Detecția prin FISH a rearanjamentelor RPN1/MECOM (inv(3)/t(3;3))

Pe scurt

Testul caută, printr-o analiză la microscop cu sonde fluorescente (FISH), două modificări ale cromozomului 3 care activează anormal gena MECOM: un fragment lipit la loc în poziție inversă (inversiunea inv(3)) și un schimb de fragmente între cele două copii ale cromozomului 3 (translocația t(3;3)). Se face de obicei din măduva osoasă, dar se poate face și din sânge, la persoanele cu leucemie acută mieloidă sau cu sindrom mielodisplazic (o boală în care măduva produce celule de sânge care nu se maturizează corect). Rezultatul contează pentru încadrarea bolii și pentru estimarea riscului, pe care medicul hematolog le folosește la alegerea tratamentului.

Ce analizează

Testul folosește fragmente scurte de ADN marcate cu o culoare fluorescentă (sonde), care se lipesc de o regiune precisă a unui cromozom; metoda se numește hibridizare fluorescentă in situ (FISH). La microscop, fiecare regiune marcată apare ca un punct colorat, iar specialistul urmărește aceste puncte în multe celule, una câte una.

În inv(3), un fragment al cromozomului 3 se rupe și se lipește la loc în poziție inversă; în t(3;3), cele două copii ale cromozomului 3 își schimbă între ele câte un fragment. În ambele cazuri, o regiune care pornește puternic genele, aflată lângă gena GATA2, în zona 3q21, ajunge lângă gena MECOM, din zona 3q26. MECOM devine foarte activă și blochează maturarea celulelor din măduvă. Testul arată dacă regiunile genelor RPN1 (3q21) și MECOM (3q26) au fost rearanjate printr-o inversiune sau o translocație.

Pentru cine este

• leucemie acută mieloidă nou diagnosticată, pentru încadrarea bolii după modificările ei genetice;
• sindrom mielodisplazic, pentru încadrarea bolii și evaluarea riscului;
• cariotip din măduvă nereușit sau neclar;
• o modificare a cromozomului 3 văzută pe cariotip, care trebuie confirmată.

Ce poate arăta rezultatul

• Inv(3) sau t(3;3) prezentă. Conform clasificării riscului genetic European LeukemiaNet (ELN) din 2022, leucemia acută mieloidă cu inv(3) sau t(3;3) (GATA2, MECOM) se încadrează la risc advers (nefavorabil). Conform clasificării Organizației Mondiale a Sănătății din 2022, diagnosticul de leucemie acută mieloidă cu rearanjament MECOM se poate pune chiar dacă celulele tinere (blaștii) sunt sub 20%. Medicul hematolog folosește rezultatul, împreună cu celelalte analize, la planificarea tratamentului.
• Modificare absentă. Nu apare o inversiune sau o translocație RPN1/MECOM în celulele analizate. Boala poate avea alte modificări genetice, care se caută prin cariotip și prin alte teste.
• Rezultat atipic. Uneori apar copii în plus ale regiunilor sau un tipar neobișnuit al semnalelor. La consultație îți explicăm ce înseamnă și dacă e nevoie de un test complementar.

Ce nu poate detecta

• unele rearanjamente ale genei MECOM cu alți cromozomi decât 3q21, în funcție de tipul sondei;
• alte modificări ale cromozomilor, de exemplu pierderile de 5q sau 7q, care au teste separate;
• schimbările din interiorul genelor (mutațiile), care se caută prin secvențiere;
• unele modificări relevante, care pot rămâne neidentificate din cauza limitelor actuale ale tehnologiei sau ale cunoștințelor medicale; uneori, rezultatul nu este concludent;
• riscul moștenit de cancer: testul privește celulele bolii, nu ADN-ul cu care te-ai născut.

Cum se face

Proba poate fi măduvă osoasă extrasă cu un ac (aspirat de măduvă, cel puțin 1 ml), recoltată de medicul hematolog, de obicei odată cu puncția făcută pentru diagnostic, sau sânge din venă (sânge periferic, cel puțin 3 ml), ambele pe heparină de litiu. Se pot folosi și lame citogenetice necolorate, o suspensie de celule fixate sau țesut fixat în parafină (bloc sau 4–6 secțiuni). Medicul genetician îți cere înainte rezultatele analizelor făcute până atunci, de exemplu buletinul de analize al măduvei și cariotipul, dacă există. Rezultatul vine, de obicei, în 9 zile lucrătoare de la primirea probei în laborator. Consultațiile de genetică medicală dinainte și de după test și interpretarea rezultatului sunt incluse în preț.

Pentru medici

• Metodă: hibridizare fluorescentă in situ (FISH)
• Variante raportate: inversiunile sau translocațiile cromozomului 3 care implică genele RPN1 și MECOM (inv/t(3))
• Probă: sânge periferic recoltat pe heparină de litiu (cel puțin 3 ml), măduvă osoasă recoltată pe heparină de litiu (cel puțin 1 ml), suspensie de celule fixate (un tub pentru fiecare cultură), lame citogenetice necolorate (2 lame pentru fiecare sondă) sau țesut fixat în formol și inclus în parafină (FFPE; bloc sau 4–6 secțiuni)
• Durată: 9 zile lucrătoare