Panel genetic pentru neurodegenerarea cu acumulare cerebrală de fier (NBIA)

Pe scurt

Panelul analizează 15 gene asociate cu neurodegenerarea cu acumulare cerebrală de fier (NBIA), un grup de boli ereditare rare în care fierul se depune anormal în zonele profunde ale creierului care controlează mișcarea. Se adresează copiilor și adulților cu tulburări de mișcare care se agravează în timp, mai ales când RMN-ul cerebral arată depozite de fier. Medicul genetician stabilește la consultație dacă testul ți se potrivește; când RMN-ul nu arată fier, discutăm de obicei secvențierea întregului genom (WGS).

Ce analizează

Ganglionii bazali sunt grupuri de neuroni din profunzimea creierului care ajută la pornirea și controlul mișcărilor. În bolile din grupul NBIA, fierul se adună mai ales în anumite zone adânci ale creierului (globus pallidus și substanța neagră), iar neuronii se degradează treptat. Modificările se văd pe secvențele RMN sensibile la fier, iar unele forme au un aspect caracteristic, cum este semnul „ochiului de tigru” din PKAN.

Testul citește prin secvențiere de nouă generație (NGS) porțiunile celor 15 gene care conțin instrucțiunile pentru proteine (regiunile codante), marginile lor și variantele din porțiunile dintre exoni cunoscute ca patogene (variante intronice). Caută schimbări ale unei singure „litere” din ADN (variante punctiforme), mici fragmente lipsă sau în plus (deleții sau inserții mici) și, din aceleași date, porțiuni lipsă sau în plus de unul sau mai mulți exoni (deleții și duplicații). Panelul cuprinde genele principalelor forme de NBIA: PANK2 (PKAN), PLA2G6 (PLAN), C19orf12 (MPAN), WDR45 (BPAN), FTL (neuroferitinopatia), CP (aceruloplasminemia), COASY, FA2H și ATP13A2. Include și gene ale unor boli care pot semăna cu NBIA.

Pentru cine este

• copil cu tulburări de mers, distonie (contracții musculare involuntare care produc posturi anormale) sau rigiditate care se agravează în timp;
• copil care, după o perioadă de dezvoltare normală sau lentă, pierde abilități câștigate;
• adolescent sau adult tânăr cu parkinsonism, distonie sau schimbări psihiatrice apărute devreme, fără o cauză găsită;
• persoană la care RMN-ul cerebral a arătat depozite de fier în ganglionii bazali sau semnul „ochiului de tigru”.

Ce poate arăta rezultatul

Pozitiv: s-a găsit cauza genetică, iar rezultatul arată despre ce formă de NBIA este vorba. Forma contează pentru evoluție, pentru controalele recomandate și pentru familie, fiindcă modul de transmitere diferă: PKAN și PLAN sunt recesive (boala apare când ambele copii ale genei sunt modificate), BPAN este legată de cromozomul X, iar neuroferitinopatia este dominantă. Tratamentul urmărește în principal ameliorarea simptomelor (tratament simptomatic) și este adaptat formei genetice. Unele dintre bolile care pot semăna cu NBIA au un tratament specific, care contează să înceapă cât mai devreme.

Negativ: nu s-a găsit o cauză în cele 15 gene. Rezultatul nu exclude o cauză genetică: dacă suspiciunea rămâne, pasul următor pe care îl discutăm de obicei la consultație este secvențierea întregului genom (WGS).

Incert (VUS): s-a găsit o variantă despre care nu se știe încă dacă poate cauza boala (variantă de semnificație incertă). Nu se folosește pentru decizii medicale; testarea părinților ajută adesea la interpretare, iar varianta poate fi reclasificată în timp.

Ce nu poate detecta

• variantele din gene care nu fac parte din panel, inclusiv din gene descoperite după alcătuirea lui;
• secvențele repetate de prea multe ori (expansiunile de repetiții) și fragmentele de cromozom care și-au schimbat locul fără material genetic lipsă sau în plus (rearanjamentele cromozomiale echilibrate);
• uneori, o porțiune lipsă de un singur exon (deleție);
• cantitatea de fier din creier: testul nu înlocuiește RMN-ul și consultația neurologică.

Cum se face

Proba este de sânge venos, recoltată într-un centru partener; se acceptă și ADN extras, câteva picături de sânge uscate pe un card, un frotiu bucal (de pe interiorul obrazului) sau salivă. Rezultatul vine, de obicei, în 15–20 de zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: secvențiere de nouă generație (NGS) pe o îmbogățire de tip exom (hibridizare în soluție), care acoperă toate regiunile codante, regiunile intronice adiacente și variantele intronice și intergenice descrise ca relevante pentru boală; se analizează genele panelului
• Variante raportate: variante punctiforme (de un singur nucleotid) și mici inserții sau deleții; deleții și duplicații de unul sau mai mulți exoni (CNV), confirmate prin MLPA sau qPCR înainte de raportare; variante intronice cunoscute ca patogene; variante din ADN-ul mitocondrial cunoscute ca asociate cu boala căutată; mozaicism, în unele cazuri
• Gene (15)

  • AP1S2
  • ATP13A2
  • ATP7B
  • C19orf12
  • COASY
  • CP
  • DCAF17
  • FA2H
  • FTH1
  • FTL
  • PANK2
  • PLA2G6
  • SLC30A10
  • SLC39A14
  • WDR45
• Probă: sânge recoltat pe EDTA, 1–2 ml (proba recomandată); se pot folosi și ADN genomic (1–2 µg), card cu picături de sânge uscat, frotiu bucal sau salivă
• Durată: 15–20 de zile lucrătoare

Context clinic

• Conform GeneReviews, fierul poate deveni vizibil pe RMN abia mai târziu în evoluție, iar când imagistica nu sugerează NBIA se preferă exomul sau genomul. În practica noastră, în această situație se alege de obicei genomul (WGS); panelul rămâne pentru tabloul clinic orientat spre NBIA.
• Diagnostic diferențial acoperit de panel: ATP7B (boala Wilson; conform GeneReviews, tratamentul care leagă și elimină cuprul se începe cât mai devreme) și transportorii de mangan SLC30A10 și SLC39A14.