Analiza expansiunii de repetiții în gena FGF14 (SCA27B) sau RFC1 (CANVAS)

Pe scurt

Testul caută una dintre două secvențe scurte de ADN repetate de prea multe ori (expansiuni de repetiții), recunoscute în ultimii ani drept cauze frecvente de ataxie, adică de pierdere a coordonării, cu debut la vârsta adultă: expansiunea GAA din gena FGF14, care cauzează ataxia spinocerebeloasă tip 27B (SCA27B), sau expansiunea AAGGG din gena RFC1, care cauzează sindromul CANVAS. Se adresează adulților cu ataxie fără o cauză găsită, inclusiv după un panel sau un exom negativ. Gena analizată se alege la consultația de genetică medicală, după simptome.

Ce analizează

Ataxia înseamnă pierderea coordonării: mersul devine nesigur, echilibrul se pierde ușor, iar vorbirea și mișcările mâinilor devin mai puțin precise. Unele ataxii ereditare apar când o secvență scurtă de ADN, de trei sau cinci „litere”, se repetă de mult mai multe ori decât de obicei.

În ambele gene, repetițiile se află într-o zonă care nu codifică proteina (un intron). Expansiunile din aceste gene au o structură complexă, pe care secvențierea obișnuită (panelurile și exomul) nu o poate detecta, de aceea au nevoie de o analiză dedicată. Testul folosește metode bazate pe PCR.

• FGF14 (SCA27B): se repetă secvența GAA, iar ataxia apare când repetiția depășește un anumit prag. Transmiterea este autozomal dominantă: o singură copie modificată a genei este suficientă.
• RFC1 (CANVAS): se repetă secvența AAGGG. Boala apare când expansiunea este prezentă pe ambele copii ale genei, una de la fiecare părinte (transmitere autozomal recesivă).

Pentru cine este

• adult la care mersul a devenit nesigur treptat, cu o evoluție lentă, fără o cauză găsită la investigațiile obișnuite;
• ataxie care a început cu episoade de amețeală, vertij sau dezechilibru, uneori cu mișcări involuntare ale ochilor (nistagmus);
• ataxie însoțită de amorțeli sau de pierderea sensibilității la picioare, de un dezechilibru mai accentuat pe întuneric și, uneori, de o tuse seacă veche de ani de zile;
• persoană cu ataxie la care un panel de gene sau un exom nu au găsit cauza.

Ce poate arăta rezultatul

Expansiune în FGF14. Confirmă SCA27B. Fiecare copil al unei persoane cu expansiunea are o șansă de 50% s-o moștenească. Pentru manifestările bolii există un tratament țintit, pe care îl discuți cu medicul neurolog.

Expansiuni pe ambele copii ale RFC1. Confirmă boala legată de RFC1 (CANVAS sau o formă înrudită). Frații și surorile pot avea aceeași combinație, iar copiii sunt de obicei purtători sănătoși.

Rezultat la limită. Unele expansiuni au o mărime sau o structură de semnificație incertă. Le interpretăm la consultație, împreună cu examinarea neurologică.

Negativ. Expansiunea căutată nu este prezentă. Rămân posibile alte cauze genetice sau dobândite ale ataxiei, iar pasul următor îl stabilim împreună, la consultație.

Ce nu poate detecta

• expansiunea din cealaltă genă, dacă testul s-a făcut pentru o singură genă;
• alte expansiuni care cauzează ataxie, de exemplu în ataxiile spinocerebeloase sau în ataxia Friedreich;
• schimbările unei singure „litere” (variantele punctiforme) și porțiunile lipsă (delețiile) din FGF14, RFC1 sau alte gene, care se caută prin secvențiere;
• cauzele dobândite ale ataxiei.

Cum se face

Proba este de sânge venos, recoltat pe EDTA într-un centru partener. Pentru RFC1 se poate folosi doar sânge pe EDTA sau ADN extras din acesta. Durata analizei ți-o confirmăm la consultație. Prețul include consultația de genetică medicală dinainte de test, interpretarea rezultatului și consultația de după.

Pentru medici

• Metodă: analiză dedicată a expansiunii, separată de secvențiere: pentru FGF14, PCR pe fragmente lungi (long-range PCR), electroforeză capilară și în gel de agaroză, cu confirmare prin PCR cu primeri pentru repetiții (repeat-primed PCR); pentru RFC1, un protocol bazat pe PCR; se poate comanda separat sau ca etapă a panelului pentru boli neurodegenerative
• Variante raportate: expansiunile patogene de repetiții din gena FGF14 (SCA27B); expansiunile patogene AAGGG din gena RFC1 prezente pe ambele copii ale genei (homozigote)
• Probă: sânge recoltat pe EDTA sau ADN extras din sânge pe EDTA (pentru RFC1, singurele probe posibile)
• Durată: se comunică la consultație

Context clinic

• Pragul de 250 de repetiții GAA pentru SCA27B vine din studiul care a descris boala (Pellerin 2023). Expansiunile de imediat peste prag se interpretează la consultație, împreună cu tabloul clinic.
• Conform GeneReviews, manifestările SCA27B pot răspunde la 4-aminopiridină.
• Alte expansiuni din diagnosticul diferențial al ataxiei cu debut la adult: SCA1, SCA2, SCA3, SCA6, ataxia Friedreich și premutația FMR1 (FXTAS).