Predicția neoantigenelor tumorale

Pe scurt

Testul caută în tumoră neoantigenele: fragmente de proteine anormale, apărute din mutațiile tumorii, pe care sistemul imunitar le poate recunoaște. Pe baza lor propune peptidele pentru un vaccin personalizat împotriva cancerului. Același test face și un profil genomic amplu al tumorii, util la alegerea tratamentului. Se discută împreună cu medicul oncolog, la consultația de genetică medicală.

Ce analizează

Celulele arată la suprafață fragmente mici din proteinele lor, iar celulele imunitare le verifică. Mutațiile tumorii pot produce fragmente anormale, numite neoantigene, care o deosebesc de țesutul sănătos. Un vaccin personalizat încearcă să învețe sistemul imunitar să recunoască aceste ținte.

Testul are patru etape:

• citește exomul (regiunile cu instrucțiuni pentru proteine ale aproape tuturor genelor) din tumoră și din țesutul normal, ca să găsească mutațiile apărute doar în tumoră;
• citește ARN-ul tumorii, ca să vadă care mutații sunt exprimate, adică folosite efectiv de celulele tumorale;
• stabilește tipurile HLA, moleculele care prezintă fragmentele de proteine celulelor imunitare;
• prin algoritmi computerizați, prezice neoantigenele și alege până la 12, într-un al doilea raport, cu peptidele propuse pentru vaccin.

Primul raport este un profil genomic al tumorii: variante cu relevanță pentru tratament în 781 de gene, fuziuni de gene, biomarkeri ca TMB, MSI și HRD și variante moștenite relevante clinic.

Pentru cine este

• persoană cu o tumoră solidă, la care medicul oncolog ia în calcul un vaccin personalizat, de obicei într-un studiu clinic;
• persoană cu o tumoră la care se caută, în același timp, ținte de tratament.

Testul este investigațional. Niciun ghid de oncologie (ESMO, NCCN, ASCO) nu are încă o indicație pentru el. Vaccinurile personalizate pe neoantigene se fac doar în studii clinice, care își fac singure secvențierea tumorii, iar un rezultat al acestui test nu îți dă acces la un vaccin. Până în octombrie 2026, niciun astfel de vaccin nu este aprobat de Agenția Europeană a Medicamentului (EMA) sau de FDA; în august 2026, primul studiu de fază 3, la melanomul operat, a fost anunțat pozitiv printr-un comunicat de presă.

Ce poate arăta rezultatul

• Neoantigene candidate: peptidele propuse pentru vaccin și tipurile tale HLA. Este o predicție: nu arată singură că vaccinul va produce un răspuns imun.
• Modificări cu relevanță pentru tratament, legate de medicamente aprobate sau de studii clinice. Decizia de tratament aparține medicului oncolog.
• Biomarkeri ca TMB, MSI sau HRD, folosiți în discuția despre imunoterapie sau despre unele tratamente țintite.
• Variante moștenite cu importanță medicală, găsite în proba normală, în gene selectate de predispoziție la cancer. Contează și pentru rude. Conform ACMG, rezultatul din proba normală ajunge pentru testarea rudelor doar dacă laboratorul a validat această parte ca test germinal; altfel, varianta se confirmă pe o probă nouă. Pașii următori îi discutăm la consultație.
• Variante de semnificație incertă (VUS), care singure nu schimbă tratamentul.

Ce nu poate detecta

• dacă vaccinul va funcționa: testul prezice ce fragmente ar putea recunoaște sistemul imunitar, nu măsoară răspunsul imun;
• rezultatul unei probe cu sub 20% celule tumorale sau de calitate slabă, când analiza poate eșua;
• expresia neoantigenelor în tumora ta, dacă ARN-ul tumoral lipsește: atunci se estimează din baze de date;
• modificările prezente doar în alte zone ale tumorii sau apărute după biopsie;
• un diagnostic complet al predispoziției ereditare: variantele moștenite se raportează doar în gene selectate.

Cum se face

Proba principală este blocul de parafină dintr-o biopsie sau o operație, cu cel puțin 20% celule tumorale, plus o probă mică de sânge (1–2 ml, pe EDTA) pentru ADN-ul normal; după un transplant de celule stem, în locul sângelui se trimite salivă. La consultație te ajută să ai buletinul histopatologic și lista tratamentelor primite. Prețul se stabilește la cerere, iar durata ți-o comunicăm la consultație. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențierea întregului exom din țesutul tumoral și din țesutul normal, pe o îmbogățire de tip exom; secvențierea întregului ARN tumoral (transcriptom, cu îndepărtarea ARN-ului ribozomal); tipizare HLA de clasa I și II; predicție computerizată (in silico) a neoepitopilor din datele de secvențiere și tipizarea HLA, cu selecția a până la 12 neoepitopi pentru HLA de clasa I și II
• Variante raportate: variante somatice (apărute doar în tumoră) cu potențială relevanță terapeutică, evaluate în 781 de gene asociate tumorilor, și fuziuni în 39 de gene; variații ale numărului de copii (CNV); încărcătura mutațională tumorală (TMB), instabilitatea microsateliților (MSI, estimată din datele de secvențiere) și scorul de deficiență a recombinării omoloage (HRD); infecții în tumoră cu HPV, EBV, MCV, CMV, Helicobacter pylori și HBV; expresia genelor în tumoră, din secvențierea transcriptomului, cu modificările relevante de expresie; variante germinale farmacogenetice selectate; variante germinale relevante clinic în gene selectate (cu relevanță terapeutică sau patogene ori probabil patogene), raportate dacă pacientul nu refuză explicit; semne de hematopoieză clonală de potențial nedeterminat (CHIP); tipurile HLA de clasa I și II și până la 12 neoepitopi selectați: peptide scurte (8–12 aminoacizi), pentru HLA de clasa I, și peptide lungi (circa 17 aminoacizi), pentru HLA de clasa II, într-un al doilea raport, pentru formularea unui vaccin
• Probă: țesut tumoral cu cel puțin 20% celule tumorale (bloc FFPE de minimum 5 × 5 × 5 mm, proba recomandată; sau cel puțin 10 secțiuni FFPE nevopsite, ADN tumoral izolat peste 200 ng împreună cu ARN tumoral peste 200 ng, țesut tumoral congelat ori, pentru biopsia lichidă, 3 tuburi de 10 ml pentru ADN liber circulant) și, pentru țesutul normal, sânge pe EDTA 1–2 ml (proba recomandată) sau ADN genomic 1–2 µg; după un transplant de celule stem, în loc de sânge se trimite salivă
• Durată: se comunică la consultație

Context clinic

• Statut: conform Lu și colab. (2025), singurul vaccin terapeutic împotriva cancerului aprobat de FDA era sipuleucel-T, preparat din celulele imune ale pacientului, dar îndreptat împotriva unui antigen comun al cancerului de prostată, nu a neoantigenelor; vaccinurile personalizate pe neoantigene sunt în studii clinice, iar fereastra lor de producție este de 6–16 săptămâni.
• INTerpath-001 (fază 3; melanom rezecat stadiul IIB–IV; intismeran autogene plus pembrolizumab, față de pembrolizumab): conform comunicatului Merck și Moderna din 19.08.2026, obiectivul principal (supraviețuirea fără recidivă) și obiectivul secundar cheie (supraviețuirea fără metastaze la distanță) au fost atinse, fără cifre publicate; datele se prezintă la ESMO 2026, pe 24.10. Niciun vaccin pe neoantigene nu este aprobat de FDA sau EMA, iar studiile își fac singure secvențierea tumorii.
• Variantele germinale din proba normală: conform ACMG (Li și colab., 2020), testarea pereche tumoră–normal nu înlocuiește testarea germinală dedicată decât dacă partea germinală a fost proiectată și validată ca test germinal; altfel, varianta se confirmă pe o a doua probă, independentă.
• Neoepitopii selectați includ peptide scurte (8–12 aminoacizi), pentru HLA de clasa I și limfocitele T CD8+, și peptide lungi (circa 17 aminoacizi), pentru HLA de clasa II și limfocitele T CD4+, ca să activeze ambele tipuri de limfocite T.
• Biopsia lichidă este acceptată ca probă tumorală, dar rezultatul poate să nu fie util dacă ADN-ul tumoral reprezintă sub 20% din ADN-ul liber circulant.