Analiză suplimentară: deficiența recombinării omoloage (la profilul genomic tumoral complet)

Pe scurt

Arată dacă tumora are un defect într-unul dintre mecanismele de reparare a ADN-ului (deficiența recombinării omoloage, HRD). Rezultatul contează la alegerea tratamentului, mai ales în cancerul ovarian.

Ce adaugă

Celulele repară rupturile ADN-ului cu un mecanism numit recombinare omoloagă, la care lucrează genele BRCA1, BRCA2 și altele. Când mecanismul nu funcționează, ADN-ul tumorii acumulează leziuni cu un tipar caracteristic, iar tumora devine mai sensibilă la unele tratamente țintite și la unele chimioterapice.

Analiza calculează statusul HRD din datele deja obținute, fără țesut în plus. În cancerul de sân și ovarian folosește ADN-ul: caută pierderea ambelor copii funcționale ale genelor BRCA1 sau BRCA2 și măsoară cât din genom și-a pierdut diversitatea dintre cele două copii (pierderea heterozigozității). În celelalte cancere folosește tiparul de activitate al genelor, citit din ARN.

Conform ESMO, în cancerul ovarian de grad înalt se recomandă testarea tumorii la diagnostic pentru variantele BRCA1 și BRCA2 și pentru HRD, pentru alegerea tratamentului de întreținere, cel care urmează după chimioterapie. În alte cancere, semnificația rezultatului o discută medicul oncolog.

Când se alege

• Cancer ovarian, de trompă uterină sau peritoneal de grad înalt, la diagnostic sau la recidivă.
• Alt cancer avansat, când medicul oncolog vrea statusul HRD pentru alegerea tratamentului sau a unui studiu clinic.

Pentru medici

• Versiunea ADN (sân și ovar): HRD pozitiv înseamnă alterări bialelice cu pierderea funcției în BRCA1 sau BRCA2 și/sau pierderea heterozigozității la nivelul genomului (GWLOH) peste prag: ≥21% în cancerul de sân, ≥17% în cel ovarian; necesită secvențierea tumoră–normal.
• Versiunea ARN (celelalte tipuri de cancer): scor HRD calculat din expresia a circa 20.000 de gene, pozitiv peste 50; alterările bialelice BRCA1/2 nu influențează scorul ARN.
• Raportul listează alterările din genele căii de recombinare omoloagă: ATM, ATR, ATRX, BAP1, BARD1, BLM, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDK12, CHEK1, CHEK2, FANCA, FANCL, HDAC2, MRE11, NBN, PALB2, RAD50, RAD51B, RAD51C, RAD51D, RAD54L.
• Context: statusul HRD se folosește la alegerea inhibitorilor PARP în tratamentul de întreținere al cancerului ovarian.
• Probă: fără țesut suplimentar; sânge pentru ADN-ul normal, din testul de bază.
• Durată: 14 zile lucrătoare.