sau, dacă a pierdut și brațul scurt al cromozomului 1 și brațul lung al cromozomului 19 (codeleția 1p/19q), oligodendrogliom. Codeleția se analizează separat.
• Fără mutație IDH. La un adult cu aspect histologic de glioblastom, rezultatul susține diagnosticul de glioblastom fără mutație IDH (IDH-wildtype). În alte situații, medicul anatomopatolog poate cere analize suplimentare.
• MGMT metilat. Conform ghidului EANO din 2021, în glioblastom chimioterapia standard aduce beneficiu mai ales când promotorul MGMT este metilat. La pacienții vârstnici, rezultatul cântărește în alegerea tratamentului.
• MGMT nemetilat. Beneficiul așteptat de la chimioterapia standard este mai mic. Decizia de tratament rămâne la medicul oncolog și se ia individual, ținând cont de vârstă, de starea generală și de restul analizelor.
• Zonă intermediară. Unele tumori au o metilare parțială, a cărei semnificație pentru tratament nu este încă bine stabilită.

Ce nu poate detecta

• Codeleția 1p/19q, necesară pentru diagnosticul de oligodendrogliom.
• Alte modificări folosite în clasificarea OMS, care se analizează separat.
• Mutațiile IDH1 și IDH2 mai rare, pe care testul nu le acoperă: el caută mutațiile frecvente ale celor două gene.
• Un risc moștenit de cancer: testul privește doar ADN-ul tumorii.
• Rezultatul depinde de cantitatea și calitatea țesutului; o probă cu puține celule tumorale poate da un rezultat neconcludent.

Cum se face

De obicei nu e nevoie de o recoltare nouă: se folosește blocul de parafină din biopsie sau din operație (sau 4–6 secțiuni din el), păstrat de serviciul de anatomie patologică, împreună cu buletinul histopatologic. Se poate trimite și țesut proaspăt. Medicul genetician îți spune ce documente se trimit. Rezultatul vine, de obicei, în 21 de zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: MS-MLPA (MLPA specific metilării)
• Variante raportate: statusul de metilare al promotorului genei MGMT; mutațiile frecvente din genele IDH1 și IDH2
• Gene (3)

  • IDH1
  • IDH2
  • MGMT
• Probă: țesut proaspăt (cel puțin 1 cm²), țesut fixat în formol și inclus în parafină (bloc FFPE sau 4–6 secțiuni) sau sânge periferic pe EDTA (cel puțin 3 ml, cel puțin 1 ml la copii)
• Durată: 21 de zile lucrătoare

Context clinic

• Conform EANO 2021, beneficiul temozolomidei în glioblastom se limitează în mare parte la tumorile cu promotorul MGMT metilat; la vârstnici, statusul MGMT cântărește în alegerea dintre radioterapie, temozolomidă sau combinația lor.
• Alte modificări din clasificarea OMS 2021, neacoperite de test: pierderea ATRX, H3 K27M, H3.3 G34, mutația promotorului TERT, amplificarea EGFR, deleția homozigotă CDKN2A/B.