Panel genetic pentru ataxii ereditare, 441 de gene

Pe scurt

Panelul analizează 441 de gene asociate cu ataxiile ereditare, de la formele care apar în copilărie până la cele cu debut la vârsta adultă. Se adresează persoanelor cu ataxie care se agravează în timp sau care există de la naștere (congenitală), fără o cauză găsită, de obicei după ce testele pentru cele mai frecvente forme au ieșit negative. Medicul genetician stabilește la consultație dacă testul ți se potrivește.

Ce analizează

Ataxia înseamnă pierderea coordonării mișcărilor, de obicei din cauza unei suferințe a cerebelului sau a căilor nervoase care îi trimit informații. Ataxiile ereditare sunt foarte variate: unele se transmit dominant, altele recesiv sau legat de cromozomul X, unele apar din copilărie, altele după 50 de ani.

Testul citește prin secvențiere de nouă generație (NGS) genele de pe listă și caută schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme) și mici fragmente lipsă sau în plus (deleții sau inserții mici). Include și o căutare a fragmentelor de ADN lipsă sau în plus (deleții și duplicații, CNV) și analiza genelor din ADN-ul mitocondrial. Lista cuprinde gene ale ataxiilor recesive (de exemplu ATM, SACS, APTX, SETX, SPG7), ale ataxiilor dominante cauzate de variante punctiforme (CACNA1A, AFG3L2, ITPR1, KCNC3), ale ataxiilor episodice (KCNA1), ale malformațiilor cerebelului (AHI1, CEP290), ale bolilor mitocondriale (POLG, TWNK) și ale unor boli metabolice care pot fi tratate, cum este xantomatoza cerebrotendinoasă (CYP27A1).

Pentru cine este

• adult sau copil cu ataxie care se agravează în timp, la care testele pentru secvențele repetate de prea multe ori (expansiunile de repetiții) nu au găsit cauza;
• copil cu ataxie prezentă din primii ani sau cu întârziere motorie și cerebel modificat pe RMN;
• persoană cu ataxie ai cărei frați au aceeași boală, iar părinții sunt sănătoși;
• persoană cu ataxie și alte semne: afectarea nervilor periferici (neuropatie), mușchi rigizi (spasticitate), mișcări anormale ale ochilor, tulburări de vedere sau de auz.

Ce poate arăta rezultatul

Pozitiv: s-a găsit cauza genetică, ceea ce clarifică evoluția, riscul pentru rude și, uneori, tratamentul. De exemplu, xantomatoza cerebrotendinoasă are un tratament țintit.

Negativ: nu s-a găsit o cauză în cele 441 de gene. Rezultatul nu exclude o cauză genetică, mai ales una legată de o secvență repetată de prea multe ori (expansiune de repetiții), care se caută printr-un test țintit, dacă nu s-a făcut deja. Dacă și testele țintite sunt negative, pasul următor îl stabilim împreună, la consultație.

Incert (VUS): cu cât un panel are mai multe gene, cu atât e mai probabil să apară variante despre care nu se știe încă dacă au vreun efect (variante de semnificație incertă). Ele nu se folosesc pentru decizii medicale; testarea părinților și a rudelor ajută adesea la interpretare.

Ce nu poate detecta

Ca metodă, secvențierea unui panel nu este gândită pentru secvențele repetate de prea multe ori (expansiunile de repetiții), care cauzează multe ataxii ereditare și se caută prin teste separate:

• expansiunile din ataxiile spinocerebeloase dominante SCA1, SCA2, SCA3, SCA6, SCA7 și SCA17;
• expansiunea GAA din gena FXN: conform GeneReviews, aproximativ 96% dintre persoanele cu ataxie Friedreich o au pe ambele copii ale genei, iar panelul poate găsi doar restul variantelor;
• expansiunea din gena RFC1, care cauzează sindromul CANVAS, și expansiunea GAA din FGF14 (SCA27B).

Nu vede nici cauzele dobândite ale ataxiei, de exemplu alcoolul, deficitele de vitamine sau bolile autoimune.

Cum se face

Proba este de sânge venos, cel puțin 3 ml, recoltat la un centru partener într-un tub cu anticoagulant (EDTA); se acceptă și ADN extras, un frotiu bucal (de pe interiorul obrazului) sau salivă. Rezultatul vine, de obicei, în 32 de zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS), cu screening CNV și analiza ADN-ului mitocondrial
• Variante raportate: variante punctiforme (SNV); mici inserții și deleții (indeli); variații ale numărului de copii (CNV), prin screening; variante ale ADN-ului mitocondrial
• Gene (441): caută în lista genelor
• Probă: sânge periferic recoltat pe EDTA, cel puțin 3 ml (cel puțin 1 ml la copii); se acceptă și ADN extras (cel puțin 20 µl, la 50 ng/µl), frotiu bucal sau salivă (după instrucțiunile kitului)
• Durată: 32 de zile lucrătoare

Context clinic

• Conform GeneReviews, în xantomatoza cerebrotendinoasă tratamentul de lungă durată cu acid chenodeoxicolic normalizează colestanolul și ameliorează rezultatele testelor neurofiziologice.